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PLoS ONE：<font color="red">转录</font><font color="red">组</font>断层<font color="red">技术</font>可对脑部疾病的基因表达进行三维成像

PLoS ONE：转录组断层技术可对脑部疾病的基因表达进行三维成像

近日，来自日本一个研究小组开发出了一种新型技术，可以对大脑结构中的基因表达样式进行三维成像，这种技术俗称为转录组断层技术，其结合了组织切片的微阵列技术，可以都对脑部基因表达的密度和位置进行精确图谱成像，相比当前的绘图成像技术，这种新型技术具有较高的分辨率，相关研究成果发表于国际杂志PLoS ONE上。

生物谷 - 研究 - 2013-01-14

Genome Res：变分图卷积自编码器框架——PAST，可融合外部参考数据进行<font color="red">空间</font><font color="red">转录</font><font color="red">组</font>数据降维分析

Genome Res：变分图卷积自编码器框架——PAST，可融合外部参考数据进行空间转录组数据降维分析

该模型不仅可以有效提取空间转录组数据的低维表示特征，辨识空间功能区域（Spatial Domains），还能够促进数据可视化、发育轨迹推断和伪时序分析等多种下游任务。

测序中国 - 空间转录组 - 2023-11-09

NBT：上海交通大学杨朝勇/吴玲玲/宋佳/郑军华开发新的方法，实现高灵敏<font color="red">空间</font><font color="red">转录</font><font color="red">组</font>学测序

NBT：上海交通大学杨朝勇/吴玲玲/宋佳/郑军华开发新的方法，实现高灵敏空间转录组学测序

该研究报道了一种用于空间RNA测序(Decoder-seq)的树状细胞DNA坐标条形码设计，该设计具有高灵敏度和高分辨率。

iNature - 测序，空间转录组学 - 2024-01-18

<font color="red">空间</font>蛋白<font color="red">组</font><font color="red">技术</font>在疾病研究中的应用及多重组化染色成功经验分享

空间蛋白组技术在疾病研究中的应用及多重组化染色成功经验分享

2020年8月26日，北京时间3:00pm-4:00pm

MedSci原创 - 空间蛋白组技术，多重组化染色 - 2020-08-13

ceRNA：从全新的视角研究<font color="red">转录</font><font color="red">组</font>

ceRNA：从全新的视角研究转录组

当我们谈到基因表达，自然离不开microRNA（miRNA）。这一类小小的非编码RNA通过与mRNA目标结合，抑制其翻译成蛋白质，从而在胚胎发育、细胞分化以及器官形成等过程中发挥重要作用。然而，事情并非如此简单。单个mRNA可能受到多个miRNA的调控，而单个miRNA能够调控多个mRNA。mRNA与miRNA之间的串扰（crosstalk）是如此复杂，又如此迷人，引无数学者竞折腰。 miR

生物通 - ceRNA，转录 - 2016-09-18

Nat Methods：谢晓亮课题<font color="red">组</font>开发单细胞联合三维基因<font color="red">组</font>和<font color="red">转录</font><font color="red">组</font>测序<font color="red">技术</font>解析嗅觉受体选择机制

Nat Methods：谢晓亮课题组开发单细胞联合三维基因组和转录组测序技术解析嗅觉受体选择机制

该工作为理解嗅觉受体增强子与嗅觉受体基因的空间互作如何动态协调“一个神经元，一个受体”选择过程提供了宝贵见解。

测序中国 - 嗅觉受体，三维基因组 - 2024-04-23

Circulation：单细胞<font color="red">转录</font><font color="red">组</font>学揭示不同器官内皮细胞的<font color="red">转录</font>特征

Circulation：单细胞转录组学揭示不同器官内皮细胞的转录特征

虽然这些功能上的差异可能被记录在转录组中，但维持EC异质性的通路和网络尚未完全明确。

MedSci原创 - 内皮细胞，转录组，单细胞RNA测序 - 2020-09-19

Genome Biol综述 | 多模态和单细胞/亚细胞水平<font color="red">空间</font><font color="red">组</font>学<font color="red">技术</font>的现状及发展前景

