Nature Medicine:cfDNA甲基组用于早期子痫前期检测
在文章中,作者测试了是否可以利用DNAme的变化来预测孕妇PE的进展,并利用这些信息来进行症状前PE检测和潜在的干预。
小桔灯网 - cfDNA甲基,早期子痫 - 2023-09-19
Genome Med:单个cfDNA样本产生2亿个reads!新纳米孔测序方法揭示癌症cfDNA单分子甲基化谱
该文章介绍了一种纳米孔单分子测序方法,用于有效地表征癌症患者cfDNA的甲基化谱。
测序中国 - cfDNA - 2024-04-26
Nat Commun:FinaleMe模型:基于血浆cfDNA片段化模式预测DNA甲基化水平和起源组织状态
研究团队开发了一种名为FinaleMe的计算方法,可预测每个cfDNA片段中每个CpG的DNA甲基化状态,并获得CpG位点的连续DNA甲基化水平;进一步从推断的甲基化模式中预测相关的起源组织状态。
测序中国 - cfDNA,DNA甲基化 - 2024-04-29
PNAS:基于甲基化图谱及深度学习模型,实现cfDNA组织特异性定性及定量研究
研究团队开发了第一个cfDNA监督组织反卷积方法,一个基于深度神经网络(DNN) 的模型cfSort,其可用于敏感和稳健地定量cfDNA中的组织成分。
测序中国 - cfDNA,深度神经网络,甲基化图谱 - 2023-07-25
Genome Biology | 纳米孔测序可用于检测cfDNA的细胞起源和癌症特异性甲基化特征
该研究结果表明,基于cfNano和Illumina的WGS和WGBS方法在检测DNA甲基化、片段化和CNA的癌症特异性特征方面性能基本一致。
测序中国 - 细胞起源,纳米孔测序,检测cfDNA - 2022-08-09
eLife | 基于cfDNA甲基化和片段组学多模态分析,实现多癌种早检及定位
研究团队开发了一种被称为“SPOT-MAS”的多模态方法,通过DNA甲基化及其大小检测肿瘤是否存在,全面分析cfDNA的甲基组学、片段组学、DNA拷贝数和末端基序,可从单一筛查中同时检测和定位癌症。
测序中国 - cfDNA甲基化 - 2023-08-13
Nat Commun:机器学习分类器CUPiD:基于cfDNA甲基化模式预测原发灶不明癌症的起源组织
文章介绍了一个高度准确的机器学习分类器CUPiD,可基于cfDNA甲基化模式准确预测29种肿瘤类型的TOO。
测序中国 - 甲基化,cfDNA,原发灶不明癌症 - 2024-05-13
Clin Cancer Res:cfDNA甲基化液体活检方法OvaPrint,可评估有症状女性的早期卵巢癌风险
来自美国南加州大学的研究人员开发了一种cfDNA甲基化液体活检方法,用于早期HGSOC的风险评估。研究团队进行了简化的亚硫酸氢盐DNA测序,以确定HGSOC和正常卵巢、输卵管组织之间的差异甲基化区域。
测序中国 - 卵巢癌,液体活检,上皮性卵巢癌,cfDNA甲基化,OvaPrint - 2023-11-14
IVD前沿丨cfDNA数据检测于临床新应用
作者开发了一种方法,利用单细胞转录组图谱从头扫描cfDNA片段图谱,以获得健康和疾病中一系列潜在的细胞类型贡献者。
小桔灯网 - cfDNA,液体活检 - 2024-04-15
中国医学科学院肿瘤医院刘芝华教授《自然·通讯》:cfDNA甲基化多模态超早期识别食管鳞癌和癌前病变
该研究结果不仅证实了基于cfDNA全基因组甲基化组的多模态分析有助于ESCC的早期诊断和分子特征监测,还将其应用于癌前病变识别,有助于进一步提高患者的生存获益。
BioMed科技 - 食管癌,食管鳞癌,多模态,cfDNA甲基化 - 2024-05-09
研究 | PE-cfDNA能否检测晚期NSCLC患者EGFR变异?
肿瘤组织样本一般被认为是分子病理检测的首选和“金标准”,但对于晚期NSCLC并非所有患者均能顺利获得检测所需的肿瘤组织样本。
肺癌青委会 - 2023-01-16
cfDNA伴随诊断成功案例分析
最近,Grail准备投资10亿美元计划招募7000初诊癌症和3000 健康人群,致力于肿瘤血检早期诊断标记物的开发[1]。肿瘤血液检测要爆发了吗?
医药研发社交平台(微信号 DrugSNS - 液体活检,诊断案例分析 - 2017-02-20
Cancer Discov:基因组学、片段组学、甲基化组学“三位一体”,多模态cfDNA分析可高灵敏度识别早期癌症
该方法结合靶向Panel测序(TS)、低深度全基因组测序(sWGS)和游离甲基化DNA免疫共沉淀测序(cfMeDIP-seq),可在广泛的癌症谱中检测各种癌症相关的信号。
测序中国 - 细胞游离DNA,Li-Fraumeni Syndrome综合症,癌症谱,低深度全基因组测序 - 2023-11-22
JCLA:如何尽量减少来自基因组DNA的cfDNA污染?
众所周知,靶cfDNA在全血浆中的比例较低。由于操作不当导致的血细胞裂解所产生的丰富的gDNA背景已成为准确测定cfDNA的主要障碍。
网络 - 检测,基因组DNA - 2019-06-06
Anticancer Research:cfDNA示晚期卵巢癌预后
《抗癌研究》(Anticancer Research)杂志近期发表的一项研究提示,术前血清RAS癌基因家族成员(RAB25)无细胞DNA(cfDNA)水平可能是预测晚期卵巢癌患者生存预后的一个有用的生物标志物此前研究已经评估了cfDNA作为一种非侵袭性生物标志物在多种癌症中的应用价值。该研究旨在评估cfDNA水平对卵巢癌的预后价值。 研究检测了36例卵巢癌和1
医学论坛网 - cfDNA,卵巢癌 - 2012-07-31
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