PLoS Pathog：从8000人的血液病毒基因组中能够发现什么？

最近，来自英国普利茅斯大学的研究人员报道了一项关于对8000人的病毒基因组进行测序和检索的研究， 相关研究刊登于国际杂志PLoS Pathog上。

血液病毒基因组的特征对于血液输血产品的安全性和鉴定新出现的病原体是重要的。我们从没有任何感染性疾病的8,240人的全血基因组测序中检索了非人类序列数据。从没有映射到人类参考基因组的序列读数库中提取病毒序列。分析筛选出接近1 PB的序列数据，并执行了0.5万亿次相似性检索。设定2个病毒基因组/ 100,000个细胞的为最低下限够，研究人员将序列映射到94种不同的病毒，包括19个人类DNA病毒，前导病毒和RNA病毒（疱疹病毒，阿耳病，乳头瘤病毒，3个多瘤病毒，腺病毒，HIV，HTLV，乙型肝炎，丙型肝炎，细小病毒B19和流感病毒）。与输血医学相关，研究人员在在42％的研究参与者中鉴定出了Merkel细胞多瘤病毒，13人血液中有乳头瘤病毒，6人中有细小病毒B19，以及3人中有疱疹病毒8的存在。来自两种RNA病毒的DNA序列的存在是意想不到的：分别为揭示存在整合事件的丙型肝炎病毒，及DNA疫苗免疫引起的而流感病毒序列。

研究认为，年龄，性别和祖先与病毒感染有显著关系。其余的75种病毒主要反映了商业试剂和环境的广泛污染。这些技术问题是鉴定新型人类病原体的重大挑战。增加人类全基因组序列的可用性将为正常和致病的人类血液病毒的组成提供大量的数据。从污染物中区分人类病毒的是非常具有挑战性的。

原始出处：

Ahmed Moustafa, Chao Xie, Ewen Kirkness. et al. The blood DNA virome in 8,000 humans. Published: March 22, 2017

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