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PNAS:谢晓亮课题组开发新型单细胞<font color="red">甲基化</font>与羟<font color="red">甲基化</font><font color="red">测序</font>技术

PNAS:谢晓亮课题组开发新型单细胞甲基化与羟甲基化测序技术

该研究利用该技术描绘了小鼠早期胚胎发育过程中甲基化、羟甲基化以及半甲基化修饰的动态变化,揭示了小鼠早期胚胎甲基化重编程过程中主动/被动去甲基化的活力变化以及参与父母本基因表达调控机制的差异。

测序中国 - DNA甲基化,单细胞甲基化,羟甲基化测序技术 - 2023-12-19

PNAS:北京大学谢晓亮团队开发新型单细胞<font color="red">甲基化</font>与羟<font color="red">甲基化</font><font color="red">测序</font>技术

PNAS:北京大学谢晓亮团队开发新型单细胞甲基化与羟甲基化测序技术

该研究提出了一种无亚硫酸氢盐的单细胞全基因组5mC和5hmC分析技术,命名为Cabernet,它可以在高基因组覆盖率下以单碱基分辨率表征5mC和5hmC。

iNature - 测序,单细胞甲基化,羟甲基化 - 2023-12-28

Sci:单细胞<font color="red">甲基化</font><font color="red">测序</font>助你区分神经元

Sci:单细胞甲基化测序助你区分神经元

近日,Salk生物研究所领导的团队根据甲基化和调控特征,区分小鼠和人类大脑样本中的神经元亚型,并鉴定出人类额叶皮质中一组新的神经元。这项成果于周五发表在《Science》杂志上。

生物通 - 甲基化测序,单细胞,神经元 - 2017-08-11

Nat Commun:<font color="red">甲基化</font><font color="red">测序</font>捕捉三阴性乳腺癌表观遗传特性

Nat Commun:甲基化测序捕捉三阴性乳腺癌表观遗传特性

Nature Communications上的研究报告中,来自澳大利亚悉尼加文医学研究所(Garvan Institute of Medical Research)的科学家们通过将乳腺癌患者机体的乳腺癌甲基化组同健康个体进行比较从而绘制出了一种新型的基因组图谱,其可以帮助揭示DNA如何被甲基化基团进行修饰,即DNA的甲基化过程。

生物谷 - 三阴性乳腺癌,甲基化测序 - 2015-02-05

Nature Genetics:林东昕/郑健团队等首次揭示RNA<font color="red">甲基化</font>可调控DNA<font color="red">甲基化</font>

Nature Genetics:林东昕/郑健团队等首次揭示RNA甲基化可调控DNA甲基化

DNA甲基化修饰改变引起的基因表达改变在肿瘤的发生发展中起重要作用。例如,癌细胞基因组常常有癌基因的低甲基化和抑癌基因的高甲基化改变,但DNA甲基化改变的机制目前并不完全清楚。

“生物世界”公众号 - DNA甲基化,RNA甲基化 - 2022-10-20

Blood:新型去<font color="red">甲基化</font>药物OR-2100靶向治疗DNA异常超<font color="red">甲基化</font>驱动的ATL白血病

Blood:新型去甲基化药物OR-2100靶向治疗DNA异常超甲基化驱动的ATL白血病

成人T细胞白血病-淋巴瘤(ATL)是一种由人T细胞淋巴病毒-1(HTLV-1)转化的侵袭性的CD4+T细胞血液恶性肿瘤。大部分HTLV-1感染的个体无症状,仅3-5%的HTLV-1携带者会发展成ATL

MedSci原创 - 地西他滨,超甲基化,ATL白血病 - 2020-06-06

Genome Biol:ONT、PacBio长读长<font color="red">测序</font>CpG<font color="red">甲基化</font>检测工具的系统比较

Genome Biol:ONT、PacBio长读长测序CpG甲基化检测工具的系统比较

首次对长读长测序的CpG甲基化检测工具进行了系统比较,包括最新的ONT R10.4流动槽化学测序、氧化亚硫酸盐测序(oxBS)以及SMRT测序

测序中国 - 甲基化,CpG,长读长测序 - 2024-04-17

Nature:体重指数与DNA<font color="red">甲基化</font>相关!

