PNAS:谢晓亮课题组开发新型单细胞甲基化与羟甲基化测序技术
该研究利用该技术描绘了小鼠早期胚胎发育过程中甲基化、羟甲基化以及半甲基化修饰的动态变化,揭示了小鼠早期胚胎甲基化重编程过程中主动/被动去甲基化的活力变化以及参与父母本基因表达调控机制的差异。
测序中国 - DNA甲基化,单细胞甲基化,羟甲基化测序技术 - 2023-12-19
PNAS:北京大学谢晓亮团队开发新型单细胞甲基化与羟甲基化测序技术
该研究提出了一种无亚硫酸氢盐的单细胞全基因组5mC和5hmC分析技术,命名为Cabernet,它可以在高基因组覆盖率下以单碱基分辨率表征5mC和5hmC。
iNature - 测序,单细胞甲基化,羟甲基化 - 2023-12-28
Sci:单细胞甲基化测序助你区分神经元
近日,Salk生物研究所领导的团队根据甲基化和调控特征,区分小鼠和人类大脑样本中的神经元亚型,并鉴定出人类额叶皮质中一组新的神经元。这项成果于周五发表在《Science》杂志上。
生物通 - 甲基化测序,单细胞,神经元 - 2017-08-11
Stem cells:维生素C通过DNA羟甲基化促进星形胶质细胞分化
既往研究表明维生素C(VC)可通过DNA羟甲基化诱导多巴胺(DA)神经元特异性基因的转录激活促进神经干/前体细胞(NSC)向DA神经元分化。为进一步明确VC对NSC分化的影响,Jong-Hwan Kim等人采用高通量测序进行转录本和DNA甲基化图谱/羟甲基化图谱分析。研究人员意外的发现RNA测序分析显示,用VC处理分化的NSC培养基中,除了DA神经元基因,星形胶质细胞基因Gfap、Slc1a3和S
MedSci原创 - 星形胶质细胞,DNA羟甲基化,维生素C - 2018-08-03
Nat Commun:甲基化测序捕捉三阴性乳腺癌表观遗传特性
Nature Communications上的研究报告中,来自澳大利亚悉尼加文医学研究所(Garvan Institute of Medical Research)的科学家们通过将乳腺癌患者机体的乳腺癌甲基化组同健康个体进行比较从而绘制出了一种新型的基因组图谱,其可以帮助揭示DNA如何被甲基化基团进行修饰,即DNA的甲基化过程。
生物谷 - 三阴性乳腺癌,甲基化测序 - 2015-02-05
Nature Genetics | 中国科学院郭帆/王红梅揭示了小鼠胚胎和胚系发育过程中DNA羟甲基化和甲基化的动态变化
在哺乳动物中,DNA 5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)参与了早期胚胎发育期间的甲基化重编程。
iNature - DNA甲基化,DNA羟甲基化,小鼠胚胎,胚系发育 - 2022-12-24
Nature Genetics:林东昕/郑健团队等首次揭示RNA甲基化可调控DNA甲基化
DNA甲基化修饰改变引起的基因表达改变在肿瘤的发生发展中起重要作用。例如,癌细胞基因组常常有癌基因的低甲基化和抑癌基因的高甲基化改变,但DNA甲基化改变的机制目前并不完全清楚。
“生物世界”公众号 - DNA甲基化,RNA甲基化 - 2022-10-20
Genome Biol:ONT、PacBio长读长测序CpG甲基化检测工具的系统比较
首次对长读长测序的CpG甲基化检测工具进行了系统比较,包括最新的ONT R10.4流动槽化学测序、氧化亚硫酸盐测序(oxBS)以及SMRT测序。
测序中国 - 甲基化,CpG,长读长测序 - 2024-04-17
Blood:新型去甲基化药物OR-2100靶向治疗DNA异常超甲基化驱动的ATL白血病
成人T细胞白血病-淋巴瘤(ATL)是一种由人T细胞淋巴病毒-1(HTLV-1)转化的侵袭性的CD4+T细胞血液恶性肿瘤。大部分HTLV-1感染的个体无症状,仅3-5%的HTLV-1携带者会发展成ATL
MedSci原创 - 地西他滨,超甲基化,ATL白血病 - 2020-06-06
Nature:体重指数与DNA甲基化相关!
虽然目前对肥胖及其相关临床条件的机制了解甚少,但是最近的研究表明肥胖可能会影响DNA甲基化,DNA甲基化是基因表达和分子表型的关键调节器。近期,一项发表在Nature杂志上的文章使用了表观基因组证实:身体质量指数(BMI)与DNA甲基化的广泛
MedSci原创 - 体重指数,肥胖,DNA - 2016-12-25
eLife:全局DNA甲基化重塑技术帮助检验体外实验模型是否有效
Salk和Stanford的研究小组表明,从成纤维细胞中获得的诱导神经元在表观基因组水平与大脑中的神经元也是相似的。
生物通 - 神经元,重塑,实验模型 - 2019-01-30
DNA甲基化检测技术应用与技术比较
DNA甲基化作为表观遗传学研究的重要范畴,已经越来越受到研究者的关注。近些年来,随着DNA甲基化与组蛋白甲基化的联合作用机制、RNA干扰机制及去 甲基化机制的发现,使得DNA甲基化研究受到广泛关注,从医学领域扩展到动植物研究当中,同时在研究方法上也取得了很大的突破。现在用于DNA甲基化检测 的方法大概有十多种,从应用上来分,大致可以分成两类:全基因组甲基化分析及特异位点甲基化检测。下面,我
MedSci原创 - DNA甲基化,检测 - 2014-02-05
全基因组甲基化研究技术原理介绍
DNA甲基化是基因组DNA的一种主要表观遗传修饰形式。近年来,大量研究表明DNA甲基化修饰对于维持正常细胞功能、传递基因组遗传印记、胚胎发 育以及人类肿瘤发生,起着至关重要的作用。甲基化研究成为表观遗传学的热点,相应的技术也是层出不穷,根据实验目的的不同,这些技术大体能够分成两类:全 基因组(高通量)甲基化研究技术以及特异性甲基化位点(低通量)研究技术。下面将介绍几种当前最常用的一些技术全
MedSci原创 - 甲基化,基因组 - 2014-02-05
甲基化DNA免疫共沉淀测序原理及简介(MeDIP-seq)
MeDIP-Seq(Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing)测序是基于抗体富集原理进行测序的全基因组甲基化检测技术,采用甲基化DNA免疫共沉淀技术,通过5'-甲基胞嘧啶抗体特异性富集 基因组上发生甲基化的DNA片段,然后通过高通量测序可以在全基因组水平上进行高精度的CpG密集的高甲基化区域研究。
MedSci原创 - 甲基化,免疫共沉淀 - 2014-02-05
Swift宣布推出最高通量单细胞甲基化测序文库制备方法
美通社 - 2017-08-16
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