Nat Cell Biol:新一代单细胞itChIP技术解析早期胚胎细胞命运决定机制
北京大学分子医学研究所、北大-清华生命科学联合中心何爱彬组在《Nature Cell Biology》在线发表了题为Profiling chromatin state by single-cell itChIP-seq的文章，报道了利用一种全新的普适性，易操作的单细胞ChIP-seq技术解析早期胚层和器官发育中细胞命运的选择决定机制，并将这一方法命名为itChIP（simult
中国生物技术网 - 单细胞，itChIP技术，早期胚胎细胞，机制 - 2019-09-05
Front Immunol：强直性脊柱炎患者外周血单个核细胞的整合单细胞RNA-SEQ和ATAC-SEQ分析
强直性脊柱炎(AS)是一种免疫介导的脊柱关节病。该研究集中在T细胞如何参与AS的发病机制，这将丰富AS单细胞研究的数据，为理解AS的发病机制提供新的视角。
MedSci原创 - 强直性脊柱炎，整合单细胞RNA-SEQ，ATAC-SEQ - 2022-02-19
Sci Transl Med：“液体活检”可捕捉癌性突变
5月30日，国际著名杂志Science Translational Medicine在线刊登的一项新的研究报告中指出，一种新的基因测序技术可能比用传统的肿瘤活检来发现癌性突变更安全及廉价。这种叫做"TAm-Seq"的技术可通过收集血浆中循环的DNA片段，放大那些与癌症相关联的DNA部分并深入挖掘基因序列来发现那些难以辨认的突变。
EurekAlert! - 肿瘤，癌症 - 2012-06-09
Nature Communications：西湖大学马丽佳团队开发新型CRISPR脱靶和DNA易位检测工具
CRISPR-Cas基因编辑依赖于向导RNA（gRNA）的识别和靶向，gRNA的非特异性靶向可能会引入意料之外的脱靶编辑，从而导致细胞遗传毒性。
“生物世界”公众号 - CRISPR，马丽佳 - 2022-12-14
NBT：上海交通大学杨朝勇/吴玲玲/宋佳/郑军华开发新的方法，实现高灵敏空间转录组学测序
该研究报道了一种用于空间RNA测序(Decoder-seq)的树状细胞DNA坐标条形码设计，该设计具有高灵敏度和高分辨率。
iNature - 测序，空间转录组学 - 2024-01-18
J Clin Invest：发现前列腺细胞命运决定的机制，与前列腺癌细胞的管腔细胞表型高度相关
肿瘤的起始和进展过程中往往伴随着肿瘤细胞的退分化现象，但早期对去势治疗敏感的前列腺癌细胞却维持着终末分化的管腔细胞表型。研究表明前列腺癌细胞中基因突变较少，但是却都存在大量的染色体缺失、重排等异常现象
BioArt - 融合基因，前列腺癌细胞，基因重排 - 2020-07-31
CLIN CHEM：通过错误校正循环肿瘤DNA测序重建超灵敏突变检测和全基因组DNA拷贝数
循环免费DNA测序（cfDNA-Seq）可以描绘癌症基因组结构，对于准确检测通常具有低变异频率的突变，仍需要高灵敏度和特异性技术。在此，研究人员开发了一种可定制的杂交捕获cfDNA-Seq技术，该技术使用现成的分子条形码和一种新的双链DNA分子鉴定工具用于提高错误校正。结果显示，基于来自58名患者的cfDNA含量的建模表明，该技术仅需要25ng的cfDNA即可以应用于> 95
MedSci原创 - 超灵敏突变，检测 - 2018-11-02
Nature Microbiology：单细胞大规模并行多路微生物测序识别罕见的细菌种群和描述噬菌体感染
本文将M3-seq应用于数十万个细胞，揭示了罕见的种群以及与压力反应和噬菌体感染特征相关的赌注对冲的见解。
MedSci原创 - 单细胞大规模并行多路微生物测序，细菌种群，噬菌体感染 - 2023-10-05
Nature：樊荣团队发表空间分辨测序新技术，首次实现小鼠和人类组织原位染色质可及性分析
该合作团队新开发的Spatial-ATAC-seq这一基于新一代测序技术的全新空间组学技术，可用于分析完整组织切片的染色质可达性，同时保留空间信息。
测序中国 - 新一代测序技术 - 2022-08-28
林兰/邢毅团队发表一种通用、低成本的靶向长读长RNA测序技术
文章报道了新开发的靶向长读长RNA测序技术TEQUILA-seq。
测序中国 - TEQUILA-seq，靶向长读长RNA测序技术 - 2023-08-13
Nature子刊：液体活检用于早筛新方法
在这篇文章描述了如何实现完整的DM-Seq方法来直接对5mC进行单独测序。与TAPS的比较发现了5mC检测的偏差，可能是由于DHU碱基的聚合酶扩增不良。
小桔灯网 - 液体活检 - 2023-08-04
RNA-seq方法原理、数据分析、数据库及工具全面介绍
bsp;- De novo assembly of short reads with robust error correction. An improvement on early versions of SSAKE. * Velvet - Velvet is a de novo genomic assembler specially designed for sho
MedSci原创 - RNA-Seq，数据，数据库 - 2014-01-04
Nature：纳米孔测序技术的发明人再发明单分子互作测序
随着技术的发现，大规模并行DNA测序得到了广泛的应用，为许多研究领域带来了一场革命。然而，高通量的蛋白质分析仍然困难重重，现在亟需高质量低成本的蛋白分析技术。为此，遗传学界的大牛George M.Church领导哈佛医学院的团队，开发了一种单分子互作测序（SMI-seq）技术。该技术能够实现单分子水平上的并行分析，获得大量蛋白质的互作图谱。
MedSci原创 - 纳米孔，单分子 - 2014-10-04
基于RNA-Seq的长非编码RNA（lncRNA）预测
随着新一代生物技术和生物信息学的发展，研究发现在真核生物转录组中存在大量长非编码RNA（long non-coding RNA, lncRNA），而这些lncRNA可能在基因表达调控过程中起到关键性的功能作用 当前lncRNA研究主要采用高通量RNA-Seq测序技术，并通过生物信息学方法对测序数据进行处理和分析，以挖掘其中lncRNA的序列、结构、表达及功
生物化学与生物物理学进展 - RNA-Seq，长非编码RNA - 2014-01-03
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