甚于德尔塔,奥密克戎(Omicron)突变株会是“超级毒株”吗?

2021-11-28 两条咸鱼 SIFIC感染视界

尽快加速全球薄弱地区的疫苗接种,才是预防再次出现“超级毒株”的关键。

2021年11月26日,世界卫生组织(WHO)正式将新冠病毒突变株B.1.1.529升级为令人担忧的突变株(Variant of Concern, VOC);系统命名定为奥密克戎(Omicron)

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VOC是目前病毒监测系统中最高级别,也是最危险的突变株;上一个被纳入VOC的是给人类造成巨大危害的德尔塔(Delta)突变株。根据已有资料,Omicron突变株有更多突变,很可能产生了比Delta突变株更强的传染性、毒性和免疫逃逸;从而成为人类新的噩梦。该消息立即引起各大媒体巨大关注和欧美股市大幅下挫。
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Omicron突变株,即B.1.1.529突变株,顾名思义这个突变株来自于B.1.1谱系,和Alpha(B.1.1.7)属于同一谱系
Omicron突变株最早于2021年11月11日在非洲南部的博兹瓦纳发现,3天后即在南非的Gauteng省迅速蔓延。在Gauteng从11月12-20日采样的77个患者样品中,经检测全部为Omicron突变株。特别需要警惕的是,中国香港已经检测到了Omicron突变株,系由从南非旅行者带入,且传染了同期的另外一位隔离者。除此之外,以色列、比利时等也都检出Omicron突变株。

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Omicron突变株极可能有更强的传染性

Delta突变株最大的危害是传染性极强,基础传染值达5-9.5。但金融时报首席数据记者发现,Omicron比Delta突变株更容易传播(如下图所示)。
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(Omicron的传染性超过Delta突变株!图源:ft.com)
Omicron在南非Gauteng地区的传染性也证实了这一点。在进入到11月份之后的短短两周内,Omicron突变株的检测阳性比例就由1%上涨到30%!南非的病例也开始呈指数增长,周二有868例,周三到了1275例,周四竟然达到了3500多例。尽管这些病例尚未被鉴定为都是Omicron突变株,但足够引起高度警惕。
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(南非的病例数突然出现暴涨)
Omicron突变株的传染速度可能远高于之前的任何突变株,著名的疾病建模科学家Weiland估计Omicron突变株的传染性比原始毒株高500%;相对比,Delta突变株的传染性可能比原始毒株高70%-200%。
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(图源:推特@JPWeiland)

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Omicron突变株的传染性为什么这么高?

Omicron突变株的Spike(S蛋白)有32个突变,是目前突变株中S蛋白突变最多的;相对比的是,Delta突变株在S蛋白上有9个突变。其与Delta和Alpha突变株有多处重合,因此该突变株可能有复制能力增强的特征。Omicron突变株的Furin切割位点附近有H655Y + N679K + P681H突变,也可能增强病毒复制能力和感染力。
Jeffery Barrett博士列出了这些突变,其中红色意味着不好,Omicron有9个,其中P681R尤其令人担忧。紫色意味着新的突变,且实验室数据显示有威胁。黄色意味着这些突变位置很重的,但科学家还不知道其生物学特征。蓝色表示需要更多证据来验证。绿色表示这些突变已被验证过,不需要担心。
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(Omicron的突变位点。图源:推特@jcbarret)
上面这张图特别好,标记了每种突变的意义。
Omicron突变株综合了几个VOC最关键的突变:Alpha,Beta,GammaN501YAlphaP681。它还有最让人担心,也是我讲得最多的Beta免疫逃逸突变E484,及DeltaT478K

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Omicron突变株毒力和免疫逃逸会更强吗?

