PLoS Genet：癌细胞可以简化其基因组
2017-06-25 海北 MedSci原创
核糖体DNA在拷贝数方面是人类基因组中最可变的区域之一。核糖体DNA对于细胞功能起着重要的作用，但是我们对于其拷贝数，稳定性，在哺乳动物中序列的调控机制几乎一无所知。对核糖体DNA的定位和分析是很具挑战性的。
核糖体DNA在拷贝数方面是人类基因组中最可变的区域之一。核糖体DNA对于细胞功能起着重要的作用，但是我们对于其拷贝数，稳定性，在哺乳动物中序列的调控机制几乎一无所知。对核糖体DNA的定位和分析是很具挑战性的。
Jennifer L. Gerton课题组近日发文，利用计算和微滴式数字PCR的方法，在人类和小鼠的正常细胞和癌细胞中测量核糖体DNA的拷贝数。他们发现，核糖体DNA的拷贝数和序列在癌细胞中会有所改变。人类癌细胞基因组内的拷贝数会有所减少，序列也更具多样化。具有低拷贝数的癌细胞基因组会出现mTOR的高活性。PTEN磷酸酶是一个对基因组稳定性起着重要作用的肿瘤抑制因子，也是mTOR激酶途径的负调节因子。在PTEN敲除的小鼠造血肿瘤干细胞中，核糖体DNA的拷贝数也比较低。同时，细胞的增值能力，核糖体DNA的产生水平和蛋白合成水平会提高。
核糖体DNA丢失一般发生在早期，并且和DNA对损伤的超敏感性相关。因此，核糖体DNA的拷贝丢失在癌细胞中是一个常见的现象，和 mTOR活化相关。
因此，核糖体DNA拷贝数可以作为一个简单的指标来评估癌细胞是否对DNA损伤的疗法敏感。
原始出处：
Baoshan Xu et al. Ribosomal DNA copy number loss and sequence variation in cancer. PLoS Genet (2017) 13(6): e1006771. DOI: https://doi.org/10.1371/journal. pgen.1006771
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