当小鼠胚胎长出额外的双腿:揭秘胚胎发育中的染色质可及性变化
研究人员成功地创造了一种六腿小鼠胚胎,这一发现不仅令人惊讶,也为我们进一步理解生物体发育过程中基因路径(gene pathway)的作用提供了宝贵的信息。
生物探索 - 染色质,胚胎发育,小鼠胚胎 - 2024-04-05
Nature:组蛋白H1缺失破坏染色质3D结构,驱动淋巴瘤发展
研究人员还确立了H1作为一种真正的肿瘤抑制因子,并表明H1的突变主要通过三维基因组重组驱动恶性转化,从而导致表观遗传学重编程和发育沉默基因的去抑制。
MedSci原创 - 淋巴瘤,基因组 - 2020-12-10
Nature biotechnology:新发现染色质绝缘子或可用于人类基因治疗
插入突变和遗传毒性通常代表造血系统肿瘤的恶化,同时也是实现基因治疗前景所面临的最大障碍。George Stamatoyannopoulos等人研究出一种能够识别作为绝缘子发挥功能的紧凑序列元件的方法,或对实现基因
生物谷 - 染色质,基因治疗 - 2015-02-02
JBC:中科院朱冰团队发现表观遗传系统选择性保护常染色质区
在细胞增殖期间,DNA经复制后将遗传物质传给子细胞。DNA复制错误,如果未经修复的话,能够导致基因突变。对单个有机体而言,一些DNA突变可能导致疾病,甚至是致命性的疾病。可靠的DNA修复系统存在于细胞中以便确保高效地校正复制错误,因而保护着基因保真度。然而,一小部分复制错误逃避DNA修复,成为进化的一个重要基础。表观遗传学研究可遗传的并不是由于DNA序列发生变化而产生的表型变化。事实上,细胞内的表
生物谷 - 表观遗传系统 - 2016-08-30
GENOME BIOLOGY:scIBD用于增强单细胞染色质可及性测序中异型双联体的检测
scIBD 引入了一种自适应策略来模拟高置信度异型双联体,并以迭代优化的方式自我监督双联体检测。对各种模拟和真实数据集的全面基准测试证明了 scIBD 的卓越性能和稳健性。
MedSci原创 - 单细胞染色质,单细胞染色质可及性测序技术,scIBD,异型双联体 - 2023-10-11
Nature子刊:利用类器官,高栋团队等揭开胰腺癌染色质开放性特征
该研究通过类器官模型系统性揭示胰腺癌的染色质开放性特征,通过整合基因组学、转录组学和药物敏感性等多组学数据揭示了不同亚型胰腺癌的基因调控网络及潜在治疗靶点。
生物世界 - 胰腺癌,类器官 - 2022-05-22
ATAC-seq技术再升级:单分子测序平台联手单细胞染色质可及性测序技术
基于二代测序平台(NGS)的scATAC-seq技术利用Tn5酶的DNA随机打断功能,可以富集染色质局部开放区域上的基因组DNA短片段(通常80-300 bp),这些短片段被当作开放染色质的信号。
iNature - ATAC-seq技术再升级,单分子测序,单细胞染色质可及性测序技术 - 2022-11-13
Cell:北大陈鹏/季雄合作实现活细胞中染色质化学修饰的编码表达与串联解析
该研究发展了在活细胞内“关联解析”蛋白质化学修饰机制与功能的“单位点-多组学”技术——SiTomics,揭示了受染色质酰化修饰介导的丰富的相互作用组学信息。
“ 生物世界”公众号 - 活细胞中染色质,编码表达 - 2023-03-06
Blood:增强子活化和染色质聚散是原发性多发性骨髓瘤的调控网络
现有研究人员在原发性MM细胞中绘制了调控元件、解旋的染色质和转录因子足迹。与分泌正常抗体的细胞相比,MM细胞表现为增强子活性持续改变,与超级增强子(SE)介导的转录因子(TF)基因异常调节相关。MM细胞还出现广泛的异染色质松散,与调控元件激活和
MedSci原创 - 多发性骨髓瘤,异染色质,增强子 - 2018-03-10
Nat Genet:TET2如何被招募到染色质?王建龙组从RNA结合蛋白角度给出部分答案
有关TET家族蛋白参与DNA去甲基化的作用及其相关的生物学功能这里不再赘述,相信关注生物学的同行多少都会有些了解。尽管,过去将近十年的时间里,有非常多的关于TET蛋白的研究报道,但是有一些生物学问题很长时间都没有被很好的解决。
BioArt - TET2,染色质,RNA结合,蛋白角度 - 2018-02-28
科学家们证实,控制染色质有望解决癌症耐药性难题
染色质——这个生物圈应该都了解的概念,它或许可以成为癌症治疗的关键!科学家们证实,通过改变染色质的组装密度,可以阻止癌细胞的进化,避免抗药性的产生,从而增强已有抗癌疗法和药物的治疗效果。
生物探索 - 耐药 - 2017-11-08
Nature Methods:北京大学汤富酬团队开发新的方法,揭示单个细胞内高阶染色质结构
该研究开发了scNanoHi-C,它应用纳米孔长读测序来探索单个细胞内全基因组近端高阶染色质接触。
医药加学习班 - 细胞内高阶染色质结构 - 2023-10-31
Autophagy:湖南大学谭拥军团队发现转录因子FOXM1将染色质DNA定位到细胞外囊泡
该研究发现转录因子FOXM1是将染色质基因或DNA片段定向到细胞外囊泡(EVs)的介质。
医药加学习班 - FOXM1,水平基因转移,细胞外囊泡DNA - 2023-11-23
Genome Biology:scIBD:识别单细胞染色质开放性测序数据中异质双联体细胞的新工具
厦门大学王颖、南开大学陈盛泉课题组联合开发了一个对不同单细胞染色质开放性测序数据,进行异质双联体细胞有效识别并去除的新工具。
测序中国 - 单细胞染色质,双联体细胞 - 2023-11-08
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