从突变位点看,Omicron突变株的RBD具有15个突变,是RBD突变最多的突变株,可能会影响抗体识别和疫苗接种Omicron具有nsp6-del105-107,可能会影响固有免疫及T细胞免疫。除此以外,它的N蛋白具有R203K/G204R,可能会提高病毒毒力

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Omicron是否会成为下一个超级毒株,目前下结论为时尚早

我们的主要结论:Omicron突变株确实非常非常值得警惕,不过Omicron是否会成为下一个“超级毒株”,目前下结论为时尚早。首先简要总结下Omicron突变株有可能成为“超级毒株”的特点:
1. RBD具有15个突变,是RBD突变最多的突变株,会影响抗体识别和疫苗接种;
2. Furin切割位点附近有H655Y + N679K + P681H突变,可能增强病毒复制能力和感染力;
3. 具有nsp6-del105-107,可能会影响固有免疫及T细胞免疫;
4. N蛋白具有R203K/G204R,可能会提高病毒毒力。
而在南非也确实看到了Omicron突变株正在攻城略地。
但对于突变株最重要的两个流行病学特征,传播能力免疫逃逸能力,目前还没有Omicron的相关数据
更重要的是,Omicron突变株如Delta一样,在NTD有大量突变;同时在RBD具有如此频繁的突变,有15个之多。从我经常讲的病毒适应性角度,RBD具有如此多的突变,会有很显著的免疫逃逸;但并不能保证病毒与宿主细胞能够结合得更有效,因此不能预测病毒传播能力更强,这需要结构生物学、病毒学和流行病学的数据来判断。
因此,这个病毒不知道会不会像Beta一样,仅引起局部传播,但无法成为全球主导突变株。还有一个,Omicron突变株目前主要在南非蔓延,而与其他国家相比,南非具有特殊性。
1)南非之前疫情控制尚好,也就是说,Omicron突变株并未直接面对Delta突变株的竞争。
2)南非疫苗完全接种疫苗的比例只有24%,远低于全球42%的比例,属于防疫薄弱地区。所以Omicron突变株在其他地区是否会如南非一样肆意蔓延还不好说。
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但是,南非出现Omicron突变株也再次给我们敲响警钟,整个非洲完全接种疫苗的比例仅7%。这意味着COVID-19一旦在非洲爆发,将以更迅猛的速度蔓延,且在这个过程中,很可能会产生新的“超级突变株”。

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疫苗公司的应对

对于Omicron突变株,主要的疫苗公司纷纷展示了自己的应对能力。
mRNA疫苗公司德国BioNTech表示,正在测试与辉瑞合作研发的COVID-19疫苗,将在两周内知道该疫苗是否对Omicron突变株有效。并且,BioNTech和辉瑞能够在6周内完成新疫苗的设计,并在100天内完成第一批疫苗的生产
mRNA疫苗公司美国Moderna则在一份声明中说,该公司一直在推动针对更新突变株的加强针,目前已有两个候选多价加强针,包括针对Omicron突变株的mRNA-1273.529;并有能力在60天内把新的候选疫苗推进到临床试验阶段。
重组蛋白疫苗公司美国Novavax则宣布,已经开始研究Omicron突变株,将在后面数周内完成疫苗测试和测试疫苗的生产。
DNA疫苗公司Inovio则说,将评估其现有疫苗对Omicron突变株的有效性,2周会完成测试
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全球首张!“奥密克戎”VS“德尔塔”

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当地时间11月27日,意大利罗马儿童医院科研团队发布新冠病毒新型变异毒株奥密克戎的全球首张图片。
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△德尔塔毒株与奥密克戎毒株刺突蛋白突变对比图(图片来自罗马儿童医院)
图片显示,与新冠变异病毒德尔塔毒株相比,奥密克戎毒株拥有更多的刺突蛋白突变。这些变异多样化,且大部分位于与人体细胞相互作用的区域。
研究人员表示,新冠病毒通过变异进一步适应人体,但并不一定意味着变得更加危险。

 

