CRISPR彩虹:同步实时追踪细胞内七个基因组位点
在一项新的研究中,来自美国马萨诸塞大学医学院的研究人员利用CRISPR/Cas9开发出一种新的被称作CRISPRainbow(CRISPR彩虹)的技术,这一技术允许科学家们标记和追踪活细胞中多达7个不同的基因组位点这一标记系统将是一种宝贵的工具用于实时研究基因组结构。相关研究结果于2016年4月18日在线发表在Nature Biotechnology期刊上,论文标题为“Multiplexed l
MedSci原创 - 实时,基因 - 2016-04-21
Nature Medicine:全基因组CRISPR筛选找到“癌中之王”的薄弱环节
多伦多大学的研究人员最近通过全基因组CRISPR–Cas9筛选找到了PDAC细胞的弱点,这项研究于十一月二十一日发表在Nature Medicine杂志上。
生物通 叶予 - 全基因组CRISPR筛选,“癌中之王”,薄弱环节 - 2016-11-23
Sci Rep:静脉癌栓肾细胞癌患者的基因组特性分析
最近,有研究人员观察到静脉血栓包含了数量可观的可视肿瘤细胞,他们利用多区域全外显子组测序手段对37名原发肿瘤和VTT样本,同时包括了来自5名连续性患者的正常组织样本。研究发现,原发肿瘤和VTT之间的变异异质性存在483个相关基因中的106个(22%),这些基因在原发肿瘤或者血栓中要么存在SNVs,要么存在插
MedSci原创 - 肾细胞癌,静脉血栓,基因组 - 2018-05-19
Data Brief:基因组间的数量性状基因座位点、相关性分析和重叠基因的数据集
齐齐哈尔市第一医院综合研究中心的Cui J等人近日在Data Brief杂志上发表了一篇文章,他们从80只正常小鼠的视网膜组织中获得全基因组表达数据,分析该数据,对Vegf家族中基因表达水平和基因(VegfA
MedSci原创 - 基因组,数量性状,基因座,相关性分析,重叠基因,数据集 - 2018-10-28
Cancer Research:基因组守护者的叛变:最强抑癌基因p53,竟会促进肝癌发展
该研究发现了一种新的机制——抑癌基因 p53 的表达竟会自相矛盾地促进慢性肝病患者的肝癌发展。慢性肝病(CLD)患者肝细胞中 p53 的持续激活实际上可以促进肝癌的发展。
“生物世界”公众号 - 肝癌,抑癌基因 - 2022-07-16
Nat Commun:利用流行病学和病毒基因组数据研究SARS-CoV-2在医院内传播的特征
严重急性呼吸综合征冠状病毒2已导致多家医院爆发,使医护人员和非新冠肺炎患者暴露于SARS-CoV-2感染。
MedSci原创 - SARS-COV-2 - 2022-03-02
2023 BSG/BSPGHAN共识指南:儿童和成人单基因炎性肠病的基因组诊断和护理协调
基因组医学能够识别罕见或超罕见单基因型炎症性肠病(IBD)患者,并为临床决策提供支持。单基因IBD患者常经理难治性疾病的早期发作并伴有典型免疫缺陷综合性肠外疾病。本文主要介绍了儿童和成人单基因炎性肠病
Lancet Gastroenterol Hepatol - 单基因炎性肠病 - 2023-01-25
Nature Genetics:抗药性结核分枝杆菌全基因组测序图公布
《自然—遗传学》Nature Genetics公布了从俄罗斯的某一抗药性结核病高发地区病人体内获得的结核分枝杆菌的全基因组测序图。这项大型遗传学检测让人们对高发人群中抗药性结核病的出现和进化有了深入了解。Francis Drobniewski等人从过去两年中,俄罗斯萨马拉这一多重抗药性和广谱抗药性结核病高发的地区的病人体内获得1000个结核分枝杆菌株,并对其进行了全基因组测序
中国科学报 - 结核分枝杆菌,全基因组,测序图 - 2014-02-21
Oncotarget:中国团队发现:吸烟可引起癌旁正常肺组织基因组突变
中国科学院动物研究所周光飚研究组利用“正常对照-癌组织”配对的方法,对11例肺腺癌病人及3例肺鳞癌病人的癌旁正常肺组织及对应癌组织进行全基因组测序,然后将数据与正常人基因组序列、单核苷酸多态性数据库进行比对
动物研究所 - 吸烟,基因突变 - 2017-11-07
Cell:个体化基因组测序或加速个体化疗法的开发
试想一下,假如你携带着一张存有由30亿个A、T、C、G字母组成的基因组的信用卡片,通过简单的信用卡刷卡就可以立刻帮助医生来判断药物对你自身是有益还是有害的;而这就是美国总统奥巴马起初投资2.15亿美元用于开发新型个体化疗法的目标
生物谷 - 个体化基因测序,个体化疗法 - 2015-07-17
Nat Commun:靶向测序发现前列腺癌相关的基因组结构重排
明尼苏达大学等处的研究人员使用靶向测序,在15个去势抵抗性前列腺癌患者的多个样本中研究了雄激素受体(AR)的基因位点模式。基于在这
测序中国 - 前列腺癌相关,基因组结构重排 - 2016-12-11
PLOS Genetics:基因组研究有助于识别疾病的生活方式风险
这是遗传学研究中经常被忽视的方面。 全基因组关联研究(GWAS)扫描整个基因组以确定与特定疾病相关的遗传变异。这项技术被用于识别与疾病原因相联系的生物学通路--细胞和遗传物质中发生的一系列行动和变化。 在最新发表于《PLOS Genetics》的研究中,来自布里斯托尔大学和牛津大学的研究团队表示,对疾
生物谷 - 基因组,生活方式 - 2016-02-16
新一代基因测序:整个人类基因组只需18分钟
近日有国外媒体透露,圣地亚哥一家创业公司EdicoGenome正在开发一种有望从根本上降低新一代测序(NGS)数据分析成本和时间的技术。“该技术非常有吸引力”,竟吸引来了Life Tech原CEO Gregory Lucier加入该公司1000万美元A轮融资的投资者行列。据了解,由EdicoGenome开发的Dynamic Read Analysis for Genomics (DRAGEN)生物
MedSci原创 - 测序,基因组 - 2014-07-30
我国完成首例中东呼吸综合征(MERS)病例病毒全基因组序列测定
5日从中国疾病预防控制中心获悉,中国疾控中心病毒病所与广东省及惠州市疾控中心合作,已完成我国首例输入性中东呼吸综合征(MERS)病例的病毒全基因组序列测定。6月3日凌晨,采用高通量测序方法,完成了全基因组序列测定,并于当天上传至美国国家生物技术信息中心(GenBank)数据库。序列分析结果表明,该
MedSci原创 - MERS,中东呼吸综合征,全基因组 - 2015-06-06
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