Lancet Oncol：GWAS技术发现胆囊癌新的DNA 突变
2017-03-06 生物360 生物360
科学家 3 月 5 日发表在《柳叶刀？肿瘤学》上的一项新研究报告，他们通过比较胆囊癌患者和健康人基因组中近 70 万个遗传密码，发现一些基因变异可能使个体更容易患这种病。这项工作是由约翰霍普金斯大学、美国国家癌症研究所（NCI）和印度塔塔纪念癌症中心的研究人员合作完成的。该研究让我们更好地了解这种胆囊癌高度致命疾病的原因，反过来可能导致我们对胆囊癌开发有更好的治疗方案。关于胆囊癌胆囊癌在大部分地区
科学家 3 月 5 日发表在《柳叶刀 肿瘤学》上的一项新研究报告，他们通过比较胆囊癌患者和健康人基因组中近 70 万个遗传密码，发现一些基因变异可能使个体更容易患这种病。
这项工作是由约翰霍普金斯大学、美国国家癌症研究所（NCI）和印度塔塔纪念癌症中心的研究人员合作完成的。该研究让我们更好地了解这种胆囊癌高度致命疾病的原因，反过来可能导致我们对胆囊癌开发有更好的治疗方案。
关于胆囊癌
胆囊癌在大部分地区比较罕见，但在一些人种中比较常见，如北美洲的土着美国人；另外其通常发生在特定的地区，如中美洲、南美洲、东亚和东南亚地区。全世界每年诊断出的 178000 个新增病例主要发生在这些高风险地区。
胆囊是浓缩和储存胆汁的小器官。若胆囊癌在发病早期被发现，患者有很大的生存几率；但大多数胆囊癌患者都是晚期才被发现，因为它很难被诊断出，往往会造成无特异性症状。
胆囊癌患者存在多个突变
为了寻找哪些基因可能对胆囊癌是至关重要的，塔塔纪念中心的研究员收集另外 1042 例患者的血液样本，这些患者 2010 年 9 月 -2015 年 6 月在孟买中心医院接受过治疗。研究人员还收集了同一时期的 1079 名健康受试者的血液样本。为了使分组具有可比性，研究人员以他们的年龄、性别和地理区域来进行分组。
研究人员通过单核苷酸多态性（SNP），比较不同个体基因组之间的单核苷酸突变。通过一系列的生物统计和生物信息学分析，研究人员发现邻近 ABCB4 和 ABCB1 基因存在多个 DNA 突变，这两个基因涉及参与肝脏、胆囊以及胆管的脂质流动。以往的研究揭示 ABCB4 与胆结石关联，是胆囊癌的已知风险因素。
研究的共同领导者 Nilanjan Chatterjee 博士说，新的研究结果表明，这个区域的遗传变异可能使患者进一步向胆囊癌发展，并非只是形成胆结石。
进一步验证
之后，研究人员收集了 447 例胆囊癌患者和 470 例健康受试者的血液样本，对这些结果进行了验证。他们还做了另一个分析，来评判胆囊癌患者中有多少突变风险可以通过常见变异的发现来解释。
Chatterjee 表示，胆囊癌与许多其他癌症和复杂疾病一样，可能与多个遗传标记相关，其每个突变可能导致小的影响，但他们的组合可以导致癌症风险的实质变异。
下一步研究
研究人员估计高达 25% 的胆囊癌风险可以用常见的基因变异来解释。虽然目前的研究已经确定了解释这种风险的一小部分特定的遗传变异，但事实上它们邻近于输送脂质的基因，这可能提供了引起胆囊癌的一个重要线索。研究人员希望未来能够在更大的群体中进行类似的研究。
目前，该小组计划通过完全测序深入的研究受试者的 ABCB4/ABCB1 区域，来判断他们是否是附加的风险突变。他们还计划进行更多的研究，以寻找与胆囊癌相关的其他基因。通过更好地了解遗传风险变异，调查环境和生活方式诱因，研究人员可能最终能够开发新的治疗和干预手段，以防止患者发生高危风险。
原始出处：
Sharayu Mhatre, Zhaoming Wang, Rajini Nagrani, Rajendra Badwe, Shubhada Chiplunkar, Balraj Mittal, and others.Common genetic variation and risk of gallbladder cancer in India: a case-control genome-wide association study.The Lancet Oncology Published: March 5, 2017
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