意大利出现第一例奥密克戎毒株感染病例

当地时间11月27日,经实验室测序,意大利确认了该国第一例新冠病毒变异毒株奥密克戎感染病例。意大利《晚邮报》报道说,该患者居住在意南部坎帕尼亚大区,自莫桑比克旅行归来,此前新冠病毒检测呈阳性并被隔离,目前身体状况良好。
当地时间11月26日,意大利卫生部已决定禁止过去14天在南非、津巴布韦等8个非洲国家逗留过的人员入境。
福奇等医学专家担心新变异株或已在美国传播
最近两周,美国疫情数据已经出现明显的上升趋势。据美国疾控中心数据显示,截至25日,美国7天内日均感染病例数已达到94000例,较上月同期上升了47%。
此外,专家担心,由于美国长期以来在新冠病毒基因测序方面进展缓慢,近期在南非等国发现的新型新冠病毒变异株Omicron(奥密克戎),很可能已经传播到了美国境内。
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贝勒医学院教授 彼得·霍特兹:我们在进行病毒基因测序这一程序中往往表现得缺乏行动力,所以如果说新的变异株已经传播到了美国,我完全不会感到惊讶。
美国国家过敏症和传染病研究所所长安东尼·福奇表示,新冠病毒变异毒株奥密克戎可能已经在美国出现,但尚未被发现。
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美国疾病控制和预防中心曾在11月26日表示,迄今为止,尚未在美国发现任何已知的奥密克戎毒株感染病例,如果变异毒株出现在美国,美国疾病控制和预防中心预计将通过监测系统迅速确定病例。
11月27日,受新冠病毒变异毒株奥密克戎影响,美国疾控中心(CDC)将南非、津巴布韦、纳米比亚、莫桑比克、马拉维、莱索托、斯威士兰和博茨瓦纳这8个非洲国家的旅行风险指数提升为“第4级”,即“非常高”。
美国总统拜登曾于11月26日宣布,美国将从11月29日起开始限制来自南非、博茨瓦纳、津巴布韦、纳米比亚、莱索托、斯威士兰、莫桑比克和马拉维的旅客入境。
变异毒株从哪里来?科研人员正在研究中
随着奥密克戎变异株传播范围不断扩大,科研人员也正在研究它究竟从哪里来。英国伦敦大学学院生物学教授弗朗索瓦·巴卢分析称,Omicron(奥密克戎)变异株携带着一系列不寻常的突变,有可能是在某个免疫力低下病例的慢性感染期间发生的变异,也有可能来自某个未经治疗的艾滋病患者。
WHO要求各国加强监测和测序工作
新型新冠病毒变异株如何防控?目前世界卫生组织已经要求各国加强监测和测序工作。呼吁各国加强对所有仍在流行的新冠变异毒株的监测和测序,向公开数据库提交完整的病毒基因组序列和元数据,并向世卫组织报告与任何“需要关注”的变异毒株有关的初始病例或病例集群。
世卫组织还建议开展国际协作,通过实地调查和实验室评估,更好地了解“需要关注”的变异毒株各方面的影响。
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同时,一些国家担心这一新型变异毒株会继德尔塔毒株后引发新一波凶猛疫情,截至目前,已有大约20个国家陆续发布或准备出台针对南部非洲国家航班和旅客的入境限制措施。

美国将对南非等8个国家实施旅行限制

当地时间11月26日,据美国消费者新闻与商业频道(CNBC)援引政府官员消息报道,为防止新冠病毒变异株Omicron的传播,美国将从11月29日开始对来自南非、博茨瓦纳、津巴布韦、纳米比亚、莫桑比克等8国的公民实施旅行限制。

加拿大宣布禁止来自南部非洲地区7个国家的人员入境

加拿大卫生部长让-伊夫·杜克洛(Jean-Yves Duclos)当地时间11月26日在渥太华的新闻发布会上宣布,禁止来自南部非洲地区的南非、莫桑比克、纳米比亚等7个国家的人员入境。这一措施至少维持14天,以防新冠病毒变异毒株Omicron进入加拿大。

杜克洛表示,凡是在过去14天内去过或途径南部非洲地区的民众,现在都被要求进行检疫隔离,并进行新冠病毒检测。

由于加拿大与这些国家都没有直线航班,因此,对于返回加拿大的加拿大公民和永久居民,都需要前往第三国进行新冠病毒检测,检测结果为阴性者方可入境。与此同时,加拿大外交部发布旅行建议,要求所有加拿大人不要前往南部非洲地区旅行。

