ACTA NEUROPATHOLOGICA：转录组分析将第二代非WNT/非SHH髓母细胞瘤亚群分为临床可处理的亚型

髓母细胞瘤（MB）是最常见的恶性小儿脑肿瘤之一，是一种由几种不同的临床分子亚型组成的异质性疾病。2012年，儿科神经肿瘤学界报告了四个不同的MB组：WNT-MB、SH-MB、第3组（Grp 3）MB和第4组（Grp 4）MB。2016年，世卫组织第四版中枢神经系统肿瘤分类包括三个主要分子MB组：WNT-MB、SHH-MB和非WNT/非SHH MB。后一个肿瘤队列包括Grp 3和4共识MB组，它们约占所有MB病例的65%。

与临床和分子观点不同，Grp 3和4 MB的一些具有良好的临床过程，而另一些则与极差的结果有关。在某种程度上，后者与高风险临床分子因素（年轻、晚期M期、大细胞和间变性组织学（LCA）、MYC扩增）有关，但在缺乏这些常规风险指标的情况下，大量Grp 3和4 MB复发。

2021年世卫组织第5版的CNS肿瘤分类采用了精炼的分子分类。此更新包括将非WNT/非SHH MB分为八个额外的亚组（通过I到VIII），每个亚组都有不同的分子和临床特征。Grp 3和4 MB的二次改进改善了它们的风险分层，因此作为目前患者纳入临床试验的标准程序变得更加整合。然而，一个重要的研究问题仍然是，在最近概述的这些第二代MB亚群（SGS MB）中，各种分子特性如何具有临床意义。

目前研究的目的是确定与生存相关的分子标记，以制定非WNT/非SHH MB队列和每个SGS MB的最佳风险分层，适合在临床实践中进一步应用。2023年4月24日发表在ACTA NEUROPATHOLOGICA的文章对574个非WNT/非SHH MB进行了基于DNA和RNA的分析，并分析了整个队列和8个SGS MB中各种分子模式的临床意义，目的是开发这些肿瘤的最佳风险分层。

通过DNA（a）和RNA-seq（b）分析将非wnt /非shh MB队列细分为8个第二代MB亚组(t-分布随机邻居嵌入分析(t-SNE))；c、d二代MB亚组II、III表现较差，IV、v亚组为中等；I、VI、VII和viii标准5年无进展生存期和总生存期

多基因分析揭示了几个生存相关基因，这些基因对这个非WNT/非SHH MB队列中的每个分子亚群具有高度特异性，亚群间重叠最小。这些亚组特异性和预后相关基因与SGS MB临床分子多样性和肿瘤驱动机制背后的途径有关。

通过结合每个SGS MB中的生存相关基因，确定了适合其最佳风险分层的不同元基因集。定义的子组特定元基因集是为每个SGS MB生成的多变量模型中的独立变量，其预后值在非WNT/非SHH MB的完全非重叠验证队列中得到确认。

目前的结果表明，将转录组数据整合到风险分层模型中可能会改善每个非WNT/非SHH SGS MB的结果预测。确定的亚组特异性基因表达签名可能与临床实施相关，并且可以采用与生存相关的元基因集来进一步进行SGS MB风险分层。未来的研究应旨在验证这些基于转录组的SGS MB亚型在前瞻性临床试验中的预后作用。

原始出处

Korshunov, A., Okonechnikov, K., Schrimpf, D. et al. Transcriptome analysis stratifies second-generation non-WNT/non-SHH medulloblastoma subgroups into clinically tractable subtypes. Acta Neuropathol (2023). https://doi.org/10.1007/s00401-023-02575-z