Ophthalmology： 1000例家族遗传性视网膜疾病的临床指导的分层测试策略研究
2017-06-04 cuiguizhong MedSci原创
爱荷华州卡夫医学院眼科与视觉科学系的Tucker BA团队近日在最新的Ophthalmology杂志上发表他们的一项重要工作，对1000例家族遗传性视网膜疾病进行了临床指导的分层测试策略研究。
爱荷华州卡夫医学院眼科与视觉科学系的Tucker BA团队近日在最新的Ophthalmology杂志上发表他们的一项重要工作，对1000例家族遗传性视网膜疾病进行了临床指导的分层测试策略研究。
他们的研究目的是对遗传性视网膜疾病实施多平台遗传检测，并从临床医生的角度描述1000例家庭遗传性视网膜疾病的临床表现。为了实现研究目的，他们通过回访的形式，从临床医生的角度来研究1000例家庭遗传性视网膜疾病。
Tucker BA团队搜集了从2010年1月至2016年6月期间被诊断为遗传性视网膜疾病的所有患者的临床资料，他们让同一位视网膜专业医师进行分析。每个患者被分配到62个诊断类别中的1个。通过这些临床诊断来确定分子研究的范围和顺序。每个受试者检测2~90万个核苷酸。
通过对敏感性和假基因型率等指标的观察，Tucker BA团队得到了一系列重要的发现。在760个家庭中鉴定了致病基因型（76％）。这些基因型分布在104个不同的基因。这104个基因中，有75％以上的具有可以有效包装到腺相关病毒中的小编码序列。 ABCA4突变是这些病例中（173个家族）最常见的致病原因。同时发现，有80个基因的突变可以导致5个家族性疾病（即0.5％或更少）。在576个没有下一代测序（NGS）的家族中也鉴定出了致病基因型。其中包括23个家族的RPGR外显子15重复区域有突变，而这些突变在使用下一代测序（NGS）检测时被遗漏。在其余424个家族中，使用全外显子测序的方法，发现了另外182个家族的基因突变。在其余242个家族中，使用全基因组测序的方法检测4个家族发现存在两种新的致病基因型，而这两种基因型都被其他方法忽视了。用临床上重点分层的方式对研究进行测试，发现灵敏度提高6.1％，成本降低17.7％，平均假基因型率要比使用全外显子测序时减少300多个基因（7.1％vs. 128％； P <0.001）。
目前，遗传性视网膜疾病的遗传检测灵敏度超过75％。临床指导的分层测试策略可以显着提高检测的灵敏度，而这并没有增加成本。
原文出处：
Stone， E.M.， et al.， Clinically Focused Molecular Investigation of 1000 Consecutive Families with Inherited Retinal Disease. Ophthalmology， 2017.
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