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Autophagy:湖南大学谭拥军团队发现转录因子FOXM1将<font color="red">染色质</font>DNA定位到细胞外囊泡

Autophagy:湖南大学谭拥军团队发现转录因子FOXM1将染色质DNA定位到细胞外囊泡

该研究发现转录因子FOXM1是将染色质基因或DNA片段定向到细胞外囊泡(EVs)的介质。

医药加学习班 - FOXM1,水平基因转移,细胞外囊泡DNA - 2023-11-23

Genome Biology:scIBD:识别单细胞<font color="red">染色质</font>开放性测序数据中异质双联体细胞的新工具

Genome Biology:scIBD:识别单细胞染色质开放性测序数据中异质双联体细胞的新工具

厦门大学王颖、南开大学陈盛泉课题组联合开发了一个对不同单细胞染色质开放性测序数据,进行异质双联体细胞有效识别并去除的新工具。

测序中国 - 单细胞染色质,双联体细胞 - 2023-11-08

Nature:樊荣团队发表空间分辨测序新技术,首次实现小鼠和人类组织原位<font color="red">染色质</font>可及性分析

Nature:樊荣团队发表空间分辨测序新技术,首次实现小鼠和人类组织原位染色质可及性分析

该合作团队新开发的Spatial-ATAC-seq这一基于新一代测序技术的全新空间组学技术,可用于分析完整组织切片的染色质可达性,同时保留空间信息。

测序中国 - 新一代测序技术 - 2022-08-28

Cell:中国学者首次报道人类早期胚胎发育<font color="red">染色质</font>调控的动态图谱——附三组专家点评

Cell:中国学者首次报道人类早期胚胎发育染色质调控的动态图谱——附三组专家点评

近年来,随着各种基于少量细胞的表观遗传学研究手段的快速发展,关于哺乳动物胚胎发育过程中的表观遗传学动态变化规律才得以慢慢呈现。在这方面,中国的科学家一直处于世界领先地位,特别是以北京大学汤富酬教授、清华大学颉伟教授、中科院北京基因组所刘江研究员以及同济大学高绍荣教授等为代表的研究团队都作出了大量杰出的工作,华人科学家中UCSD的任兵教授与哈佛大学张毅教授也在该领域做出了重要贡献。然而人类早期胚胎发

BioArt - 中国学者,首次,人类早期胚胎发育,染色质调控,动态图谱 - 2018-03-09

Cell子刊:张勇/朱大海/李程研究组合作揭示<font color="red">染色质</font>架构蛋白CTCF参与调控细胞命运的分子机制

Cell子刊:张勇/朱大海/李程研究组合作揭示染色质架构蛋白CTCF参与调控细胞命运的分子机制

研究表明,CTCF与细胞类型特异的先锋转录因子(pioneer transcription factor)协同形成染色质互作枢纽,共同调控谱系特异下游基因的表达,从而决定细胞分化的命运。

测序中国 - CTCF,染色质架构蛋白 - 2023-11-04

Nat Commun:循环CD8+T细胞的<font color="red">染色质</font>可及性预测胃癌患者对抗PD-1疗法的应答

Nat Commun:循环CD8+T细胞的染色质可及性预测胃癌患者对抗PD-1疗法的应答

关于持续性抗原刺激(如慢性病毒感染和肿瘤)引起的免疫细胞衰竭和肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)功能障碍的研究显示,细胞表面蛋白与免疫细胞的功能受损有关。

MedSci原创 - 胃癌,抗PD-1疗法,循环CD8+T细胞,染色质可及性 - 2021-02-18

Front Immunol:单细胞分辨下系统性红斑狼疮患者外周血单核细胞<font color="red">染色质</font>可及性的研究

Front Immunol:单细胞分辨下系统性红斑狼疮患者外周血单核细胞染色质可及性的研究

我们的目标是在单细胞分辨率下揭示SLE患者外周血单个核细胞(PBMC)染色质的可及性,并识别可能驱动异常免疫反应的转录因子(TF)。

MedSci原创 - 系统性红斑狼疮,外周血单核细胞,染色质可及性,单细胞分辨 - 2022-03-18

Nature子刊:<font color="red">染色质</font>可及性改变在儿童B-ALL的发生、药物反应和耐药复发中的重要作用

Nature子刊:染色质可及性改变在儿童B-ALL的发生、药物反应和耐药复发中的重要作用

染色质可及性的角度对复发B-ALL基因组特征进行分析,详细描绘了儿童 B-ALL 的染色质可及性图谱,发现了药物治疗相关的染色质可及性改变,并进一步确定了一组早期复发的 B-ALL 亚群。

