Dermatology：儿童特应性皮炎皮肤鼻部微生物群及其与微丝蛋白基因突变的关系
2022-02-17 医路坦克 MedSci原创
特应性皮炎(AD)是一种慢性炎症性皮肤病，FLG突变是AD易感性最强的遗传风险因素，本文调查了有和没有FLG突变的AD儿童鼻部、皮损和非皮损皮肤的微生物群的差异。
特应性皮炎(AD)是一种慢性炎症性皮肤病，主要见于儿童。这种情况的特点是皮肤干燥、瘙痒，并伴有湿疹皮损，表现出与年龄相关的分布。AD的发病机制很复杂，包括皮肤微生物群的改变、表皮屏障功能障碍和免疫学改变。
AD患者皮肤微生物群的特点是细菌多样性低，金黄色葡萄球菌和表皮葡萄球菌丰度高，丙酸杆菌、链球菌、不动杆菌、棒状杆菌和普雷沃特氏菌属丰度低。皮肤微生物群不断与皮肤屏障和免疫系统相互作用，导致AD的炎症特征。以前的研究表明，以微丝蛋白基因(flaggrin gene，FLG)突变为特征的皮肤屏障损伤会导致纤维连接蛋白结合改变，皮肤pH值升高，丝氨酸蛋白酶活性增加，这可能导致定植模式的改变。此外，AD患者激活的辅助性T细胞2型(Th2)可以下调角质层微丝蛋白的表达。
FLG突变是AD易感性最强的遗传风险因素。文献中已经描述了多达113种不同的突变，这些突变的存在取决于种族背景。由于FLG基因的复杂性，第三个外显子编码10到12个几乎相同的重复序列，筛选该基因的突变一直是具有挑战性的。最近的一种方法，使用单分子分子反转探针(SmMIP)和下一代测序(NGS)，可以对整个基因进行全面测序。这项技术不只是筛查特定于群体的突变，而是能够分析整个基因，并检测特定于群体的突变以及以前没有发表过的特定突变。
这项研究的目的是使用一种新的smMIP测序技术来描述难治性AD儿童中FLG的整个突变背景。其次，我们描述了这一人群中的微生物群，并调查了有和没有FLG突变的AD儿童鼻部、皮损和非皮损皮肤的微生物群的差异。
方法：对77例难治性AD患儿进行横断面研究。使用单分子分子反转探针和下一代测序对FLG的整个编码区进行突变筛查。对前鼻孔、皮损和非皮损皮肤的细菌拭子进行16S rRNA测序分析。对于皮肤样本，对金黄色葡萄球菌和表皮葡萄球菌进行了额外的qPCR。
结果：FLG突变患者的患病率为40%，其中包括10种不同的突变。分析所有三个生态位的细菌拭子显示，生态位和FLG突变状态对整个微生物群的组成都有显著影响。使用子集分析来单独测试每个生态位的FLG突变状态的影响，并没有显示出与微生物群的显著关联。香农多样性和金黄色葡萄球菌丰度受到生态位的显著影响，但不受FLG突变的影响。
结论：我们的结果表明，FLG突变状态对整个微生物群的影响很小，与其说是由微生物丰富度和均匀性引起的，不如说是由现有属的差异引起的。
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