Nucleic Acids Res:空间转录组学数据挖掘新算法——DeepST
研究团队研发了基于深度学习的空间域识别技术(DeepST)。DeepST使用预先训练好的深度神经网络模型从组织形态学信息(H&E染色图片)中提取图像特征,然后将提取的特征与基因表达和空间位置数据集成,
测序中国 - 数据挖掘,算法,空间转录组学 - 2022-10-24
Nature Commun:衰老问题重要线索----转录因子调控细胞自噬
凯斯西储大学医学院和大学健康系统医院的研究人员发现了一个控制线虫和哺乳动物寿命的新分子通路。文章发表在今天的《Nature Communications》。
生物通 - 衰老问题,转录调控,自噬 - 2017-10-16
ASCO 2023 速递 | 年轻结直肠癌(CRC)患者转录代谢分析!
年轻组的代谢途径(氨基酸和脂类)、致癌基因(MYC靶点和NRAS靶点)和细胞过程富集。
MedSci原创 - ASCO 2023,年轻结直肠癌,转录代谢 - 2023-06-05
Clin Cancer Res:抗PD-1治疗的转录水平机制
通过对26例黑素瘤标本(4例预后,22例死后)进行全部外显子测序。评估了在治疗期间显示反应或进展的10个皮肤候选免疫标记物和基因表达。
MedSci原创 - PD-1,黑素瘤 - 2017-06-21
Stroke: 改善脑血管功能的重要机制——转录因子-1调节通路
研究人员检测铁螯合剂对健康老人脑血管功能的影响,探索是否缺氧所致转录因子-1的激活是否与短暂的血管改变相关。
MedSci原创 - 去铁敏,脑血管功能,血管老化 - 2015-09-17
Cell Rep:GW182 旁系同源或是RNA调节转录的关键
在细胞核中,小RNA也能控制转录和剪接。但是RNA介导的核调控机制尚不清楚,仍存在争议,阻碍了对核RNAi的有效应用及对其天然调控作用的深入研究。本研究中,研究人员发现,人类GW182旁系同源TNRC6A/B/C是RNA介导转录激活的关键因素。精核蛋白质朴分析再经实验验证表明,TNRC6A质谱与蛋白质相互作用,参与了蛋白质的降解,RNAi
MedSci原创 - GW182,转录 - 2017-09-09
Sci Rep:开胸手术后心脏转录和代谢的变化
这项研究表明,单独开胸手术后的前2周内出现明显且可逆的转录变化。这与大部分心血管事件发生的时间段相吻合。
MedSci原创 - 代谢,开胸手术,心脏转录 - 2020-06-21
逆转录病毒5亿年前便已出现
逆转录病毒能够感染各种动物,其中就包括图中的树懒。图片来源:Oswaldo Rivas/Reuters 逆转录病毒可能在5亿年前便已进化形成,从而使得这种在医学和经济上都十分重要的病毒比科学家之前的预想“老”了5倍。这一发现表明,逆转录病毒与它们的脊椎动物宿主一道从海洋来到了干燥的陆地。通过用新的数学方法计算一种古老的逆转录病毒株(被称为泡沫病毒
中国科学报 - 逆转录,病毒 - 2017-01-13
Blood:转录因子ETS1调控NK细胞发育和终末分化
人ETS1缺乏会抑制几种NK细胞相关关键转录因子的表达和NK细胞的分化。 ETS1对于肿瘤细胞诱导性NK细胞毒性和IFN-γ的产生必不可少。
MedSci原创 - NK细胞,ETS1 - 2020-05-04
Nat Med::血液转录组测序可提高罕见病的诊断率
斯坦福大学的研究人员近日发现,整合血液样本的转录组数据有助于提高罕见病患者的诊断率,并确定新的疾病相关基因。
生物通 - 血液,转录组测序,罕见病 - 2019-08-16
Science:开发出TT-Seq技术绘制人类瞬时转录组图谱
基因之间的序列长期以来被视为“垃圾DNA”,我们如今知道它们也发挥着至关重要的功能。这些DNA区域发生的突变能够严重地对人类发育造成损害,而且可能在生命后期导致严重疾病。然而,在此之前,调节性DNA序列一直很难发现。如今,在一项新的研究中,德国慕尼黑理工大学计算生物学教授Julien Gagneur团队和德国马克斯普朗克生物物理化学研究所教授Patrick Cramer团队如今开发出一种方法可
生物谷 - TT-Seq技术,人类瞬时转录 - 2016-06-04
Nat Commun:研究揭示炎症促进癌细胞转录组改变的机制
炎症影响癌症发生,进展和治疗效果,但免疫信号传导驱动癌细胞转录组改变的机制目前仍不清楚。
MedSci原创 - 炎症,p53,NF-κB - 2017-10-11
Nat Med:血液转录组测序可提高罕见病的诊断率
斯坦福大学的研究人员近日发现,整合血液样本的转录组数据有助于提高罕见病患者的诊断率,并确定新的疾病相关基因。
生物通 - 血液,转录组测序,罕见病 - 2019-06-26
Psychiatry Res:尼古丁使用严重程度的脑转录组和GWAS研究
该文构建了与吸烟程度相关的区域特异性亚网络,并鉴定了与CPD相关的基因集。他们还发现了与吸烟相关的三个中枢蛋白,这些蛋白与应激反应、药物记忆、钙稳态和抑制控制有关。
MedSci原创 - 全基因组相关性研究,转录组,尼古丁成瘾 - 2024-03-03
2022 BHIVA指南:成年HIV-1患者抗逆转录病毒治疗
2022年12月,英国艾滋病协会(BHIVA)发布了成年HIV-1患者抗逆转录病毒治疗指南。主要目的是为抗逆转录病毒治疗(ART)的最佳临床实践和成人人体免疫缺陷病毒(HIV)的管理提供指导。
HIV Med - HIV,HIV-1 - 2022-12-15
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