BA.2.75.2.*极可能成为下一个优势奥密克戎亚变体
2022-09-16 MedSci原创 MedSci原创
BA.2.75 催生了被称为 BA.2.75.2 的亚变体，最近引起了追踪 SARS-CoV-2 突变的专家的注意。北京大学免疫学家曹云龙在推特上写道，“BA.2.75.2是目前我们测试过
BA.2.75 催生了被称为 BA.2.75.2 的亚变体，最近引起了追踪 SARS-CoV-2 突变的专家的注意。北京大学免疫学家曹云龙在推特上写道，“BA.2.75.2是目前我们测试过的免疫逃避性最强的毒株。”
北京大学曹云龙教授称BA.2.75.2是目前已知的免疫逃逸最强的新的亚变体，它可以逃逸所有的奥密克戎感染，包括BA.5感染。初步的结果显示，与BA.5相比，BA.2.75.2的NT50有3倍之差，包括RBD 和 NTD突变。具体文章尚未正式公开发表。不过此前梅斯已有一些报道：奥密克戎BA.5感染后中和抗体对BA.2.75作用很弱，BA.2.75能占上风？
甚至在讨论中，曹教授还提到亚变体对EVUSHELD也可能具有逃逸作用，主要是因为新毒株具有486S 和 346T突变。EVUSHELD是tixagevimab和cilgavimab两种抗体的混合物，对多种毒株都有较好的中和作用。 虽然，EVUSHELD对BA.2.75仍具有一定的敏感性。
按GISAID的数据，在8月份，从印度提交的基因组数据显示，BA.2.75.2已整体的34%，而这一数据在7月仅0.7%。在英国目前BA 2.75.2占比约为8%左右。在美国，仍然将BA.2.75.2统计放在BA.2一列，但是近期可以看出数据在快速上升。
另外，曹云龙教授还认为，BA.4.6也可能会快速增长，主要理由是1) BA.4.6 能够逃逸BA.5的突破性感染，即患者曾经感染过BA.5，依然容易再感染BA.4.6；2) Bebtelovimab仍然有潜在的治疗作用，但是Evusheld不再有效。
在印度，马哈拉施特拉邦的基因组测序协调员 Rajesh Karyakarte 博士证实 BA.2.75 正在“进一步变异”。“它通过包装更多的免疫规避突变来争夺主导地位，”他说。
BA.2.75.2 子变体由突变 S:R346T、S:F486S、S:D1199N 定义，并根据 GitHub 首次在印度检测到。尤其是R346T突变，已知发生在BA.1.1, BA.4.6, BF.7, BA.2.75.2，可能起重要的作用。它最早的序列来自印度、智利、英国、新加坡、西班牙和德国，但现在遍布八个国家。
“马哈拉施特拉邦在最近的样本中发现了这个子变体。这个“二代血统”是否会主导现有的BA.2.75还有待观察。但它正在增长，”Karyakarte 博士说。
他说 BA.2.75.2 还试图通过拾取更多突变在其他 Omicron 亚系中确立自己的地位。 “到目前为止，我们还没有发现任何与 BA.2.75.2 相关的问题。因此，感染或住院人数没有激增，”他说。 Karyakarte 博士在实地表示，BA.2.75.2 尚未取代 BA.2.75。
“在最近来自浦那的 71 个样本中，20 个具有 BA.2.75。 BA.2.75.1 存在于大约 11 个样本中，BA.2.75.2 存在于近 17 个样本中。其余的还有其他 Omicron 亚谱系。这表明 BA.2.75.2 似乎正在赶上 BA.2.75，”他说。
目前在马哈拉施特拉邦测序的 90% 的患者样本中发现了 BA.2.75 及其亚谱系。
另一位 INSACOG 科学家表示：“全球专家正在追踪 BA.2.75.2，因为 BA.2.75 继续取代 BA.4 和 BA.5。这使得 BA.2.75.2 比它们更容易传播。”
浦那 IISER 生物学助理教授 Krishanpal Karmodiya 博士说，7 月和 8 月来自浦那的样本显示出越来越多的 Omicron 亚系 BA.2.75.1 存在。