Nature:体重指数与DNA甲基化相关!

虽然目前对肥胖及其相关临床条件的机制了解甚少,但是最近的研究表明肥胖可能会影响DNA甲基化,DNA甲基化是基因表达和分子表型的关键调节器。近期,一项发表在Nature杂志上的文章使用了表观基因组证实:身体质量指数(BMI)与DNA甲基化的广泛

MedSci原创 - 体重指数,肥胖,DNA - 2016-12-25

Clin Chem:<font color="red">甲基化</font>CpG串联扩增<font color="red">测序</font>法可用于检测大肠癌循环游离DNA

Clin Chem:甲基化CpG串联扩增测序法可用于检测大肠癌循环游离DNA

在人类结直肠癌(CRC)基因组中,CpG岛的异常DNA高甲基化最为常见。因此,利用循环游离DNA (cfDNA)进行全基因组DNA高甲基化分析技术,对CRC的早期无创检测和CRC与其他癌症类型的鉴别具有重要的应用价值。采用甲基化CpG串联扩增测序(MCTA-Seq)方法,采用完全甲基化分子算法,对CRC患者(n = 147)和对照组(n = 136)的血浆样本,以及癌症和癌旁非癌组织样本(

MedSci原创 - 癌循环游离DNA,甲基化 - 2019-07-20

Nature:体重超重影响DNA<font color="red">甲基化</font>

Nature:体重超重影响DNA甲基化

在假期你增加的额外体重将不仅出现在你的臀部,而且也会影响你的DNA。这是德国亥姆霍兹慕尼黑中心合作的一项大规模国际研究的结果。它表明较高的身体质量指数(BMI)会导致人基因组中将近200个位点发生表观遗传变化,从而影响基因表达。相关研究结果于2016年12月21日在线发表在Nature期刊上,论文标题为“Epigenome-wide association study of body mass i

生物谷 - 超重,DNA甲基化 - 2016-12-26

Genome Biology | 纳米孔<font color="red">测序</font>可用于检测cfDNA的细胞起源和癌症特异性<font color="red">甲基化</font>特征

Genome Biology | 纳米孔测序可用于检测cfDNA的细胞起源和癌症特异性甲基化特征

该研究结果表明,基于cfNano和Illumina的WGS和WGBS方法在检测DNA甲基化、片段和CNA的癌症特异性特征方面性能基本一致。

测序中国 - 细胞起源,纳米孔测序,检测cfDNA - 2022-08-09

甲基化DNA免疫共沉淀测序原理及简介(MeDIP-seq)

MeDIP-Seq(Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing)测序是基于抗体富集原理进行测序的全基因组甲基化检测技术,采用甲基化DNA免疫共沉淀技术,通过5'-甲基胞嘧啶抗体特异性富集 基因组上发生甲基化的DNA片段,然后通过高通量测序可以在全基因组水平上进行高精度的CpG密集的高甲基化区域研究。

MedSci原创 - 甲基化,免疫共沉淀 - 2014-02-05

DNA甲基化检测技术应用与技术比较

DNA甲基化作为表观遗传学研究的重要范畴,已经越来越受到研究者的关注。近些年来,随着DNA甲基化与组蛋白甲基化的联合作用机制、RNA干扰机制及去 甲基化机制的发现,使得DNA甲基化研究受到广泛关注,从医学领域扩展到动植物研究当中,同时在研究方法上也取得了很大的突破。现在用于DNA甲基化检测 的方法大概有十多种,从应用上来分,大致可以分成两类:全基因组甲基化分析及特异位点甲基化检测。下面,我

MedSci原创 - DNA甲基化,检测 - 2014-02-05

CHM :DNA甲基化暴露疟原虫致命弱点

研究显示,基因组中的低水平DNA甲基化,对于寄生虫的生存非常关键。文章发表在Cell旗下的Cell Host

生物通 - 疟原虫,青蒿素,DNA甲基化,阿尔茨海默症 - 2013-12-13

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