Genome Med:浙江大学沈宁团队发表实现单细胞水平肿瘤细胞群突变与表达异质性的同步研究算法
该论文报道了一种高精确度直接从scRNA-seq数据中提取体细胞突变的算法框架RESA,该算法在多种类型的不同来源的癌症单细胞数据集上进行测试,均取得了较高的精确度。
测序中国 - 癌症,细胞群突变,表达异质性 - 2023-12-27
Sci Adv:基于高通量单细胞分析揭示小鼠整个生命周期的线粒体DNA异质性
研究团队在两种人类mtDNA疾病小鼠模型中进行了高通量单细胞基因分型,发现了mtDNA异质性水平在细胞间存在意想不到的差异,这些差异在产前出现,并在整个生命过程中逐渐增加。
测序中国 - 小鼠模型,mtDNA,DNA异质性 - 2023-12-05
J Hypertens:中心收缩压与非必需氨基酸代谢组学的关系
由此可见,这些氨基酸在胶原代谢、葡萄糖代谢和氧化应激中发挥关键作用,这种人种特异性发现表明非必需氨基酸的生物合成可能被上调,以保护脉管系统免受早期血管恶化的影响。
网络 - 中心收缩压,非必需氨基酸,代谢组学 - 2019-03-02
Nature:肿瘤细胞维持基因组稳定之谜破解
与正常细胞相比,癌细胞的分裂速度相当快,其基因组“质量”却相当稳定——它们是怎么做到的?丹麦哥本哈根大学Hickson教授团队与浙江大学呼吸疾病研究所沈华浩教授团队通过合作,发现肿瘤细胞在有丝分裂期存在DNA复制行为,这是肿瘤细胞维持基因组稳定性的关键。共同第一作者、浙大医学院教授应颂敏说,正常细胞的分裂遵循经典的细胞分裂周期理论,在S
MedSci原创 - 肿瘤,基因组 - 2015-12-09
Nature:原发性和转移性脑肿瘤的单细胞空间免疫景观有助于临床决策
本文原发性肿瘤和各种固体癌症的脑转移之间的免疫景观差异和胶质母细胞瘤患者生存相关的细胞区,并确定了长期生存相关的独特的骨髓过氧化物酶阳性巨噬细胞群体,有助于临床决策和治疗的选择。
MedSci原创 - 临床决策,原发性和转移性脑肿瘤 - 2023-05-09
患者特异性和基因校正的诱导多能干细胞衍生的内皮细胞阐明了肺静脉闭塞症的单细胞表型
肺静脉闭塞症(PVOD)是肺动脉高压(PH)的一个罕见分类之一,肺内皮细胞(ECs)的功能障碍在PVOD的启动和发展中起着核心作用。
MedSci原创 - 多能干细胞,肺静脉闭塞症 - 2022-11-25
Front Immunol:单细胞分辨下系统性红斑狼疮患者外周血单核细胞染色质可及性的研究
系统性红斑狼疮(SLE)是一种多种免疫细胞参与的自身免疫性疾病。我们的目标是在单细胞分辨率下揭示SLE患者外周血单个核细胞(PBMC)染色质的可及性,并识别可能驱动异常免疫反应的转录因子(TF)。
MedSci原创 - 系统性红斑狼疮,外周血单核细胞,染色质可及性,单细胞分辨 - 2022-03-18
European Radiology:基于血栓的放射组学模型在预测心源性卒中方面的应用
放射组学将数字医学图像转化为大量的定量特征,反映了病变病理生理学的基本原因。迄今为止,基于血栓的放射组学研究揭示并鼓励血栓放射组学特征对其组成的预测,所产生的模型比标准CT特征更能预测再通的情况。
MedSci原创 - 心源性卒中,放射组学 - 2023-01-30
Osteoarthritis Cartilage:组学技术的发展促进骨关节炎的病理机制的理解
利用多组学方法整合来自不同分子检测技术的数据集,结合患者的临床和社会人口学特征、以及分子和调控网络,有望识别出独特的患者终表型。
MedSci原创 - 组学研究,骨关节炎(OA) - 2024-05-16
European Radiology:基于CCTA放射组学模型在诊断急性心肌梗死方面的价值
放射组学是指从医学图像中提取由标准模型计算出的特征,随后可以用机器学习等方法进行评估,为具有临床意义的图像找到一种新的应用方法。
MedSci原创 - 急性心肌梗死,CCTA,放射组学模型 - 2022-11-16
academic radiology:MRI放射组学模型在预测卵巢癌肿瘤残留方面的价值
高级别浆液性卵巢癌(HGSOC)是最普遍的组织学亚型。HGSOC往往在晚期被诊断出来,有广泛的腹腔内转移且没有特定的症状,因此导致疾病的高复发率和死亡率。
MedSci原创 - 卵巢癌,放射组学 - 2023-10-18
NAT MED:ICU患者中,细菌从益生菌胶囊到血液传播的基因组学和流行病学证据
最近,研究人员发现,用益生菌治疗的重症监护病房(ICU)患者与未经治疗的重症监护病房(ICU)患者相比,乳酸菌菌血症的风险明显更高。
MedSci原创 - ICU,益生菌 - 2019-11-09
European Radiology:放射组学,实现人类肺成熟度的无创胎儿MRI评估!
现阶段,胎儿MRI在评估超声检查怀疑肺部发育异常的病例中发挥着重要作用,有助于指导管理团队和家长优化围产期和产后治疗计划。
MedSci原创 - 放射组学,胎儿MRI - 2023-09-07
Plos one:低和高恶性神经胶质瘤基因组学机制差异
近日,中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室于军研究员带领其团队与吉林大学第一医院开展合作研究,比较了中国人群中低级别胶质瘤(Low-Grade Glioma,LGG)和高级别胶质瘤(High-GradeGlioma,HGG)的基因组变异,找出了肿瘤相关的不同水平的差异,比如核酸序列、基因和富集的代谢通路和细胞生物学功能。
北京基因组研究所 - 肿瘤,癌症,神经胶质瘤 - 2013-04-01
Science:首次揭示蛋白组亚细胞结构定位地图
对于人细胞中的蛋白是如何在细胞中定位的首次分析于5月11日在线发表在Science上,这项研究,揭示了在给定的一个细胞中,大部分的人类蛋白被发现存在一个以上的定位位置。Cell Atlas计划 基于瑞典的Cell Atlas计划,研究人员检查了对应大部分蛋白编码基因的人类蛋白组的空间分布,空前地详细描述了蛋白在多个细胞器和亚细胞结构中的分布。研究涉及的亚细胞区域
生物探索 - 蛋白组亚细胞 - 2017-05-17
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