Genome Biol综述 | 多模态和单细胞/亚细胞水平空间组学技术的现状及发展前景

空间组学领域在过去几年蓬勃发展，并从根本上提高了原位实验的广度和分辨率。这些技术现在可以在50-100nm的空间分辨率下检测超过10,000个独特的基因靶点。

测序中国 - 多模态和单细胞，亚细胞水平空间组学技术，空间组学实验 - 2022-12-29

Nature Immunology综述 | 利用<font color="red">空间</font><font color="red">技术</font>解码肿瘤微环境

Nature Immunology综述 | 利用空间技术解码肿瘤微环境

文章评估了新兴多维空间技术的优势和局限性，重点关注其在肿瘤免疫学中的应用；阐述了人工智能（AI）出现为空间组学带来的变革，以及整合多组学数据集以全面了解TME的价值。

测序中国 - 肿瘤微环境，人工智能，空间技术 - 2024-01-05

PNAS：上夜班使你的<font color="red">转录</font><font color="red">组</font>失调

PNAS：上夜班使你的转录组失调

内源性昼夜节律系统的错位会导致生理节律的破坏，并可能导致与夜班工作相关的健康损害的发展。然而，这背后的分子基础仍有待阐明。

MedSci原创 - 夜班，昼夜节律，转录 - 2018-05-09

Nat Commun：单细胞<font color="red">空间</font>代谢<font color="red">组</font>学分析框架scSpaMet，可对同一<font color="red">组</font>织进行<font color="red">空间</font>分辨蛋白质和代谢物分析

Nat Commun：单细胞空间代谢组学分析框架scSpaMet，可对同一组织进行空间分辨蛋白质和代谢物分析

文章提出了单细胞空间分辨代谢框架“scSpaMet”，通过将非靶向空间代谢组学和靶向多重蛋白质成像整合到单一管道中，在单细胞水平上分析人体组织中的免疫细胞和癌症细胞。

测序中国 - 单细胞，空间代谢组学，scSpaMet - 2024-02-03

Nature：利用RNA测序和<font color="red">空间</font>成像<font color="red">技术</font>成功构建高分辨率人类心脏<font color="red">空间</font>单细胞图谱

Nature：利用RNA测序和空间成像技术成功构建高分辨率人类心脏空间单细胞图谱

研究团队将单细胞RNA测序技术与高分辨率多重误差鲁棒荧光原位杂交（MERFISH）技术相结合，绘制了发育中人类心脏的高分辨率空间单细胞图谱，解析了发育中人类心脏的细胞类型。

测序中国 - RNA测序，空间成像技术，心脏空间单细胞图谱 - 2024-04-14

单细胞<font color="red">转录</font><font color="red">组</font>测序<font color="red">技术</font>在非小细胞肺癌免疫微环境分析中应用的研究进展

单细胞转录组测序技术在非小细胞肺癌免疫微环境分析中应用的研究进展

根据2020年的数据[1]，肺癌是世界上第二常见的癌症，同时也是癌症死亡的最重要原因。与小细胞肺癌相比，非小细胞肺癌（non-small cell lung cancer，NSCLC）更为常见[2]。

中国胸心血管外科临床杂志 - 单细胞转录组，非小细胞肺癌，免疫微环境 - 2024-03-17

Nature Genetics：BANKSY：革命性算法，重塑<font color="red">空间</font><font color="red">组</font>学数据分析

Nature Genetics：BANKSY：革命性算法，重塑空间组学数据分析

该算法作为一种创新的空间组学数据分析工具，其主要功能是将空间组学数据中的细胞根据类型和组织域进行有效分类。

生物探索 - 空间组学，BANKSY - 2024-03-04

单细胞转录组研究进展

   单细胞转录组分析以单个细胞为特定研究对象，提取mRNA进行逆转录、放大和高通量测序分析，能揭示该细 胞内整体水平的基因表达状态和基因结构信息，准确反映细胞间的异质性，深入理解其基因型和表型之间的相互关系，在发育生物学、基础医学、临床诊断和药物开 发等领域都发挥重要作用．本文主要介绍了单细胞转录组分析的特点和技术发展历史以及常用研究策略和不同技术的优缺点，并就其面临挑战

生物化学与生物物理学进展 - 转录组，单细胞转录组 - 2014-01-03

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