Cell：解锁人类早期胚胎发育之谜
该研究首次揭示了人类早期胚胎中的染色体三维结构的动态变化，并发现 CTCF 蛋白对于早期胚胎发育中拓扑相关结构域（TAD 结构）有着重要的调控功能，为进一步揭示人类胚胎发育机制提供了理论基础。
中国科学报 - 胚胎 - 2019-12-06
Nature biotechnology：新发现染色质绝缘子或可用于人类基因治疗
插入突变和遗传毒性通常代表造血系统肿瘤的恶化，同时也是实现基因治疗前景所面临的最大障碍。George Stamatoyannopoulos等人研究出一种能够识别作为绝缘子发挥功能的紧凑序列元件的方法，或对实现基因
生物谷 - 染色质，基因治疗 - 2015-02-02
Cell： DNA断裂与大脑学习及老化相关
来自MIT的研究者们发现，神经元活性可以快速大量激活一些早期反应基因，从而促进大脑的学习和记忆。DNA双链断裂的形成，是一种生理活动，可以快速解除拓扑蛋白对早期反应基因的抑制，从而在神经元中表达这些早期反应基因。这项研究结果，有助于研究人员们研发出新的方法，防治认知下降疾病，例如老年痴呆症。此项研究于近日发表在Cell杂志上。 在此研究之前，研究人员们在小鼠老年痴呆模型上发现，甚至是在疾
生物谷 - DNA，大脑学习 - 2015-06-09
Cell丨专家解读“转录延伸如何影响三维基因组结构”
真核生物的DNA复制、DNA损伤修复、基因转录等重要生物功能都在细胞核的三维空间中完成，基因组的三维结构对这些生物功能有显着的影响。目前研究基因组三维结构的高通量方法包括Hi-C (High-throughput Chromosome Conformation Capture)和ChIA-PET (Chromatin Interaction Analysis with Paired-End T
BioArt - 专家解读，转录延伸，三维基因组结构 - 2018-08-30
Oncotarget：陆东东课题组发现miR372促进组蛋白去甲基化酶JMJD2A产生的剪接体JMJD2AΔ激活肝癌细胞中癌蛋白Pim1的活性
组蛋白的甲基化修饰调控了染色质的结构，所以在大多数癌症发生过程中显示组蛋白甲基化的异常改变，这与组蛋白甲基化转移酶和去甲基化酶的功能失调密切相关。最近陆东东教授课题组发现组蛋白去甲基化酶JMJD2A通过表观遗传学机制在转录水平上促进了miR372先体的产生，并进一步导致了前体miR372的成熟。进一步研究显示，过量的 miR372能抑制JMJD2A第13外显子右翼和第14外显子左翼特异区域的DNA
同济大学生命科学与技术学院 - 组蛋白，去甲基化，剪接体 - 2017-04-21
Nature子刊：谭济民/夏波等开发基因组构象预测模型C.Origami及高通量计算遗传筛选新方法
未来的基因组学研究将更多的转向使用利用深度学习模型作为工具来进行主要计算遗传筛选，并辅以生物实验验证的新一代高通量研究方法。
生物世界 - C.Origami，基因组构象 - 2023-01-11
Nature：基因组错误折叠或提供新的癌症研究思路
近日，发表在Nature杂志上的一篇研究论文中，来自麻省总医院和博德研究所的科学家揭示了隐藏在癌症背后的一种新型生物学机制，文章中，通过对携带异柠檬酸脱氢酶基因（IDH）突变的脑瘤进行研究，研究者揭开了指导基因组自身折叠指令的罕见改变，这些指令改变可以靶向作用基因组的关键部分—绝缘子，绝缘子可以抑制某个区域的基因同控制开关及附近区域的特殊基因发生相互作用，当这些绝缘子在IDH突变的肿瘤中“胡作非为
生物谷 - 转化医学 - 2015-12-28
【盘点】Circulation 10月原始研究第四期汇总
【1】中国城市空气污染控制的潜在心血管和死亡率获益DOI：10.1161/CIRCULATIONAHA.116.026487室外空气污染在中国疾病负担可预防病因中排第四位。研究人员假设，中国城市空气质量改善带来的健康获益的幅度可以与达到推荐的血压或控烟目标相比较。结果表明不同程度的空气质量改善会产生241,000生命年甚至更多的健康获益，其相当于甚至大于收缩压控制改善25％和吸烟减少30％的综合收
MedSci原创 - 2017-10-24
CELL：颠覆传统观念，染色质拓扑变化可抑制结直肠癌的恶性进展
最近，研究人员在CELL杂志发文，将结肠肿瘤和正常结肠的拓扑图与表观遗传学、转录和成像数据整合在一起，以表征染色质环、拓扑相关域和大规模隔室的改变。
MedSci原创 - 结直肠癌，拓扑学 - 2020-08-25
Science Advances：研究证实cfDNA中含有肿瘤特异性TF结合信息，可利用血浆绘制肿瘤调控图谱
来自美国科罗拉多大学的研究团队绘制了血浆cfDNA中单个结合位点的TF结合图谱，定义了反映不同ER+疾病状态的cfDNA特征。
测序中国 - 肿瘤，转录因子，cfDNA - 2022-09-10
NATURE：我国科学家在猴子中发现长寿基因功能
已有的研究显示，SIRT6在啮齿动物中起到长寿蛋白的作用。 然而，至今为止，SIRT6在灵长类动物中的生物学功能仍然是未知。
MedSci原创 - 长寿基因 - 2018-08-25
PNAS：原钙粘蛋白家族在抑郁症发病中起关键作用
最新一期的世界顶级学术期刊《美国国家科学院(PNAS)》发布了上海交大研究团队一项重要成果。上海交大系统生物医学研究院教授吴强的科研团队发现一种特殊蛋白质调控机理，阐明了原钙粘蛋白家族在大脑中细胞特异性表达的分子机制。这一研究成果对科学家破解人类基因组的编码调控机制，以及破解精神疾病发病机理将产生深远影响。 上海交大系统生物医学研究院教授吴强5日介绍，人脑含有上千亿个不同的神经细胞，每个
PNAS - 抑郁症，发病机制，上海，钙粘蛋白，上海交通大学 - 2012-12-06
Science：中美科学家揭示大脑发育机制
上海交通大学系统生物医学研究院吴强教授与美国哥伦比亚大学教授、分子生物学先驱 Tom Maniatis 研究团队合作，发现原钙粘蛋白基因簇表达的一个特定异构体决定 5 - 羟色胺神经环路的组装和轴突空间规则排列（axonal tiling and even spacing），这一研究成果于 2017 年 4 月 28 日以长篇研究论文形式发表于美国科学促进会会刊《Science》上。先前的研究发现
Science - axonal，tiling，and，even，spacing - 2017-06-23
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