儿童肿瘤前沿 - B细胞急性淋巴细胞白血病 - 2023-10-31

Nat Genet:前列腺癌中LSD1介导的甲基化能够促进FOXA1的<font color="red">染色质</font>结合

Nat Genet:前列腺癌中LSD1介导的甲基化能够促进FOXA1的染色质结合

FOXA1作为一个先锋转录因子,能够促进类固醇激素受体与染色质的结合,比如雄激素受体和雌激素受体,但是调控这些受体结合到染色质的机制仍旧不清楚。

MedSci原创 - 前列腺癌,甲基化,激素受体 - 2020-09-13

王纲、于淼团队合作发现:一个智力相关的重要基因突变调控<font color="red">染色质</font>的结构和特定基因表达

王纲、于淼团队合作发现:一个智力相关的重要基因突变调控染色质的结构和特定基因表达

已报道的MED23点突变的病例表现出头小畸形、语言迟缓、认知障碍等缺陷,然而其发病机制并不明确。

深究科学 ID: deepscience - 基因突变,染色质 - 2023-02-06

Sci Rep:膀胱癌开放<font color="red">染色质</font>区域分析阐释β-catenin变异和Wnt信号与膀胱癌神经元亚型的联系

Sci Rep:膀胱癌开放染色质区域分析阐释β-catenin变异和Wnt信号与膀胱癌神经元亚型的联系

膀胱尿道癌是最常见的膀胱癌,每年影响40多万人。在组织病理学上,它主要分为肌层浸润性膀胱癌(MIBC)和非肌层浸润性膀胱癌(NMIBC)。最近,主要由TCGA等联盟推动的研究揭示了MIBC和NMIBC

MedSci原创 - 膀胱癌,染色质,表观调控 - 2020-11-12

Cell Reports :李国红/许雪青合作揭示静息态基因的<font color="red">染色质</font>结构特征并提出预测基因转录潜能的新方法

Cell Reports :李国红/许雪青合作揭示静息态基因的染色质结构特征并提出预测基因转录潜能的新方法

染色质结构的动态性和可塑性在基因转录沉默和激活过程中起重要作用,从而为表观遗传提供一个重要的信息整合平台。然而,迄今为止,静息态染色质的结构特征还未见报道,且这种状态与基因转录潜能的关系还不甚清楚。

BioArt - 基因转录,静息态基因,染色质结构 - 2020-07-29

Nature子刊:上海交通大学吴强团队发现拓扑相关结构域内<font color="red">染色质</font>相互作用和基因调控的新机制

Nature子刊:上海交通大学吴强团队发现拓扑相关结构域内染色质相互作用和基因调控的新机制

该研究数据突出了CTCF TAD边界内外向型CBS元件在发育基因调控中的关键作用,并对TAD边界内聚集CTCF位点的组织原则具有意义。

iNature - 基因调控,拓扑相关结构域,CBS元件 - 2023-12-15

Nature Genetics | DeepLoop:利用低深度Hi-C数据绘制人类基因组等位基因特异性<font color="red">染色质</font>互作图谱

Nature Genetics | DeepLoop:利用低深度Hi-C数据绘制人类基因组等位基因特异性染色质互作图谱

研究团队开发了DeepLoop,执行严格的偏差校正,通过基于深度学习的信号增强,从低深度Hi-C数据中实现稳健的染色质相互作用映射。

测序中国 - 等位基因,基因图谱,低深度Hi-C数据 - 2022-08-09

染色质免疫沉淀-测序(ChIP-seq):全基因组范围研究蛋白质-DNA相互作用的新技术

 染色质免疫沉淀-测序(ChIP-seq)是近年来新兴的将染色质免疫沉淀(ChIP)与深度测序技术相结 合,在全基因组范围内分析DNA结合蛋白结合位点、组蛋白修饰、核小体定位和DNA甲基化的高通量技术

生物化学与生物物理学进展 - ChIP,seq,染色质免疫沉淀,基因组 - 2014-01-03

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