NATURE:全基因组测序发现,自闭症中存在大量DNA重复序列 

2020-07-28 MedSci原创 MedSci原创

串联DNA重复在每个单元(motif)的大小和序列都不同。增多的串联DNA已与40多种单基因疾病相关。但是,至今为止,关于它们是如何参与复杂疾病的在很大程度上仍然是未知的。

串联DNA重复在每个单元(motif)的大小和序列都不同。增多的串联DNA已与40多种单基因疾病相关。但是,至今为止,关于它们是如何参与复杂疾病的在很大程度上仍然是未知的。

在这里,研究人员调查了17,231个自闭症家庭和对照组的基因组中具有2-20-bp基序的串联重复的全基因组特征。

研究人员发现了基序大小和序列的广泛多态性。许多与细胞遗传学脆弱位点相关。其中,有2,588个位点的基因相关重复序列扩增,其在自闭症患者中比其未受影响的兄弟姐妹显著更普遍,这些扩增在对照组中十分罕见。此外,这些重复序列扩增多见于外显子和剪接点附近,以及与神经系统发育和血管系统或肌肉相关的基因中。

罕见的串联重复扩增在自闭症患儿中的出现概率为23.3%,而在未受影响的儿童中为20.7%,表明其对自闭症风险的集体贡献为2.6%。它们包括已知的神经肌肉疾病相关的DMPK和FXN,以及FGF14和CACNB1等新型位点中与自闭症相关的串联重复扩增。这些都与较低的智商和适应能力有关。

因此,该研究结果揭示了串联DNA重复扩增对自闭症的遗传病因和表型复杂性的巨大影响。

 

原始出处:

Brett Trost et al. Genome-wide detection of tandem DNA repeats that are expanded in autism, Nature (2020). 

 



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  1. 2020-08-27 14818eb4m67暂无昵称

    学习了

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  2. 2020-08-26 14818eb4m67暂无昵称

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