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Front Immunol:强直性脊柱炎患者外周血单个核<font color="red">细胞</font>的整合<font color="red">单细胞</font><font color="red">RNA</font>-SEQ和ATAC-SEQ分析

Front Immunol:强直性脊柱炎患者外周血单个核细胞的整合单细胞RNA-SEQ和ATAC-SEQ分析

该研究集中在T细胞如何参与AS的发病机制,这将丰富AS单细胞研究的数据,为理解AS的发病机制提供新的视角。

MedSci原创 - 强直性脊柱炎,整合单细胞RNA-SEQ,ATAC-SEQ - 2022-02-19

Science:<font color="red">单细胞</font>测序细分肿瘤亚型

Science:单细胞测序细分肿瘤亚型

美国麻省总院和Broad研究所合作发表在3月31日Science杂志上对两种脑肿瘤亚型的详细分析显示,它们起源于神经祖细胞的相同类型,由基因突变模式和其微环境的组成分而区分开。

生物探索 - 肿瘤,单细胞测序 - 2017-04-04

读书报告 | <font color="red">单细胞</font><font color="red">RNA</font>测序评估新辅助免疫化疗治疗对NSCLC免疫微环境的重塑作用

读书报告 | 单细胞RNA测序评估新辅助免疫化疗治疗对NSCLC免疫微环境的重塑作用

本文利用单细胞测序、转录组测序、非靶向代谢组学以及多色荧光染色系统描述了可切除的NSCLC患者接受新辅助免疫治疗过程中TME的动态变化。

iCombo - NSCLC,单细胞RNA测序,新辅助免疫化疗 - 2023-12-19

<font color="red">单细胞</font>测序应用及技术实例

单细胞测序应用及技术实例

作为“在单个细胞水平上对基因组进行测序”的单细胞测序技术能够解决上述难题。与传统的全基因组测序相比,单细胞测序不仅测量基因表达水平更加精确,而且还能检测到微量的基因表达子或罕见非编码RNA,其优势是全方位和多层次的。与此同时,测序巨头相继推出新一代测序仪,为单细胞测序提供利器,越来越多与单细胞测序有关的研究也发表在顶级期刊上,这些都表明,单细胞测序已逐渐成为科研热点。单细胞测序应用及技术实例单

MedSci原创 - 单细胞测序 - 2017-03-07

Cancer Cell:邓艳红团队通过<font color="red">单细胞</font><font color="red">RNA</font>测序,揭示PD-1疗法成功治疗结直肠癌的机制

Cancer Cell:邓艳红团队通过单细胞RNA测序,揭示PD-1疗法成功治疗结直肠癌的机制

该研究阐明了免疫检查点抑制剂(ICI)治疗期间的关键免疫细胞和基质细胞亚群的动态变化,并为错配修复缺陷和微卫星不稳定性高结直肠癌患者对PD-1阻断疗法的不同反应的细胞基础提供新的见解。

生物世界 - 结直肠癌,PD-1疗法 - 2023-05-13

ReactomeGSA:高效的<font color="red">单细胞</font>通路分析工具

ReactomeGSA:高效的单细胞通路分析工具

单细胞数据科学中,Pathway analyses也是基因表达数据链

简书 - 单细胞 - 2021-02-06

Nature:如何利用<font color="red">单细胞</font>mRNA测序发现罕见<font color="red">细胞</font>类型?

Nature:如何利用单细胞mRNA测序发现罕见细胞类型?

近日,来自荷兰的科学家在著名国际学术期刊nature上发表了一项最新研究进展,他们利用一种新的计算方法结合转录组测序发现了小肠中一些罕见的细胞类型,这对于深入了解器官的细胞组成,探究健康和疾病状态下的组织生物学具有重要意义理解一个器官的发育和功能需要对组成该器官的所有细胞类型的特性有一个清晰的认识。传统发现认为分离细胞亚群的方法是基于几个已知的标记基因表达出来的信使RNA或蛋白质实现