加拿大联邦首席医疗官谭咏诗(Theresa Tam)表示,目前加拿大境内尚未发现“Omicron”变异毒株的感染病例。加拿大卫生部门目前正在对此进行严密监测。

挪威对来自非洲8个国家的入境者实施限制

当地时间11月26日,挪威广播电视公司报道,受到新冠病毒变异株Omicron的影响,挪威将对来自南非、纳米比亚、津巴布韦、莫桑比克等8个国家的入境者实行严格的入境限制。

挪威外交部也建议民众不要前往这8个国家,该限制措施初步实行两周,将从当地时间11月27日起生效。

在该限制措施下,上述国家与挪威的直飞航班将被禁止。在受影响国家逗留后抵达挪威的入境者,无论是否已完成疫苗接种或曾经确诊新冠肺炎后已痊愈,都必须完成入境前的新冠病毒检测、抵达时的新冠病毒检测、以及7天后的新冠病毒检测;同时,入境后进行10天的隔离。

丹麦将对南非等7个国家实施入境限制

当地时间11月26日,丹麦广播电视台(DR)报道,从27日开始,丹麦将对南非等7个国家实施新的入境限制。 因南非等国家发现新冠病毒变异毒株Omicron,丹麦不鼓励公民前往这些国家旅行。

同时,丹麦政府规定,从上述7个国家出发入境丹麦的旅客时,必须接受核酸检测并进行为期10天的隔离。政府同时呼吁过去10天内去过这7个国家的民众应进行核酸检测。

截至26日,丹麦单日新增新冠肺炎确诊病例4076例,累计确诊470893例;新增死亡病例9例,累计死亡2850例。从27日起,丹麦将为5岁至11岁的儿童进行新冠疫苗接种。

瑞士禁止来自非洲南部地区的直飞航班入境

当地时间11月26日,瑞士联邦政府宣布,无限期禁止从莫桑比克、纳米比亚、津巴布韦、南非等7国起飞的所有直飞航班。 除上述地区外,从以色列、比利时等地出发的入境者也必须进行新冠病毒检测,检测结果呈阴性者还需要进行为期10天的隔离。上述防疫规定从当地时间26日20时开始执行。

瑞士联邦卫生局最新数据显示,瑞士和列支敦士登累计确诊新冠肺炎病例986828例,累计死亡11092例。过去24小时内新增新冠肺炎确诊病例8032例,新增死亡病例12例。

目前,瑞士各州正在不断收紧相关防疫措施。

土耳其宣布禁止非洲5国民众赴土耳其旅行

土耳其卫生部长科贾当地时间11月26日晚通过社交媒体宣布,由于一种新型变异新冠病毒引发的确诊病例增加,土耳其将从当晚开始禁止从博兹瓦纳、南非、莫桑比克、津巴布韦和纳米比亚5个国家的民众通过陆路、海路和空路赴土耳其旅行。

约旦针对有非洲7国旅行史的人员采取入境限制措施

当地时间11月26日,约旦内政部宣布,自11月28日起将对有南非、津巴布韦、莫桑比克等7国旅行史的人员采取入境限制措施,以应对新出现的新冠病毒变异株Omicron。

根据规定,有上述任一国家旅行史的非约旦籍公民须在除上述7国外的其他国家停留超过14天并取得核酸检测阴性证明,否则将无法入境约旦;对于有上述7国旅行史的约旦籍公民,虽可被接受入境,但必须在入境后强制进行为期14天的自费集中隔离。

捷克对南非等非洲8国发布旅行限制令

当地时间11月26日,捷克外交部长库尔哈内克在社交媒体上宣布,由于新冠病毒新型变异毒株的传播,从本周六(27日)起,禁止过去14天内在南非、纳米比亚、莱索托、津巴布韦、赞比亚等8个非洲国家停留超过12小时的外国公民入境。

