Nature：钟声课题组创新开发单细胞多组学技术MUSIC，同步分析多重染色质相互作用、基因表达和RNA-染色质关联
加州大学圣地亚哥分校钟声课题组开发了一种创新的单细胞多组学核酸分析技术MUSIC，可用于同时分析单个细胞核内的多重染色质相互作用、基因表达和RNA-染色质关联。
测序中国 - MUSIC，RNA-染色质 - 2024-04-25
GENOME BIOLOGY：scIBD用于增强单细胞染色质可及性测序中异型双联体的检测
scIBD 引入了一种自适应策略来模拟高置信度异型双联体，并以迭代优化的方式自我监督双联体检测。对各种模拟和真实数据集的全面基准测试证明了 scIBD 的卓越性能和稳健性。
MedSci原创 - 单细胞染色质，单细胞染色质可及性测序技术，scIBD，异型双联体 - 2023-10-11
ATAC-seq技术再升级：单分子测序平台联手单细胞染色质可及性测序技术
基于二代测序平台(NGS)的scATAC-seq技术利用Tn5酶的DNA随机打断功能，可以富集染色质局部开放区域上的基因组DNA短片段（通常80-300 bp），这些短片段被当作开放染色质的信号。
iNature - ATAC-seq技术再升级，单分子测序，单细胞染色质可及性测序技术 - 2022-11-13
NATURE：染色质碎裂助力肿瘤耐药
通过额外的几轮染色体碎裂，ecDNA的结构进化进一步提高了药物耐受性。原位Hi-C测序显示，ecDNAs优先存在于染色体末端附近，当DNA损伤时，它们会在那里重新整合。
MedSci原创 - 染色质重塑，肿瘤耐药性 - 2020-12-26
Genome Biology：scIBD：识别单细胞染色质开放性测序数据中异质双联体细胞的新工具
厦门大学王颖、南开大学陈盛泉课题组联合开发了一个对不同单细胞染色质开放性测序数据，进行异质双联体细胞有效识别并去除的新工具。
测序中国 - 单细胞染色质，双联体细胞 - 2023-11-08
Blood：APL细胞外染色质使凝血及纤溶恶化
急性早幼粒细胞白血病（APL）常伴发危及生命的血栓及出血。尽管在过去的几十年中， APL缓解率已达90%，成为高度可治愈型人类恶性肿瘤。
科学网 - APL - 2017-04-11
Front Immunol：单细胞分辨下系统性红斑狼疮患者外周血单核细胞染色质可及性的研究
系统性红斑狼疮(SLE)是一种多种免疫细胞参与的自身免疫性疾病。我们的目标是在单细胞分辨率下揭示SLE患者外周血单个核细胞(PBMC)染色质的可及性，并识别可能驱动异常免疫反应的转录因子(TF)。
MedSci原创 - 系统性红斑狼疮，外周血单核细胞，染色质可及性，单细胞分辨 - 2022-03-18
Nature:染色质组织方式决定肿瘤细胞区域性突变率
7月22日，Nature杂志在线报道，染色质组织方式对人类癌细胞中区域性突变率具有重大影响。 癌症基因组测序，提供了人类体细胞整个基因组的基因突变率差异的第一手资料。通过检测各种遗传学和表观遗传学指标，研究者发现，癌症细胞基因组的基因突变率与染色质组织方式存在惊人的相关性。事实上，在百万碱基数量级上，一个单一的染色质组织特性（异染色质相关组蛋白修饰H3K9me3的水平），可以导致40％以上的
生物谷 - 染色质，肿瘤细胞，区域性，突变率 - 2012-07-25
Nat Commun：开放染色质分析可帮助找到白血病细胞起源
每种癌症都起源于单个细胞，Jackson实验室（JAX）的研究人员最近发现一种精准可靠的方法能够找到导致白血病发生的细胞起源，对于癌症诊断和结果判断都有很有帮助。他们使用的这种新方法叫做开放染色质的全基因组分析。相关研究结果发表在国际学术期刊Nature Communication上。文章作者JAX助理教授Jennifer Trowbridge说：“发现癌细胞的细胞起源能够为肿瘤分型，诊断和治疗提
生物谷 - 染色质，白血病细胞 - 2016-07-13
Blood：异染色质极端破坏会加速造血系统衰老
异染色质丢失一直被认为是不同物种、不同类型细胞衰老的一个普遍机制。然而，目前对于异染色质丢失所引起的造血系统改变的综合分析还有待研究。此外，既往研究报道的在衰老过程中主要的异染色质组蛋白甲基转移酶Su
MedSci原创 - 造血细胞，异染色质，Suv39h1，Suv39h2 - 2020-04-22
Nat Commun：cohesin帮助重构衰老中的染色质环
研究人员使用Hi-C技术发现，致癌性RAS诱导的人类二倍体成纤维细胞的衰老伴随着广泛的增强子-促进子重新布局，这与cohesin动态结合到基因组密切相关。
MedSci原创 - 细胞衰老 - 2020-11-28
Circulation：广泛的染色质重塑会增加心衰的风险
既往研究表明心血管疾病与患者心脏的表观遗传改变有关，然而，心肌细胞的内源性染色质结构目前尚未阐明。本研究在压力负荷诱导心肌细胞肥大的成人心脏组织中进行全基因组染色体构象捕获（Hi-C）和DNA测序。此外，构建心脏特异性敲除CTCF（普遍存在染色质的一种结构蛋白）小鼠模型，研究CTCF蛋
MedSci原创 - 心衰，染色质重塑，表观遗传 - 2017-08-13
Cell：染色质“接吻”能调控基因的表达
一项突破性的研究发现将对我们了解我们的遗传蓝图 DNA 的功能产生重大的影响，来自南非的科学家们第一次揭示了，当基因在三维空间中互作，或可说是参与“基因接吻”（gene kissing）时，对于细胞内的基因开启会造成重大的影响这一里程碑式研究发现发表在世界最著名的研究期刊《细胞》（Cell）杂志上。 “基因接吻”是基因激活的原因或只是一个结果，是一个长期存在的生物学问题。来自南非金山大
MedSci原创 - 染色质 - 2013-11-20
染色质免疫沉淀(ChIP)实验指南及技术总结
染色质免疫沉淀(ChIP)实验指南及技术总结ChIP是一项比较流行的研究转录因子（ transcription factor, TF）与启动子（promoter）相互结合的实验技术。由于ChIP采用甲醛固定活细胞或者组织的方法，所以能比较真实的反映细胞内TF与Promoter的结合情况。这个优势是EMSA这个体外研究核酸与蛋白相互结合的实验方法所不能比拟的。
染色质免疫沉淀 - 2016-05-09
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