Nat Commun：前列腺癌转录组与疾病风险的相关性阐释了新的机制
2019-07-25 AlexYang MedSci原创
最近，有研究人员训练了前列腺组织基因表达顺式调控模型，并对来源于2个大群体的233955名欧洲血统的男性（14616前列腺癌（PrCa）案例，219939例对照）的全基因组转录数据进行了分析。研究发现，在12014个评估的基因中，研究人员鉴定了38个与PrCa相关的基因，并且许多基因在Kaiser Permanente RPGEH中重复。TMPRSS2表达的提高与PrCa风险的增加相关（与之前报道
最近，有研究人员训练了前列腺组织基因表达顺式调控模型，并对来源于2个大群体的233955名欧洲血统的男性（14616前列腺癌（PrCa）案例，219939例对照）的全基因组转录数据进行了分析。
研究发现，在12014个评估的基因中，研究人员鉴定了38个与PrCa相关的基因，并且许多基因在Kaiser Permanente RPGEH中重复。TMPRSS2表达的提高与PrCa风险的增加相关（与之前报道的风险变化无关），而且还与癌症基因组数据库中TMPRSS2：ERG融合致瘤基因在肿瘤中表达的提高相关，表明了一个新的生殖细胞-体细胞相互作用机制。另外，3个新基因HOXA4、KLK1和TIMM23在RPGEH群体中重复。更多的是，MSMB、NCOA4、PCAT1和PPP1R14A在跨种族元分析(n=9117)中与PrCa相关。另外，在位置权重矩阵、Chip-Seq和Hi-C实验数据中，许多基因都展现出了由PrCa主调控因子（包括了雄激素受体）引起的等位基因特异性转录激活证据，表明了相关基因共有的调控机制。
原始出处：
Nima C. Emami， Linda Kachuri， Travis J. Meyers et al. Association of imputed prostate cancer transcriptome with disease risk reveals novel mechanisms. Nat Commun. 15 Jul 2019
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前列腺癌相关研究，学习了，谢谢梅斯
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