Nature:磁感应蛋白面临的新一轮争议!

2017-04-05 佚名 BioArt

4月4日,Nature在线发布了一篇题为“Compass protein attracts heap of criticism”的新闻报道(News),文章直指磁受体蛋白相关研究目前面临的巨大争议。2015年11月16日,北京大学生科院谢灿课题组在Nature Materials杂志在线发表论文,声称首次报道了一个全新的磁受

4月4日,Nature在线发布了一篇题为“Compass protein attracts heap of criticism”的新闻报道(News),文章直指磁受体蛋白相关研究目前面临的巨大争议。

2015年11月16日,北京大学生科院谢灿课题组在Nature Materials杂志在线发表论文,声称首次报道了一个全新的磁受体蛋白(MagR),当时众多媒体报道该突破性进展或将揭开被称为生物“第六感”的磁觉之谜,并推动整个生物磁感受能力研究领域的发展。值得一提的是,该成果还获得2015年度“中国生命科学十大进展”。与此同时,当时还在清华大学的张生家课题组2015年9月14日在Science Bulletin(科学通报)发表论文声称利用Isca1(MagR)蛋白开发出了一种磁遗传学工具(磁场诱发神经元的相关活动)。

诚然,此后围绕磁受体蛋白或者磁遗传的引发了一次中国学术史上罕见的争论,至今尚未平息,BioArt这里不再赘述。回到Nature刚刚发布的报道,文中提及了今年3月16日,来自清华大学医学院鲁白实验室联合北京大学生科院谢灿实验室在Frontiers in Neural Circuits杂志上在线发表了一篇论文表明,磁感应蛋白MagR在HEK293T细胞、海马体神经元细胞和背根神经节细胞(DRGN)中分别表达MagR后并不能对磁场刺激产生反应,也没有钙离子信号的变化(下图),也就是说该文的结论正好与张生家课题组此前发表在Science Bulletin上的文章的结论相反。

除去这些国内的系列争端,有关磁感应蛋白在国际范围内也受到了诸多质疑,其中比较有代表性的是2016年8月16日,加州理工学院的Markus Meister在eLife杂志上发表了一篇题为“Physical limits to magnetogenetics”的文章,文章针对过去一段时间发表的几篇有关“磁遗传学”文章展开讨论(注:该文没有引用张生家此前在Science Bulletin上发表的文章),并用物理学定律对这些报道进行了质疑和探讨。该文的主要意思大致是说:谢灿组发现那个MagR蛋白复合体里面铁原子太少,不可能产生磁矩。Nature的报道里称,MagR蛋白复合体只有40个铁原子,而自然条件下发生基于铁离子的磁场反需要100万个铁原子包裹在一个小空间里(Xie had reported that the complex would contain only 40 iron atoms, but Meister argues that the smallest known naturally occurring iron-based magnet has 1 million iron atoms packed into a smaller space)。另外那几个改造离子通道的meganetogenetics tools(发表在Nature Medcine、Nature Neuroscience杂志上的成果)也不可能产生足够的力驱使蛋白构像变化。

2016年12月15日,另一篇来自奥地利分子病理研究所题为“ISCA1 and CRY4: An improbable proposition”的论文(发表在冷泉港实验室旗下的预印本bioRxiv)也对谢灿组报道的磁感应蛋白提出了质疑(下图),该预印本文章显示,此文已于一年前的2015年12月15日提交给了Nature Materials杂志。

该预印本论文主要的质疑的内容有两点。第一,谢灿研究组在2015年的论文中并没有提供证据显示ISCA1(MagR)和光受体CRY4蛋白在体内有直接相互作用(注:谢灿组的Nature Materials论文中有使用免疫组织化学实验证明了磁感应受体MagR蛋白质和光受体Cry蛋白质在鸽子视网膜存在共定位);第二,谢灿组实验中所用的CRY4蛋白的序列有误,非正确的完整序列(注:Nature Materials论文中CRY4的序列中包含497个氨基酸而预印本中显示全场应为525aa-鸽子)、529aa-鸡、527aa-斑马鱼)。

