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Science: 利用HI-C <font color="red">3D</font><font color="red">基因组</font>组装虫媒<font color="red">基因组</font>

Science: 利用HI-C 3D基因组组装虫媒基因组

研究人员利用一种名叫“3D基因组组装”的突破性技术,组装出了传播寨卡病毒和西尼罗病毒的两种蚊虫的3条染色体。研究人员Hi-C数据与现有的草稿组合进行组合,以生成染色体长度的scaffold。并且通过组装人类基因组(从头到尾)从单纯阅读(67X覆盖)来验证这种方法。然后研究人员用该方法与草图序列相结合,以组装埃及伊蚊和致倦库蚊的基因组。这些组件表明,这些物种中几乎所有的基因组重排都发生在染色体臂内,

MedSci原创 - HI-C,3D基因组 - 2017-04-16

Nature子刊 | 浙江大学阮一骏等团队合作开发新的方法,用于低细胞输入的<font color="red">3D</font><font color="red">表观</font><font color="red">基因组</font>的绘制

Nature子刊 | 浙江大学阮一骏等团队合作开发新的方法,用于低细胞输入的3D表观基因组的绘制

通过使用ChIA-PET,Hi-C及其衍生物的近距离连接,染色质相互作用的全基因组图谱已经能够将基因与它们的顺式调控元件连接起来。

iNature - 3D表观基因组,低细胞输入 - 2023-01-16

ARD:与系统性红斑狼疮疾病活动相关的T细胞<font color="red">3D</font><font color="red">基因组</font>改变

ARD:与系统性红斑狼疮疾病活动相关的T细胞3D基因组改变

这篇研究旨在阐明3D基因组结构及其在系统性红斑狼疮(SLE)失调的基因表达网络中的作用,揭示表观遗传机制并突出染色体结构、遗传变异和基因表达控制之间的关系在SLE的发病机制中的作用。

MedSci原创 - 系统性红斑狼疮,T细胞,遗传变异,3D基因组结构 - 2022-09-20

Nat Commun:乳头状肾细胞癌的<font color="red">基因组</font>和<font color="red">表观</font><font color="red">基因组</font>进化史

Nat Commun:乳头状肾细胞癌的基因组表观基因组进化史

肿瘤内异质性和肿瘤的进化在透明细胞肾细胞肿瘤(ccRCC)中已经有了很详细的描述,但是在肾脏癌症其他亚型中很少研究。

MedSci原创 - 肾细胞癌,遗传变异,亚型 - 2020-07-06

神奇的医学<font color="red">3D</font>人体美图(<font color="red">组</font>图)

神奇的医学3D人体美图(图)

女性乳房、乳腺子宫里的胎儿肾脏颈部脊柱、神经肋骨神经元细胞蚊子在人体皮肤表面吸血面部神经下体神经分布神经元人体骨骼蚊子吸血过程尘螨头颅、颈椎大脑血管男性下体头颅神经元颈椎、大脑

弗锐达医疗器械资讯 - 医学,人体美图 - 2015-04-13

<font color="red">表观</font><font color="red">基因组</font>---“中国人群精准医学研究计划”内核

表观基因组---“中国人群精准医学研究计划”内核

该计划是由中科院北京基因组研究所牵头、多个院所参加的。这支交叉学科团队将在4年内完成4000个志愿者的DNA样本和多种表现型数据的采集,并对其中2000人进行深入的精准医学研究。除了全基因组序列分析,还将建立基因组健康档案和针对一些重要慢性病的遗传信号开展疾病风险和药物反应的预警和干预研究,“中国人

中国科学报 - 精准医学,表观基因组 - 2016-01-24

JCEM:母体血糖升高对新生儿<font color="red">表观</font><font color="red">基因组</font>的影响

JCEM:母体血糖升高对新生儿表观基因组的影响

后代表观基因组的变化可以反映宫内血糖暴露的影响和反应,并可能对儿童产生不同的后果。

MedSci原创 - 新生儿,血糖升高,表观基因组 - 2021-10-14

Nat Commun:食品防腐剂可融入培养细胞的<font color="red">表观</font><font color="red">基因组</font>

Nat Commun:食品防腐剂可融入培养细胞的表观基因组

《自然-通讯》近日发表的一项研究Lysine benzoylation is a histone mark regulated by SIRT2表明,食品防腐剂苯甲酸钠能通过培养细胞融入其表观基因组——表观基因组基因组中调控基因表达的一系列标记物。

