Mol Cell：薛愿超团队开发CRIC-seq技术，揭示PTBP1调控可变剪接新机制
在哺乳动物细胞中，前体mRNA能够通过可变剪接产生多种异构体，以执行相似或不同的生物学功能。可变剪接的异常与恶性肿瘤和神经退行性疾病等重大疾病的发生密切相关。
“生物世界”公众号 - PTBP1，CRIC-seq技术 - 2023-03-27
Science：开发出TT-Seq技术绘制人类瞬时转录组图谱
基因之间的序列长期以来被视为“垃圾DNA”，我们如今知道它们也发挥着至关重要的功能。这些DNA区域发生的突变能够严重地对人类发育造成损害，而且可能在生命后期导致严重疾病。然而，在此之前，调节性DNA序列一直很难发现。如今，在一项新的研究中，德国慕尼黑理工大学计算生物学教授Julien Gagneur团队和德国马克斯普朗克生物物理化学研究所教授Patrick Cramer团队如今开发出一种方法可
生物谷 - TT-Seq技术，人类瞬时转录 - 2016-06-04
ATAC-seq技术再升级：单分子测序平台联手单细胞染色质可及性测序技术
基于二代测序平台(NGS)的scATAC-seq技术利用Tn5酶的DNA随机打断功能，可以富集染色质局部开放区域上的基因组DNA短片段（通常80-300 bp），这些短片段被当作开放染色质的信号。
iNature - ATAC-seq技术再升级，单分子测序，单细胞染色质可及性测序技术 - 2022-11-13
中国科学院上海免疫与感染研究所晁彦杰课题组《自然·通讯》：开发出解析微生物活细胞RNA-RNA互作图谱的新技术iRIL-seq
该研究开发了一项全新的RNA互作组高通量研究技术，使用该技术能在微生物活细胞内快速鉴定RNA-RNA分子间相互作用，在转录后水平发现新的基因调控机制。
BioMed科技 - RNA互作组高通量研究技术，RNA互作网络图谱 - 2023-12-13
单细胞研究指南：测序方法大比拼
那么，细胞之间的哪些差异有生物学意义，哪些差异来自于技术偏好呢？要获得可靠的结果又需要研究多少细胞呢？这些问题曾经是单细胞
Ebiotrade - 单细胞，测序方法 - 2016-05-18
单细胞转录组测序技术在非小细胞肺癌免疫微环境分析中应用的研究进展
根据2020年的数据[1]，肺癌是世界上第二常见的癌症，同时也是癌症死亡的最重要原因。与小细胞肺癌相比，非小细胞肺癌（non-small cell lung cancer，NSCLC）更为常见[2]。
中国胸心血管外科临床杂志 - 单细胞转录组，非小细胞肺癌，免疫微环境 - 2024-03-17
Nat Protoc | 陈亮/付向东合作组报道R-loop的新测序技术
当新生RNA与模板DNA通过碱基互补配对形成杂合链时，另外一条非模板DNA链将处于单链状态，由此形成的三链核酸结构称为R-loop。R-loop广泛存在于细菌、真菌、植物与动物的基因组中，并具有广泛的生物学意义。现已知R-loop在基因转录、DNA复制、表观遗传修饰以及DNA损伤修复等过程中都具有重要作用，是具有调控功能的核酸结构，而R-loop的水平紊乱则常会导致转录与复制失调以及基因组稳定性下
BioArt - R-loop，新测序，技术 - 2019-04-21
Nature：新技术 “解密” 非编码 RNA
人类基因组计划研究表明，人类基因组中只有不到 2% 的蛋白质编码序列，而剩余 98% 为非编码核酸序列。这些非编码序列可能有功能，也可能仅仅是副产物，曾被称为 “垃圾 DNA” 或者“暗物质”。
中国科学网 - 非编码RNA，新技术 - 2020-05-08
华大基因开发新型空间染色质可及性测序工具SCA-seq，以单分子分辨率捕获表观遗传信息同时解析基因组构象
SCA-seq利用纳米孔技术对包含染色质可及性、CpG甲基化和染色质构象信息的长片段进行测序，在单分子分辨率上将染色质可及性和CpG甲基化映射到基因组空间结构，同时解析基因组构象。
测序中国 - 测序，空间染色质，SCA-seq - 2023-12-22
Nat Cell Biol:新一代单细胞itChIP技术解析早期胚胎细胞命运决定机制
北京大学分子医学研究所、北大-清华生命科学联合中心何爱彬组在《Nature Cell Biology》在线发表了题为Profiling chromatin state by single-cell itChIP-seq的文章，报道了利用一种全新的普适性，易操作的单细胞ChIP-seq技术解析早期胚层和器官发育中细胞命运的选择决定机制，并将这一方法命名为itChIP（simult
中国生物技术网 - 单细胞，itChIP技术，早期胚胎细胞，机制 - 2019-09-05
Sci Rep：在间叶细胞区中能够调控前列腺器官生成基因表达的鉴定
最近，有研究人员为了鉴定间质区域中通路的活性，利用了组织和单细胞测序明确了间叶细胞区域和区域特异性转录本的表达，并且还利用了Tag-seq和RNA-seq技术在雌性小鼠的腹侧间质细胞区（VMP）和临近的尿道转录本在雌性VMP中的丰度是通过显微切割组织的Tag-seq、细胞群体和
MedSci原创 - 前列腺，器官生成，间叶细胞，转录本分析 - 2017-12-14
RNA-seq技术揭示与前列腺癌有关的新型融合基因
973首席科学家第二军医大学上海长海医院孙颖浩教授运用RNA-seq技术首次对中国人前列腺癌及癌旁组织进行系统研究，发现新型融合基因、癌相关长链非编码RNA、异构体和点突变。研究
MedSci原创 - 前列腺癌，融合基因 - 2012-03-21
染色质免疫沉淀-测序(ChIP-seq)：全基因组范围研究蛋白质-DNA相互作用的新技术
染色质免疫沉淀-测序(ChIP-seq)是近年来新兴的将染色质免疫沉淀(ChIP)与深度测序技术相结 合，在全基因组范围内分析DNA结合蛋白结合位点、组蛋白修饰、核小体定位和DNA甲基化的高通量技术．在新一代测序(NGS)技术的大力推动 下，ChIP-seq提供了一种相对于ChIP-chip高分辨率、低噪音、高覆盖率的研究方法．随着测序成本的降低，ChIP-seq逐步成为研究基因
生物化学与生物物理学进展 - ChIP，seq，染色质免疫沉淀，基因组 - 2014-01-03
CLIP-seq—动物miRNA靶基因筛选新方法
CLIP-seq，即紫外交联免疫沉淀结合高通量测序(crosslinking-immunprecipitation and high-throughput sequencing),是一项在全基因组水平揭示RNA分子与RNA结合蛋白相互作用的革命性技术。
MedSci原创 - CLIP-seq，miRNA - 2014-01-10
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