生物谷 - 单细胞mRNA,罕见细胞类型,Reg4,Lgr5 - 2015-08-25

<font color="red">单细胞</font>研究指南:测序方法大比拼

单细胞研究指南:测序方法大比拼

细胞生物的每个细胞都携带着相同的遗传学信息。不过,近年来蓬勃发展的单细胞研究告诉我们,每一个细胞都是独一无二的。The Scientist杂志最近联系了单细胞研究领域的一些专家,请他们分享了在单细胞中进行转录研究的秘诀。希望帮助研究者们更好地构建文库,处理和分析结果数据。那么,细胞之间的哪些差异有生物学意义,哪些差异来自于技术偏好呢?要获得可靠的结果又需要研究多少细胞呢?这些问题曾经是单细胞

Ebiotrade - 单细胞,测序方法 - 2016-05-18

Kidney Int:基因芯片+<font color="red">单细胞</font><font color="red">RNA</font>测序揭示调控FGF23介导的矿物质代谢的新靶点基因

Kidney Int:基因芯片+单细胞RNA测序揭示调控FGF23介导的矿物质代谢的新靶点基因

成纤维细胞生长因子23(FGF23)是一种骨源性激素,通过其辅受体α-Klotho减少肾脏磷酸盐的重吸收和1,25(OH)2维生素D的合成。

MedSci原创 - 单细胞RNA测序,成纤维细胞生长因子23(FGF23),HBEGF - 2020-11-11

Cell:革命性<font color="red">单细胞</font>研究工具CellHint,可自动化整合多种人类<font color="red">单细胞</font>图谱数据集

Cell:革命性单细胞研究工具CellHint,可自动化整合多种人类单细胞图谱数据集

研究团队报道了最新开发的变革性工具—CellHint,这是一种基于预测聚类树(PCT)的工具,可解决数据集之间在注释分辨率和技术偏差方面的细胞类型差异。

测序中国 - CellHint,单细胞图谱 - 2024-01-25

Nat Commun:<font color="red">单细胞</font>测序揭示心肌<font color="red">细胞</font>成熟机制

Nat Commun:单细胞测序揭示心肌细胞成熟机制

心肌细胞(CMs)是一种不同于心脏其他类型细胞的终末分化细胞,其不具备修复疾病或其他因素引起的心肌损伤的增殖能力。因此,重塑受损的心肌细胞仍是治疗如心肌梗死在内的心脏损伤性疾病的主要挑战。

MedSci原创 - 心肌细胞,单细胞RNA测序 - 2020-06-03

Science:单细胞RNA测序揭示等位基因表达的动态随机性 解释同卵双胞胎也不同

这项研究在某种程度上解释了为何同卵双胞胎——几乎完全相同的基因组的产物——彼此之间会在外貌和疾病倾向上显示显著的差异。 日前,来自瑞典路德维格癌症研究所与卡罗琳斯卡学院的研究人员揭示了一种现象,可能会改变人们关于基因组如何表达从而生成及维持哺乳动物生命的一个普遍观点。 这项刊登在《科学》(Science)杂志上的最新研究,帮助解释了为何基因相同的动物有时在生物学和外形上会如此的

MedSci原创 - 测序,RNA,双胞胎 - 2014-01-10

单细胞测序的方法和应用

单细胞测序的应用过去二十几年里,随着基因测序技术水平的提高以及千人基因组计划、癌症基因组计划、Meta-Hit计划等重大国际合作项目的相继开展,基因组研究日渐被 推向高潮。然而,迄今为止使用的测序材料无一例外都是数百万甚至更多细胞的混合DNA样本。这种方法能够得到全基因组序列信息,但是对其进行研究得到的结 果只是一群细胞中信号的平均值,或者只代表其中占优势数量的细胞信息,单个细胞独有的特性

MedSci原创 - 单细胞测序 - 2014-04-06

单细胞转录组研究进展

   单细胞转录组分析以单个细胞为特定研究对象,提取mRNA进行逆转录、放大和高通量测序分析,能揭示该细 胞内整体水平的基因表达状态和基因结构信息,准确反映细胞间的异质性,深入理解其基因型和表型之间的相互关系,在发育生物学、基础医学、临床诊断和药物开 发等领域都发挥重要作用.本文主要介绍了单细胞转录组分析的特点和技术发展历史以及常用研究策略和不同技术的优缺点,并就其面临挑战

生物化学与生物物理学进展 - 转录组,单细胞转录组 - 2014-01-03

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