“当时，BA.2.75.2 仅存在于 5% 的样本中，而 BA.2.75.1 则存在于其中的 15% 中。但我们需要从 9 月开始获取更多最新样本，以了解前者是否在其他亚系之上生长。”
不过，印度国家 Covid 工作组成员 Sanjay Pujari 博士说：“BA.2.75.2 是 BA.2.75 的一个亚谱系，由于免疫逃避特性，它可能具有高传播性。 但也报告了多个其他亚谱系。 很难预测哪一个将主导引发重大浪潮，但是，如果实现了充分的疫苗接种，这些不太可能导致严重疾病的增加。 其他后果包括逃避单克隆抗体治疗。 我们需要等待更多数据。”
T. Ryan Gregory教授认为下一阶段应该关注BA.2.75.2 和 BJ.1的传播态势。
在美国最近以BA.2.75.*为例，这是最新的数据，也显示BA.2.75.2占住优势。
当然，目前在美国，仍然是BA.5及其亚变体(尤其是BA.5.3, BA.5.2, BA.5.2.1)为主导，BA.4.6呈现快速上升的势头。下图为美国最近15天内的不同变体的分布情况。
上周梅斯一篇报道，在讨论BA.4.6和BA.2.75，哪一种毒株未来可能占上风的文章：美国奥密克戎BA.5开始减退，BA.4.6和BA.2.75开始缓慢上升。事实上早在7月4日，梅斯就预警BA.2.75的风险，见：BA.2.75：第二代奥密克戎问世！又一个王炸诞生？，但最终BA.2.75并没有在全球流行开来，现在主要看其亚变体BA.2.75.2了。当然，BA.4/5也在进一步变异，是否也能出来更为厉害的亚变种，尚不可知。
从下图可以看出，目前认为传播速度最快的应该是BA.2.75.2，及其亚亚变体BA.2.75.2.*了，相对增长速度达高157.34%。而目前主要流行的BA.5.2的传播速度仅40.54%。BA.4.6仅为39.9%。当然，下面的数据仍然需要进一步累积，才具有更高的准确度。但是，从这张图初步可以看出，未来BA.2.75.2.*可能是竞争之王。事实上，下面这张图在9月5日的报道中已公布：奥密克戎新亚株BA.4.6在BA.5主导情况下，仍然快速增长，未来形势难测
不过，几乎可以肯定的是奥密克戎是最后一个新冠病毒，也符合5月份的Nature的研判：Nature研判：奥密克戎或将不断进化亚型，只是奥密克戎不断演变为各种亚变体。但是好在奥密克戎本身的毒性相对较弱，因此，即使不断演变，整体趋势是逐步毒性减弱，很难再演化出象Delta那样毒株了。
不过，从印度来看，虽然BA.2.75广泛传播情况下，几乎很少有人因为病毒而死亡了（印度的统计可能被低估）。因此，即使是BA.2.75.2.*在全球广泛传播，应该不会引发严重医疗负担。具体的需要等待后续的专业的数据统计。
图：印度新冠肺炎死亡趋势图
参考资料：
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/activ
https://public.tableau.com/app/profile/raj.rajnarayanan/viz/USAVariantDB/VariantDashboard
https://www.worldometers.info/coronavirus/country/india/
奥密克戎新亚株BA.4.6在BA.5主导情况下，仍然快速增长，未来形势难测
美国奥密克戎BA.5开始减退，BA.4.6和BA.2.75开始缓慢上升
奥密克戎BA.5感染后中和抗体对BA.2.75作用很弱，BA.2.75能占上风？
奥密克戎BA.5/4占全美病例95%，BA.2.75会是新冠病毒的终结者吗？
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