Science:空间组学技术概览与展望
该综述系统地介绍了空间组学技术的丰富种类,阐明了其原理、优势和局限性,并就这一领域目前面临的挑战提供了观点和建议。
测序中国 - 空间组学 - 2023-08-26
Science:利用空间转录组学技术可视化观察组织中的基因表达
在一项新的研究中,来自瑞典卡罗琳斯卡研究所和皇家理工学院等机构的研究人员开发出一种新的被称作空间转录组学(spatial transcriptomics)的高分辨率方法研究一种组织中哪些基因是有活性的
生物谷 Bioon.co - 转化医学,转录,RNA - 2016-07-04
Nat Biotechnol发表新空间组学方法,同步实现转录组和代谢组的空间多模态精确分析
研究团队证明了在单个组织切片中结合SRT和MALDI-MSI并保留两种模式的特异性和敏感性的可能性,并在多巴胺和帕金森病条件下的小鼠和人类大脑样本中证明了该方法的潜力。
测序中国 - 空间多模态精确分析 - 2023-10-03
Nucleic Acids Res:空间转录组学数据挖掘新算法——DeepST
研究团队研发了基于深度学习的空间域识别技术(DeepST)。DeepST使用预先训练好的深度神经网络模型从组织形态学信息(H&E染色图片)中提取图像特征,然后将提取的特征与基因表达和空间位置数据集成,
测序中国 - 数据挖掘,算法,空间转录组学 - 2022-10-24
Nature Genetics:BANKSY:革命性算法,重塑空间组学数据分析
该算法作为一种创新的空间组学数据分析工具,其主要功能是将空间组学数据中的细胞根据类型和组织域进行有效分类。
生物探索 - 空间组学,BANKSY - 2024-03-04
Genome Biol综述 | 多模态和单细胞/亚细胞水平空间组学技术的现状及发展前景
空间组学领域在过去几年蓬勃发展,并从根本上提高了原位实验的广度和分辨率。这些技术现在可以在50-100nm的空间分辨率下检测超过10,000个独特的基因靶点。
测序中国 - 多模态和单细胞,亚细胞水平空间组学技术,空间组学实验 - 2022-12-29
空间转录组学方法EEL FISH:可实现高复用、高空间通量和高分辨的原位单细胞分析
大脑是一个高度结构化的器官,包含多种细胞类型,具有复杂的空间模式组织。目前研究分析这些不同细胞类型之间的组织和空间关系仍具有挑战性。
测序中国 - 空间转录组学方法,高空间通量,高分辨的原位单细胞分析 - 2022-11-13
Nature:空间转录组学开辟记忆编码新视角:长期恐惧记忆的分子地图
研究员通过高分辨率的空间和单细胞转录组学分析,研究者能够在分子和细胞层面上阐明BLA在长期记忆中的作用。
生物探索 - 长期记忆,BLA,空间转录组学 - 2024-02-13
Science:MIT王潇团队开发空间翻译组学测序技术RIBOmap,以单细胞和分子分辨率揭示脑组织翻译调控机制
利用RIBOmap,该研究揭示了细胞周期依赖性翻译和亚细胞定位的mRNA翻译,以及细胞类型特异性和脑区特异性翻译调控。
测序中国 - RIBOmap,分子分辨率,脑组织翻译调控机制 - 2023-07-31
笔记收藏:影像组学/放射组学
近期在不同的学术会议上,有幸聆听学习了几位影像组学的大咖做报告,受益匪浅。以大咖们的报告为指导,自己也学习查找了一些文献,加入了一点点自己的理解和想法,整理成一篇笔记,与大家分享。名词解释:影像组学(Radiomics) “影像组学”,一共4个字,每个字都是常见字啊。但4个字放一起啥意思?好吧,我们把它们拆成“影像”和“组学”两个词来说。这里的“影像”通常指的就是放
MedSci原创 - 影像组学,放射组学 - 2018-07-25
空间转录组学新方法FISHnCHIPs可准确映射细胞类型
研究团队提出了一种灵敏、稳健、可扩展的空间转录组学方法“FISHnCHIPs”,可对细胞类型和基因表达程序进行原位分析。
测序中国 - 空间转录组学,FISHnCHIPs - 2024-04-15
基因组学技术进展(Genome Technology)
第一主题 基因组学技术进展 1. 测序新技术 2. 转录基因组学 3. 表观基因组学 4. 外显子组学 1.Genome Technology ?
会议 - 2009-03-11
蛋白质基因组学:运用蛋白质组技术注释基因组
随着高通量DNA测序技术的飞速发展,越来越多的物种完成了基因组测序.定位编码基因、确定编码基因结构是 基因组注释的基本任务,然而以往的基因组注释方法主要依赖于DNA及RNA序列信息.为了更加精确地解读完成测序的基因组,我们需要整合多种类型的组学数 据进行基因组注释.近年来,基于串联质谱技术的蛋白质组学已经发展成熟,实现了对蛋白质组的高覆盖,使得利用串联质谱数据进行基因组注释成为可
生物化学与生物物理学进展 - 亚硝基化谷胱甘肽还原酶,GSNOR,NO,炎症因子 - 2014-01-03
2018单细胞组学技术与应用研讨会
近年来,单细胞组学领域发展得非常迅速,为人们研究肿瘤异质性以及微生物群落的生态多样性提供了新的视角。我国科学家也先后在顶级期刊发表诸多单细胞组学研究成果, 如北大谢晓亮团队开发的单细胞基因组线性扩增的方法—LIANTI,MALBAC® (Multiple Annealing and Looping BasedAmplification Cycles)技术、汤富酬团队开发的
MedSci原创 - 单细胞 - 2018-09-14
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