捷克以及其他欧盟成员国公民、持有捷克签发的90天以上长期居留许可的非欧盟公民在严格遵守防疫措施的情况下可返回捷克。

该旅行限制令将持续至12月12日。

为防范新冠变异病毒 巴西自29日起禁止非洲6国旅客经航空入境

当地时间11月26日晚,巴西总统府民事办公室主任西罗·诺盖拉(Ciro Nogueira)在社交媒体上宣布,从下周一(11月29日)起,禁止来自南非、莱索托、纳米比亚和津巴布韦等6国的旅客经航空入境。诺盖拉表示,该决定是由总统府民事办公室、基础建设部、卫生部和司法部门共同讨论后做出的,政府将于11月27日将此旅行限制令发布在官方公报上。

据报道,由于南非等多国报告发现新型新冠病毒变异毒株Omicron,全球多位医学专家表示这种变异毒株或具有超强传染性。11月26日,巴西国家卫生监督局曾建议政府限制巴西与非洲部分国家的商业航线运营,以阻止新型新冠变异毒株进入巴西。巴西国家卫生监督局强调,Omicron是具有攻击性的病毒变种,需要立即采取防范措施。

防范新型变异病毒传入 俄将限制来自部分国家和地区的外国公民入境

据塔斯社报道,俄罗斯将限制居住在南非、博茨瓦纳、莱索托、纳米比亚、津巴布韦、莫桑比克、马达加斯加、斯威士兰、坦桑尼亚、中国香港特别行政区的外国公民,以及在过去10天内到访过上述国家和地区的外国人进入俄罗斯境内。据悉,上述国家和地区均报告发现新型变异新冠病毒感染病例。

此外,俄罗斯将与坦桑尼亚的航班暂停至2022年2月1日。

俄联邦消费者权益保护和公益监督局将会同交通运输部一起,组织对自非洲、以色列、英国、中国抵达的俄罗斯人进行快速核酸检测。目前在俄罗斯境内尚无报告发现该新冠病毒变种的病例。

比利时和以色列报告首例新变异株感染者

在南非等国最先发现的新型新冠病毒变异株Omicron继续在非洲以外的更多国家和地区传播。26日,比利时和以色列各自报告了首例感染变异毒株Omicron的病例。

比利时卫生大臣范登布鲁克26日宣布,比利时发现了欧洲首例新型新冠病毒变异株Omicron的感染病例。据知情人士透露,该感染者本月11日从埃及入境比利时,22日出现症状后接受了新冠病毒核酸检测之后确诊。此前,该病例没有感染过新冠病毒,也没有接种过新冠疫苗。

同一天,以色列卫生部也发表声明称,该国发现其境内首例新型变异株Omicron的确诊病例。声明称,该病例来自非洲国家马拉维。此外,还有两名入境人员也疑似感染新型变异株。

美媒:纽约州长宣布纽约州进入“灾难紧急状态”

据美国全国广播公司(NBC)刚刚消息,由于担心德尔塔病毒及新发现的Omicron变异毒株的影响,美国纽约州州长霍楚(Kathy Hochul)宣布纽约州进入“灾难紧急状态”。

霍楚称,“我们看到在即将到来的冬天出现(新冠病例)峰值的预警信号,虽然纽约州尚未发现新的Omicron变异毒株病例,但它即将到来。”

报道称,美国纽约州25日新增6295例新冠肺炎确诊病例,新增28例死亡病例。

小结

1,Omicron突变株确实具有“超级毒株”的潜质,需要特别重视;但目前不宜过度解读这一突变株的实际危害,更不必恐慌。
2,尽快加速全球薄弱地区的疫苗接种,才是预防再次出现“超级毒株”的关键。
3,对于我们个人来说,除了尽快完成疫苗接种及加强接种之外,减少疫区旅行、戴好口罩、注意洗手,仍然是关键而有效的防疫措施。
文章来源:Hanson临床科研、环球时报、环球网、中国新闻周刊等

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