Nature自然科研 - 食品防腐剂,培养细胞,表观基因组 - 2018-08-29

Cell Rep:<font color="red">表观</font><font color="red">基因组</font>可作一种治疗策略来预防视力丧失

Cell Rep:表观基因组可作一种治疗策略来预防视力丧失

导言:近日,国立卫生研究院的一部分,美国国立眼科研究所(NEI)的研究人员对光感小鼠感光细胞的表观基因组变化进行了分析,从而更加清晰地了解了与年龄相关的眼部疾病可能与年龄相关的基因表达调控的变化相关联

转化医学网 - 视力丧失 - 2020-04-24

Nat Med:全<font color="red">基因组</font>种系与前列腺癌<font color="red">表观</font>遗传背景相关

Nat Med:全基因组种系与前列腺癌表观遗传背景相关

最近,有研究人员在589个局部前列腺肿瘤中量化了种系多样性对体细胞表观基因组的影响。研究发现,倾向性风险位点影响了肿瘤的表观基因组,揭示了癌症易感性的机制。

MedSci原创 - 前列腺癌,种系,遗传背景 - 2019-10-07

Nat Genet:前列腺癌转移过程重新激活发育<font color="red">表观</font><font color="red">基因组</font>程序

Nat Genet:前列腺癌转移过程重新激活发育表观基因组程序

表观遗传过程能够控制前列腺癌(PCa)生物学,可由PCa细胞对雄激素受体(AR)(一个前列腺主调控转录因子)的依赖来证实。

MedSci原创 - 前列腺癌,表观遗传,调控元件 - 2020-08-08

Acta Neuropathologica: 神经鞘瘤病的<font color="red">表观</font>遗传学、<font color="red">基因组</font>学和转录<font color="red">组</font>学

Acta Neuropathologica: 神经鞘瘤病的表观遗传学、基因组学和转录

神经鞘瘤病(SWNTS)是一种遗传性肿瘤易感综合征,是神经纤维瘤病的一种形式。

MedSci原创 - 神经鞘瘤病,LZTR1,基因组学 - 2020-10-13

Brit J Cancer:抗癌治疗与儿童癌症幸存者<font color="red">表观</font><font color="red">基因组</font>变化有关

Brit J Cancer:抗癌治疗与儿童癌症幸存者表观基因组变化有关

这些新的甲基化变化可以作为生物标记物,用于评估治疗的正常细胞毒性,并预测CCS患者的长期健康结局。

MedSci原创 - 抗癌治疗,表观基因组,儿童癌症幸存者 - 2022-04-06

Dev cell:揭秘肝再生新方法,解除<font color="red">表观</font><font color="red">基因组</font>修饰的刹车装置!

Dev cell:揭秘肝再生新方法,解除表观基因组修饰的刹车装置!

通过敲除表观基因组中抑制“跳跃基因”(即转座子)的一个元件(Uhrf1),可以重新分配表观遗传标记,解除肝再生的抑制,从而加快肝脏再生的过程。这项研究对于开发具有促进肝再生功能的药物具有重要的意义。

转化医学网 - 肝再生,表观基因 - 2019-07-04

Cancer Cell:前列腺癌中<font color="red">基因组</font>大片区域受到<font color="red">表观</font>遗传调控激活

Cancer Cell:前列腺癌中基因组大片区域受到表观遗传调控激活

由澳大利亚Garvan医学研究所Susan Clark教授领导的一个研究小组在新研究中揭示:前列腺癌中基因组的大片区域(约达到2%)受到了表观遗传调控激活。激活区域包含许多前列腺癌特异基因,例如前列腺癌最常见的标志物PSA(前列腺特异抗原)和PCA3等。直到现在,人们都并不清楚这些基因是通过表观遗传调控。 Clark教授

Cancer Cell - 肿瘤,癌症 - 2013-01-09

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