Circulation:广泛的染色质重塑会增加心衰的风险
既往研究表明心血管疾病与患者心脏的表观遗传改变有关,然而,心肌细胞的内源性染色质结构目前尚未阐明。本研究在压力负荷诱导心肌细胞肥大的成人心脏组织中进行全基因组染色体构象捕获(Hi-C)和DNA测序。此外,构建心脏特异性敲除CTCF(普遍存在染色质的一种结构蛋白)小鼠模型,研究CTCF蛋
MedSci原创 - 心衰,染色质重塑,表观遗传 - 2017-08-13
Nat Commun:cohesin帮助重构衰老中的染色质环
研究人员使用Hi-C技术发现,致癌性RAS诱导的人类二倍体成纤维细胞的衰老伴随着广泛的增强子-促进子重新布局,这与cohesin动态结合到基因组密切相关。
MedSci原创 - 细胞衰老 - 2020-11-28
IVD前沿丨PBMC染色质特征作为肿瘤诊断新工具
PBMCs染色质特征可区分健康患者和癌症患者以及不同的肿瘤组,也可以用于评估晚期肿瘤质子治疗的治疗效果,从而显示了染色质生物标志物在诊断和治疗评估中的临床应用潜力。
小桔灯网 - PBMC,肿瘤,染色质 - 2024-03-07
Nature:肿瘤代谢物破坏染色质信号,抑制DNA修复
研究人员表明,抑癌代谢物诱导的赖氨酸脱甲基酶KDM4B的抑制,导致组蛋白3赖氨酸9(H3K9)在DNA断裂周围位点的异常超甲基化,掩盖了对HDR的正确执行至关重要的局部H3K9三甲基化信号。
MedSci原创 - 肿瘤,代谢,DNA损伤修复 - 2020-06-11
Nature:钟声课题组创新开发单细胞多组学技术MUSIC,同步分析多重染色质相互作用、基因表达和RNA-染色质关联
加州大学圣地亚哥分校钟声课题组开发了一种创新的单细胞多组学核酸分析技术MUSIC,可用于同时分析单个细胞核内的多重染色质相互作用、基因表达和RNA-染色质关联。
测序中国 - MUSIC,RNA-染色质 - 2024-04-25
NATURE: 异染色质动态变化影响Rett综合征患者神经发育
MeCP2的突变会导致Rett综合征(RTT),这是一种产后进行性神经发育障碍,与严重的精神残疾和自闭症样症状相关,在患病女孩的幼儿期就有表现。
MedSci原创 - 儿童神经发育疾病,Rett综合征,异染色质 - 2020-07-23
华大基因开发新型空间染色质可及性测序工具SCA-seq,以单分子分辨率捕获表观遗传信息同时解析基因组构象
SCA-seq利用纳米孔技术对包含染色质可及性、CpG甲基化和染色质构象信息的长片段进行测序,在单分子分辨率上将染色质可及性和CpG甲基化映射到基因组空间结构,同时解析基因组构象。
测序中国 - 测序,空间染色质,SCA-seq - 2023-12-22
Nature子刊:利用类器官,高栋团队等揭开胰腺癌染色质开放性特征
该研究通过类器官模型系统性揭示胰腺癌的染色质开放性特征,通过整合基因组学、转录组学和药物敏感性等多组学数据揭示了不同亚型胰腺癌的基因调控网络及潜在治疗靶点。
生物世界 - 胰腺癌,类器官 - 2022-05-22
JBC:中科院朱冰团队发现表观遗传系统选择性保护常染色质区
对单个有机体而言,一些DNA突变可能导致疾病,甚至是致命性的疾病。可靠的DNA修复系统存在于细胞中以便确保高效地校正复制错误,因而保护着基因保真度。表观遗传学研究可遗传的并不是由于DNA序列发生变化而产生的表型变化。事实上,细胞内的表
生物谷 - 表观遗传系统 - 2016-08-30
Blood:PU.1编码基因所在染色质区域的动态三维结构
中心点:PU.1编码基因的空间染色质结构,在髓系分化过程中动态重构,在AML中被破坏。PU.1自动调节启动空间重构,并招募LDB1来稳定PU.1基因调控DNA元件之间所形成的染色质环。摘要:基因表达的表观遗传调控发生在被称为拓扑关联域(TADs)的离散空间染色体单元内,但大多数基因的精确的空间要求尚未明确;该点对与癌症相关的基因特别有意义。Daniel Schuetzmann等人采用高分辨率的染色
MedSci原创 - PU.1,三维结构,拓扑关联域,LDB1 - 2018-10-14
Nat Methods:利用ATAC-see技术可视化观察易接近的染色质
在有限的细胞核空间中,基因组的大部分是紧密折叠的,仅留下需要转录的部分是易接近的。美国斯坦福大学的Howard Chang说,人们有“巨大的兴趣”来确定一个给定的细胞类型中哪些基因组区域是有活性的。这正是Chang开发一种被称作ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin with highthroughput sequencing, 利
生物谷 - ATAC-see技术 - 2017-01-09
PNAS:通过胞外菌网形成所释放的染色质导致癌症患者血栓
最近一项研究表明染色质通过中性粒细胞形成的胞外菌网释放到血液中是导致凝血和血栓的主要原因。研究人员使用慢性粒细胞性白血病小鼠模型发现,恶性和非恶性嗜中性粒细胞更容易形成胞外菌网。
生物谷 - 癌症,血栓,胞外菌网,染色质 - 2012-07-27
Sci Rep:从染色质谱分析骨关节炎中异常的增强剂调节
由于技术上的困难,在OA中没有报道染色质谱,提供对基因调控的见解。 在这里,我们采用高转录测序(ATAC-seq)检测转座酶可及的染色质,以绘制OA患者关节膝关节软骨中可接近的染色质图谱。我们确定了软骨的109,215个可及的染色质
MedSci原创 - 2018-11-01
Nat Gene:染色质重塑异常可能导致膀胱癌
日前,由北京大学深圳医院和华大基因研究院共同完成的一项研究发现,染色质重塑异常可能是导致膀胱癌发生的一个重要原因,这为膀胱癌的诊断、治疗奠定了遗传学基础。
染色质重塑,膀胱癌 - 2011-11-28
Cell | 染色质激活或抑制状态决定了核小体分离的差异性
染色质结构通过促进或抑制该结构的转录可以控制基因组的功能和细胞身份认定。这些染色质结构中存在特定的组蛋白翻译后修饰(posttranslational modifications,PTMs),它们与特定转录状态相关,并可促进抑制性染色体结构的形成,影响基因的表达。为了在细胞分裂时依然保持基因表达程序的完整性,决定染色质结构的分子特征也需要在子代细胞中建立。建立不同类型染色质状态的重要决定因素是
BioArt - 染色质,激活,抑制状态,核小体分离,差异性 - 2019-11-04
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