此外,印本论文主中的实验结果表明ISCA1(MagR)和CRY4在多种组织中广泛表达,并不具备组织特异性(下图),而作为磁受体来讲,一般认为这种蛋白应该具有组织特异性表达。

Isca1 (左)和 Cry4 (右)在鸽子不同组织中的表达情况

针对上述质疑,谢灿及其合作者在给Nature的回复中表示道,他们也能重复上述部分结果,然而数据就在那,或许这项研究(指Nature Materials论文)拓展了我们对现有分子磁体的认知(Collaborators of Xie say that they have been able to reproduce some of his findings, and Xie told Nature that he stands by his results. He disputes the contention that the magnetic properties of IscA1 would be too weak by saying that Cry4 might boost its effect. “The data are what they are,” he says. “This may expand our knowledge of molecular magnets.”)。此外,谢灿也向Nature表示了即便如今面临了诸多争议,但是他百分百确信自己团队的研究(“We are more and more confident — 100% sure — that we are right about this”),他所在的团队还计划在一年内发表相关文章证明ISCA1蛋白复合体在磁场下的反应。

Nature的报道中还提到,一些中国以外的科学家告诉Nature,表示他们并不能重复张生家此前的实验结果。Nature也试图通过邮件和电话联系张生家及其目前所在的单位深圳大学,但是都没有得到回复。

原始出处:

[1]David Cyranoski.(2017).Compass protein attracts heap of criticism. Nature

[2]Hochstoeger, T., Nimpf, S., & Keays, D. (2016). ISCA1 and CRY4: An improbable proposition. bioRxiv

[3]Meister, M. (2016). Physical limits to magnetogenetics. Elife, 5, e17210.

[4]Qin, S., Yin, H., Yang, C., Dou, Y., Liu, Z., Zhang, P., ... & Hao, J. (2015). A magnetic protein biocompass. Nature materials.

版权声明:
本网站所有内容来源注明为“梅斯医学”或“MedSci原创”的文字、图片和音视频资料,版权均属于梅斯医学所有。非经授权,任何媒体、网站或个人不得转载,授权转载时须注明来源为“梅斯医学”。其它来源的文章系转载文章,或“梅斯号”自媒体发布的文章,仅系出于传递更多信息之目的,本站仅负责审核内容合规,其内容不代表本站立场,本站不负责内容的准确性和版权。如果存在侵权、或不希望被转载的媒体或个人可与我们联系,我们将立即进行删除处理。
在此留言
评论区 (2)
#插入话题
  1. [GetPortalCommentsPageByObjectIdResponse(id=1881856, encodeId=94a7188185688, content=<a href='/topic/show?id=3b2112532d8' target=_blank style='color:#2F92EE;'>#Nat#</a>, beContent=null, objectType=article, channel=null, level=null, likeNumber=14, replyNumber=0, topicName=null, topicId=null, topicList=[TopicDto(id=12532, encryptionId=3b2112532d8, topicName=Nat)], attachment=null, authenticateStatus=null, createdAvatar=, createdBy=2e6f107, createdName=liye789132251, createdTime=Sun Oct 01 04:57:00 CST 2017, time=2017-10-01, status=1, ipAttribution=), GetPortalCommentsPageByObjectIdResponse(id=185532, encodeId=6dd118553272, content=这个东西有点新鲜哈, beContent=null, objectType=article, channel=null, level=null, likeNumber=38, replyNumber=0, topicName=null, topicId=null, topicList=[], attachment=null, authenticateStatus=null, createdAvatar=https://wx.qlogo.cn/mmopen/udqvoAsWtvRVficPKOpMh4M31O9bJ8jMiaUHAheeNpIqMapC8mUnBWfEskrcVjofbicWU4icRD6vFvVeEYlPmSbXELickazEGVFYO/0, createdBy=24741603767, createdName=医艺依意, createdTime=Thu Apr 06 10:06:43 CST 2017, time=2017-04-06, status=1, ipAttribution=)]
    2017-10-01 liye789132251
  2. [GetPortalCommentsPageByObjectIdResponse(id=1881856, encodeId=94a7188185688, content=<a href='/topic/show?id=3b2112532d8' target=_blank style='color:#2F92EE;'>#Nat#</a>, beContent=null, objectType=article, channel=null, level=null, likeNumber=14, replyNumber=0, topicName=null, topicId=null, topicList=[TopicDto(id=12532, encryptionId=3b2112532d8, topicName=Nat)], attachment=null, authenticateStatus=null, createdAvatar=, createdBy=2e6f107, createdName=liye789132251, createdTime=Sun Oct 01 04:57:00 CST 2017, time=2017-10-01, status=1, ipAttribution=), GetPortalCommentsPageByObjectIdResponse(id=185532, encodeId=6dd118553272, content=这个东西有点新鲜哈, beContent=null, objectType=article, channel=null, level=null, likeNumber=38, replyNumber=0, topicName=null, topicId=null, topicList=[], attachment=null, authenticateStatus=null, createdAvatar=https://wx.qlogo.cn/mmopen/udqvoAsWtvRVficPKOpMh4M31O9bJ8jMiaUHAheeNpIqMapC8mUnBWfEskrcVjofbicWU4icRD6vFvVeEYlPmSbXELickazEGVFYO/0, createdBy=24741603767, createdName=医艺依意, createdTime=Thu Apr 06 10:06:43 CST 2017, time=2017-04-06, status=1, ipAttribution=)]
    2017-04-06 医艺依意

