Briefings in Bioinformatics：为肿瘤精准诊断预测提供全新标志物体系，上科大刘雪松团队揭示新型肿瘤基因组DNA拷贝数变异模式
建立了适应原始数据来源广、已知拷贝数变异机制非依赖的、泛癌种适用的CNA模式识别与定量方法，并在不同数据中验证了该方法在癌症分型预后中的实际应用价值。
“生物世界”公众号 - 肿瘤，肿瘤标志物，DNA拷贝数 - 2023-02-23
DCR：预测结肠癌术后再入院的影响因子
手术后计划外的再次入院会对手术恢复产生负面影响。很少有研究试图确定仅在直肠癌队列中再入院的预测因子。这项研究旨在确定结肠癌术后30天的再住院的影响因子。
MedSci原创 - Predictors，proctectomy，Readmission - 2020-01-29
J Diabetes Res ：轻度糖尿病视网膜病变患者中血浆脂肪因子对视力影响的预测模型
糖尿病视网膜病变(DR)是2型糖尿病(T2DM)中常见的微血管病变，是导致成人视力障碍的主要原因之一。
MedSci原创 - 糖尿病视网膜病变，脂肪因子 - 2023-11-06
JACC: Cardiovascular Interventions：亚洲经导管主动脉瓣置换后假体-患者不匹配的发生率、预测因子和临床影响
该日本队列中TAVR后PPM的患病率低和1年死亡率低，意味着PPM不是亚洲TAVR患者中期死亡率的危险因素。
MedSci原创 - 经导管主动脉瓣置换术，假体-患者不匹配，患病率，危险因素 - 2018-04-17
Brief Bioinform：开发通过外周血检测乳腺癌的新方法
近日，中国科学院北京基因组研究所研究员方向东等在Briefings in Bioinformatics 发表题为Platform-independent approach for cancer detection
北京基因组研究所 - 乳腺癌，外周血，算法模型 - 2019-03-28
Brief Bioinform：中科院北京生科院赵方庆团队发表环形非编码RNA识别新技术
近日，国际学术期刊Briefings in Bioinformatics发表了中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队题为“Circular RNA identification based on multiple
中国科学院北京生命科学研究院 - 环形RNA，接头序列，生物信息学 - 2017-04-21
Bioinformatics：深圳市人民医院程立新团队发表多篇应用大数据和人工智能算法进行疾病诊断和预后的研究成果
该系列研究为未来多维组学数据的整合和特征降维提供了一个新框架，也为疾病诊断和预后模型的构建提供了新思路。
测序中国 - 人工智能，疾病诊断 - 2023-05-18
Brief Bioinform：肠道菌群和复杂疾病关系的分析方法
disorder-associated gut microbiota using microbiota-related gene set enrichment analysis”在国际生物信息学权威期刊《Briefingsin Bioinformatics》在线发表。
西安交大公卫学院 - 肠道菌群，全基因组，复杂疾病 - 2019-04-21
科学家利用机器学习让耐药检测更高效
中国科学院微生物研究所冯婕研究组等针对肺炎链球菌β-内酰胺耐药这一重要临床问题，采用机器学习的方法挖掘耐药相关数据的规律，建立了基因型和表型之间的联系。
微生物研究所 - 细菌，耐药性，基因 - 2019-07-22
AlphaFold是又一个“卡”中国脖子的核心技术？“我们必须从底层技术做起”
2022年7月28日，英国DeepMind公司表示，AlphaFold已经预测了全球几乎所有的蛋白质结构，短短一年时间，他们的蛋白质结构数据库中的数据从200万个扩增到超2亿个。
深究科学 ID: deepscience - 蛋白质，AlphaFold - 2022-08-14
郭安源教授与甘璐教授团队联合开发并验证肿瘤免疫治疗联用药物的通用筛选方法CM-Drug
郭安源教授和甘璐教授团队合作的这项开创性研究，为免疫治疗领域提供了一种全新的数据驱动的ICB联合治疗药物通用筛选方法CM-Drug，发现了大量潜在的ICB联用药物。
测序中国 - CM-Drug，免疫治疗，ICB - 2024-03-20
PLoS One：胃癌预后标记物hsa-miR-335
因此，筛选出能预测复发风险的潜在生物标志物是解决胃癌患者预后的关键问题。 近日，发表于PLoS One杂志上的一则研究证实hsa-miR-335可作为胃癌预后的标记物。
生物谷 - 胃癌，标记物，hsa-miR-335 - 2012-07-19
Am J Rhinol Allergy：MIR-17-5P在季节过敏性鼻炎病理中的作用研究
作为最流行的鼻炎类型，过敏性鼻炎包括了季节过敏性鼻炎（SAR）和永久过敏性鼻炎。最近，有研究人员尝试阐释SAR的机制。研究人员从基因表达综合数据库中提取了基因芯片数据集GSE43523（包括了7个SAR鼻上皮细胞和5个非过敏性对照鼻上皮细胞）数据。基于limma包，研究人员对2个组进行差异表达分析来获得差异表达的基因（DEGs）。另外，研究人员对DEGs基因的功能进行了富集分析。结合Cytosca
MedSci原创 - 过敏性鼻炎，生物信息，病理 - 2019-01-23
生物信息学：投稿， 审稿和拒稿的一些问答
ISCB的官方期刊是 Bioinformatics和 PLOS Comput Biology。其它重要期刊有 ACM-IEEE 的 Trans on Comput Biol and Bioinformatics (TCBB), J. Comput Biol. (JCB).
张洛欣博客 - 生物信息学，投稿 - 2016-12-04
Gut：鲁小杰博士“肝纤维化无创诊断系列研究”新成果
慢性肝病易导致肝纤维化和肝硬化，后者可导致门脉高压相关的各种并发症，严重影响患者生活质量和生存期。因此，肝纤维的早期诊断至关重要；而且，肝纤维化的处理也与其分级密切相关。
MedSci原创 - 肝纤维化，无创诊断，鲁小杰 - 2017-11-01
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