NATURE：心脏发生的单细胞分析揭示了器官水平发育缺陷的基础
器官发生涉及多种细胞类型的整合。细胞类型特异性基因网络的失调导致出生缺陷，其影响5％的活产。先天性心脏缺陷是最常见的畸形。
MedSci原创 - 心脏发育 - 2019-07-27
重磅消息: 国内学者首次在单细胞水平上追踪造血干细胞（HSC）的形成
造血干细胞（HSC）移植（常见的有骨髓移植）是治疗血液系统恶性疾病，包括白血病和一些血液遗传病最有效的途径之一，但骨髓移植对配型的要求以及供体的不足使其在临床应用中受到很大的限制。科学家们一直试图绕过这些限制，比如在体外培养HSC使其增殖，或者将其他类型的细胞（如皮肤细胞）转化成HSC，但都没能获得成功，其中最重要的原因是由于目前人们对HSC发育过程中的调控机制了解得还很不清楚。
中国生物物理学会 - 造血干细胞 - 2016-05-20
Nat Med：张泽民研究组与合作者发表单细胞水平的肺癌 T 淋巴细胞免疫图谱
肺癌被称为“癌中之王”，其发病率和致死率在所有癌症中均居首位，其中 85% 的肺癌属于非小细胞肺癌。考虑到肿瘤微环境的复杂性，近年来单细胞转录组测序技术逐渐被广泛应用于肿瘤浸润免疫细胞的研究当中。
生物360 - 非小细胞肺癌，基因诊断l，图谱 - 2018-06-27
Genome Biol综述 | 多模态和单细胞/亚细胞水平空间组学技术的现状及发展前景
空间组学领域在过去几年蓬勃发展，并从根本上提高了原位实验的广度和分辨率。这些技术现在可以在50-100nm的空间分辨率下检测超过10,000个独特的基因靶点。
测序中国 - 多模态和单细胞，亚细胞水平空间组学技术，空间组学实验 - 2022-12-29
首次在单细胞水平描绘肝癌微环境中的免疫图谱
2017年6月16日，北京大学生命科学学院BIOPIC中心、北京未来基因诊断高精尖创新中心、北大-清华生命科学联合中心张泽民研究组，首都医科大学附属北京世纪坛医院暨北京大学第九临床医学院肝胆胰外科彭吉润研究组，以及美国AMGEN公司的欧阳文军研究组在Cell杂志发表了题为“Landscape of infiltrating T cells in liver cancer revealed by s
生物探索 - 肝癌，免疫 - 2017-06-17
单细胞测序应用及技术实例
作为“在单个细胞水平上对基因组进行测序”的单细胞测序技术能够解决上述难题。与传统的全基因组测序相比，单细胞测序不仅测量基因表达水平更加精确，而且还能检测到微量的基因表达子或罕见非编码RNA，其优势是全方位和多层次的。与此同时，测序巨头相继推出新一代测序仪，为单细胞测序提供利器，越来越多与单细胞测序有关的研究也发表在顶级期刊上，这些都表明，单细胞测序已逐渐成为科研热点。单细胞测序应用及技术实例单
MedSci原创 - 单细胞测序 - 2017-03-07
Science：单细胞测序细分肿瘤亚型
美国麻省总院和Broad研究所合作发表在3月31日Science杂志上对两种脑肿瘤亚型的详细分析显示，它们起源于神经祖细胞的相同类型，由基因突变模式和其微环境的组成分而区分开。
生物探索 - 肿瘤，单细胞测序 - 2017-04-04
Clin Cancer Res：多重免疫荧光鉴定前列腺癌单细胞水平的PI3K通路激活
鉴别高PI3K通路活性的癌症对于PI3K抑制剂的治疗选择和临床试验的准入资格至关重要。肿瘤信号通路活性的评估需要考虑肿瘤内异质性和多重调控点。
MedSci原创 - 前列腺癌，单细胞，石蜡包埋，多重免疫荧光，PI3K通路 - 2020-10-04
Genome Med：浙江大学沈宁团队发表实现单细胞水平肿瘤细胞群突变与表达异质性的同步研究算法
该论文报道了一种高精确度直接从scRNA-seq数据中提取体细胞突变的算法框架RESA，该算法在多种类型的不同来源的癌症单细胞数据集上进行测试，均取得了较高的精确度。
测序中国 - 癌症，细胞群突变，表达异质性 - 2023-12-27
单细胞测序的方法和应用
单细胞测序的应用过去二十几年里，随着基因测序技术水平的提高以及千人基因组计划、癌症基因组计划、Meta-Hit计划等重大国际合作项目的相继开展，基因组研究日渐被 推向高潮。然而，迄今为止使用的测序材料无一例外都是数百万甚至更多细胞的混合DNA样本。这种方法能够得到全基因组序列信息，但是对其进行研究得到的结 果只是一群细胞中信号的平均值，或者只代表其中占优势数量的细胞信息，单个细胞独有的特性
MedSci原创 - 单细胞测序 - 2014-04-06
单细胞转录组研究进展
单细胞转录组分析以单个细胞为特定研究对象，提取mRNA进行逆转录、放大和高通量测序分析，能揭示该细 胞内整体水平的基因表达状态和基因结构信息，准确反映细胞间的异质性，深入理解其基因型和表型之间的相互关系，在发育生物学、基础医学、临床诊断和药物开 发等领域都发挥重要作用．本文主要介绍了单细胞转录组分析的特点和技术发展历史以及常用研究策略和不同技术的优缺点，并就其面临挑战
生物化学与生物物理学进展 - 转录组，单细胞转录组 - 2014-01-03
单细胞RNA测序--TargetAmp法、SMART法
TargetAmp法测单细胞全RNA Illumina旗下的EpiCentre公司开发的TargetAmp方法，可以把少量RNA（最少到1个细胞，约10pg）扩增到ng级，以达到可以进行高通量测序所需的核酸量
陈巍学基因 - 单细胞测序，SMART - 2014-04-06
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