    这个东西有点新鲜哈

    0

相关资讯

科学家揭开“垃圾”DNA的神秘角色!

生物学家们在很长一段时间里都认为,既然几乎所有具体的生理机能都要由蛋白质来完成,那么不编码蛋白质的DNA应该是没有用的,可以称为“垃圾DNA”;而且人类基因组项目发现人的基因组中仅有1.5%的序列是给蛋白质编码的,其余的98.5%的序列是以前认为的“垃圾”DNA。

Nat Commun:血液检测癌症又向前迈进一大步

3月23日的Nature Communication上报道了加州大学伯克利分校的研究人员通过检测属于循环系统中肿瘤细胞上的蛋白,在实现通过对病人抽血来监测他们对癌症治疗反应的梦想上又向前迈进一步。

Am J Resp Crit Care:同时使用mRNA和蛋白生物标志物可以改善小儿感染性休克的危险分层!

由此可见,PERSEVERE-XP结合蛋白和mRNA的生物标志物可以提供死亡风险分层,具有可能的临床应用价值。PERSEVERE-XP比PERSEVERE具有显著的改善,并表明TP53相关细胞分裂、修复和代谢在感染性休克的病理生理机制中发挥着作用。

蛋白CD151--告诉你卵巢癌是恶性还是良性

【 卵巢癌研究人员发现生物标志物与攻击性疾病类型的预后相关】卵巢癌研究者已经鉴定了在高度浆液性卵巢癌(该疾病最常见和致死的亚型)中的肿瘤细胞表面上表达的蛋白质生物标志物。

Cell Research:环装RNA编码蛋白的重要机制

  3月10,中国科学院-马普学会计算生物学伙伴研究所研究员王泽峰在《细胞研究》(Cell Research)上在线发表了题为Extensive translation of circular RNAs driven by N6-methyladenosine 的研究论文,该研究发现了大量的环形RNA可作为信使RNA来编码蛋白,这些环形信使RNA通过一种常见的RNA甲基化修饰m

Nature:癌症表观遗传学-发现白血病关键蛋白

科学家们发现,调控蛋白 ENL 能促进白血病的发生。这加深了学界对转录调控的理解,并提示了一种潜在的白血病疗法。血液肿瘤的发病原因通常是染色体易位,产生由两个蛋白质的片段连接形成的融合蛋白,最终引起疾病。调节蛋白混合性白血病(regulatory protein mixed lineage leukaemia, MLL)中的融合蛋白通常也存在于侵袭性儿童白血病中,并且与不良预后有关。因此,开发