Lancet Neurology:散发性Creutzfeldt-Jakob病新危险位点的鉴定和病因分析:全基因组关联研究
2020-10-29 MedSci原创 MedSci原创
朊病毒疾病是由朊病毒的传播引起的人类和动物的致命性神经退行性疾病:由宿主朊病毒单独或主要构成的非典型感染因子。朊病毒被认为是通过与正常朊病毒蛋白结合,通过模板诱导构象变化以及聚合体的裂变的过程传播的。
朊病毒疾病是由朊病毒的传播引起的人类和动物的致命性神经退行性疾病:由宿主朊病毒单独或主要构成的非典型感染因子。朊病毒被认为是通过与正常朊病毒蛋白结合,通过模板诱导构象变化以及聚合体的裂变的过程传播的。朊病毒疾病可以通过饮食中接触朊病毒而获得,也可以通过医疗或外科手术获得,这可能导致公共卫生危机。
人类朊病毒病是一种罕见且通常迅速致命的神经退行性疾病,最常见的是散发性Creutzfeldt-Jakob病(sCJD)。编码朊蛋白的PRNP基因的变异是sCJD的强危险因素,但是,尽管这种疾病与其他神经退行性疾病具有相似的遗传性,但还没有其他遗传风险位点被证实。我们的目的是发现sCJD的新的遗传危险因素及其发病机制。
方法:我们使用基因分型阵列和外显子组测序的两阶段研究设计,对欧洲血统人群(在国家CJD转诊中心确诊为疑似或确诊sCJD的患者)中的sCJD进行了全基因组关联研究。对脑组织中相关基因和蛋白质的条件性、转录性和组织学分析以及风险变异对临床表型的影响测试,都是使用深度纵向临床队列数据进行的。健康个体的对照数据来自与国家匹配的公开可用数据集。
结果:1990年至2014年间,共采集了5208个病例的样本。我们在与sCJD风险相关的三个位点上发现了41个全基因组显著的单核苷酸多态性(SNPs),并独立复制了3个与sCJD风险相关的位点:PRNP(rs1799990;[OR] 1.23 [95%CI 1.17-1.30],p=2.68×10-15;杂合子模型p=1.01×10-135),STX6(rs3747957;或1.16[1.10-1.22],p=9.74×10-9)和GAL3ST1(rs2267161;或1.18[1.12-1.25],p=8.60×10-10)。后续分析表明,PRNP和GAL3ST1的关联可能是由改变蛋白质序列的常见变体引起的,而STX6中的风险变异则与疾病相关脑区主要转录物的表达增加有关。
总之,我们首次提出了散发性人类朊病毒疾病的统计学上强有力的遗传关联的证据,表明细胞内转运和鞘氨醇脂质代谢是分子病因机制。
Jones, Emma et al. Identification of novel risk loci and causal insights for sporadic Creutzfeldt-Jakob disease: a genome-wide association study. The Lancet Neurology, Volume 19, Issue 10, 840 - 848
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