ARD：单细胞分辨率下滑膜关节成纤维细胞和祖细胞的分类
滑膜中的成纤维细胞包括内层的成纤维样滑膜细胞（FLS）和亚内层的Thy1+结缔组织成纤维细胞。该研究的目的是调查它们的发育起源和与成年祖细胞的关系。
MedSci原创 - 骨关节炎，膝关节，成纤维细胞，滑膜炎 - 2022-12-01
CELL：Allen发布单细胞分辨率的小鼠3D脑图谱
最近的大规模合作正在产生小鼠大脑中的细胞类型和连接的主要研究，收集了大量跨模式、空间尺度和脑区的数据。这些数据的成功整合需要一个标准的三维参考图集。
MedSci原创 - 三维结构，单细胞，脑图谱 - 2020-05-08
Nat Commun：基于单细胞、空间和原位技术对肿瘤微环境进行高分辨率分析
基于商业化的全转录组单细胞、全转录组空间和靶向原位基因表达分析技术，研究人员探索了大型FFPE人类癌症切片中的组织异质性。
测序中国 - 生物标志物，肿瘤微环境，高分辨率分析 - 2024-01-27
Nat Neurosci综述：脊髓损伤后的脊髓环路重建策略——单细胞分辨率建立多组学图谱
SCI 的治愈方法是不可预见的，但我们已经可以预测，目前的策略无法完成这一长期任务
brainnew神内神外 - 脊髓损伤后的脊髓环路重建策略，单细胞分辨率建立多组学 - 2022-12-03
Nature：利用RNA测序和空间成像技术成功构建高分辨率人类心脏空间单细胞图谱
研究团队将单细胞RNA测序技术与高分辨率多重误差鲁棒荧光原位杂交（MERFISH）技术相结合，绘制了发育中人类心脏的高分辨率空间单细胞图谱，解析了发育中人类心脏的细胞类型。
测序中国 - RNA测序，空间成像技术，心脏空间单细胞图谱 - 2024-04-14
空间转录组学方法EEL FISH：可实现高复用、高空间通量和高分辨的原位单细胞分析
大脑是一个高度结构化的器官，包含多种细胞类型，具有复杂的空间模式组织。目前研究分析这些不同细胞类型之间的组织和空间关系仍具有挑战性。
测序中国 - 空间转录组学方法，高空间通量，高分辨的原位单细胞分析 - 2022-11-13
Nat Biotechnol：单细胞和空间转录组的高分辨率比对方法CytoSPACE，可重建复杂组织
CytoSPACE是一个通过全局优化来分析单细胞和空间转录组的工具。与其他方法不同，CytoSPACE确保全局最优的单细胞比对。
测序中国 - 空间转录组，CytoSPACE - 2023-03-29
Nature | 单细胞分辨率绘制食蟹猴胚胎综合转录组图谱，揭示原肠胚形成和早期器官发生
该研究揭示了主要的泌乳周细胞类型的转录组特征，有助于阐明灵长类动物的形态发生事件。
测序中国 - 转录组图谱，单细胞分辨率，胚胎综合 - 2023-01-05
Front Immunol：单细胞分辨下系统性红斑狼疮患者外周血单核细胞染色质可及性的研究
系统性红斑狼疮(SLE)是一种多种免疫细胞参与的自身免疫性疾病。我们的目标是在单细胞分辨率下揭示SLE患者外周血单个核细胞(PBMC)染色质的可及性，并识别可能驱动异常免疫反应的转录因子(TF)。
MedSci原创 - 系统性红斑狼疮，外周血单核细胞，染色质可及性，单细胞分辨 - 2022-03-18
Cell：庄小威团队绘制单细胞分辨率下小鼠大脑重要脑区衰老的分子和空间特征图谱
观察到与神经元相比，非神经元细胞中衰老诱导的变化更为明显，而且在质量上也有所不同，这些非神经元细胞的变化表现出特定的空间模式。提供了与年龄相关的大脑衰退和炎症的关键见解。
brainnew神内神外 - 神经元，非神经元细胞，衰老诱导 - 2023-01-11
Science：MIT王潇团队开发空间翻译组学测序技术RIBOmap，以单细胞和分子分辨率揭示脑组织翻译调控机制
利用RIBOmap，该研究揭示了细胞周期依赖性翻译和亚细胞定位的mRNA翻译，以及细胞类型特异性和脑区特异性翻译调控。
测序中国 - RIBOmap，分子分辨率，脑组织翻译调控机制 - 2023-07-31
单细胞测序的方法和应用
单细胞测序的应用过去二十几年里，随着基因测序技术水平的提高以及千人基因组计划、癌症基因组计划、Meta-Hit计划等重大国际合作项目的相继开展，基因组研究日渐被 推向高潮。然而，迄今为止使用的测序材料无一例外都是数百万甚至更多细胞的混合DNA样本。这种方法能够得到全基因组序列信息，但是对其进行研究得到的结 果只是一群细胞中信号的平均值，或者只代表其中占优势数量的细胞信息，单个细胞独有的特性
MedSci原创 - 单细胞测序 - 2014-04-06
单细胞转录组研究进展
单细胞转录组分析以单个细胞为特定研究对象，提取mRNA进行逆转录、放大和高通量测序分析，能揭示该细 胞内整体水平的基因表达状态和基因结构信息，准确反映细胞间的异质性，深入理解其基因型和表型之间的相互关系，在发育生物学、基础医学、临床诊断和药物开 发等领域都发挥重要作用．本文主要介绍了单细胞转录组分析的特点和技术发展历史以及常用研究策略和不同技术的优缺点，并就其面临挑战
生物化学与生物物理学进展 - 转录组，单细胞转录组 - 2014-01-03
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