全新人类脑图谱---大脑连接组图谱被中国科学家绘成
中国科学院自动化所脑网络组研究中心蒋田仔团队联合国内外其它团队通过6年的努力，成功绘制出全新的人类脑图谱：脑网络组图谱。该图谱包括246个精细脑区亚区，以及脑区亚区间的多模态连接模式，突破了100多年来传统脑图谱绘制思想，引入了脑结构和功能连接信息对脑区进行精细划分和脑图谱绘制的全新思想和方法，比传统的Brodmann图谱精细
中国科学院自动化研究所 - 人类脑图谱，脑标本，神经纤维 - 2016-06-20
PNAS：上夜班使你的转录组失调
内源性昼夜节律系统的错位会导致生理节律的破坏，并可能导致与夜班工作相关的健康损害的发展。然而，这背后的分子基础仍有待阐明。
MedSci原创 - 夜班，昼夜节律，转录 - 2018-05-09
Nature Genetics：HPV全基因组整合图谱分析
来自华中科技大学、南方医科大学、华大基因研究院等机构的研究人员，通过对宫颈癌（cervical cancer）进行全基因组人类乳头瘤病毒（HPV）整合图谱分析，鉴别出了一些成簇的基因组热点，并揭示出了由微同源
生物通 - HPV，宫颈癌 - 2015-01-20
首个亚洲家猪 “超清” 基因组图谱发布
近日，生物学预印本服务器（BioRxiv）在线发表了中国优良地方猪——陆川猪的染色体级别的高质量定相（Phased）基因组序列。这不仅填补了亚洲家猪缺少高质量参考基因组的空白，更为基因组组装提供了新的方向。该项成果由中国农业科学院深圳农业基因组研究所（以下简称 “基因组所”）猪基因组设计育种创新团队主导完成。
中国科学报 - 基因组图谱 - 2019-10-09
Nat Genet：中枢神经系统相关的小胶质细胞的转录图谱
小胶质细胞是中枢神经系统（CNS）的组织驻留巨噬细胞，在突触的剪切、神经元可塑性以及维持大脑内的局部免疫监视中发挥着至关重要的作用。
MedSci原创 - 中枢神经系统，人诱导多能干细胞，小胶质细胞，转录图谱 - 2021-06-04
Nat commun：人类前列腺癌恶化和转移的基质和上皮转录图谱
尽管正常前列腺上皮恶化到侵入性癌症是由分子变异驱使的，肿瘤细胞和癌症微环境中的细胞是相互依赖的和共同进化的。到目前为止，很少有研究聚焦基质。最近，有研究人员对激光捕获显微切割的正常非瘤前列腺上皮组织进行了基因表达的分析，并且将该表达数据与从根治性前列腺切除术获得的非转的和瘤的低等级和高等级前列腺上皮组织的表达数据进行了比较，并且每一个样本都带有其周围的基质。研究发现，具有或者不具有肿瘤的前列腺良性
MedSci原创 - 前列腺癌，基质，上皮，转录图谱 - 2017-09-11
Blood：遗传-转录组学分析明确关键转录因子是人红白血病的驱动因素
急性红细胞白血病(AML-M6或AEL) 是一种罕见的侵袭性血液恶性肿瘤。既往研究表明，AEL白血病细胞通常携带已知的AML相关癌基因的复杂核型和突变。
MedSci原创 - 转录因子，急性红细胞白血病，AML-M6 - 2020-05-12
SCIENCE：单细胞转录组揭示人肾肿瘤的细胞身份
信使RNA编码细胞功能和表型。在人类癌症的背景下，它定义了恶性细胞的身份和肿瘤组织的多样性。
MedSci原创 - 肾脏，肿瘤，单细胞测序 - 2018-08-12
Nat Biotechnol发表新空间组学方法，同步实现转录组和代谢组的空间多模态精确分析
研究团队证明了在单个组织切片中结合SRT和MALDI-MSI并保留两种模式的特异性和敏感性的可能性，并在多巴胺和帕金森病条件下的小鼠和人类大脑样本中证明了该方法的潜力。
测序中国 - 空间多模态精确分析 - 2023-10-03
Nature Microbiology：克氏锥虫全基因组图谱分析
本文数据显示，胰蛋白酶体基因组被组织成染色质折叠结构域，转录受到局部染色质结构的影响。我们提出了一个表观遗传机制影响锥体基因表达的模型。
MedSci原创 - 全基因组，克氏锥虫 - 2023-11-11
Nucleic Acids Res：空间转录组学数据挖掘新算法——DeepST
研究团队研发了基于深度学习的空间域识别技术（DeepST）。DeepST使用预先训练好的深度神经网络模型从组织形态学信息（H&E染色图片）中提取图像特征，然后将提取的特征与基因表达和空间位置数据集成，
测序中国 - 数据挖掘，算法，空间转录组学 - 2022-10-24
J Ethnopharmacol：代谢组学结合转录组学揭示瓜蒌薤白汤抗慢性心肌缺血机制
该研究通过代谢组学结合转录组学揭示瓜蒌薤白汤抗慢性心肌缺血机制。
MedSci原创 - 中医药，代谢组学，转录组学，慢性心肌缺血，瓜蒌薤白汤 - 2022-09-21
Nat Med：血液转录组测序可提高罕见病的诊断率
斯坦福大学的研究人员近日发现，整合血液样本的转录组数据有助于提高罕见病患者的诊断率，并确定新的疾病相关基因。
生物通 - 血液，转录组测序，罕见病 - 2019-06-26
Nat Commun：研究揭示炎症促进癌细胞转录组改变的机制
炎症影响癌症发生，进展和治疗效果，但免疫信号传导驱动癌细胞转录组改变的机制目前仍不清楚。
MedSci原创 - 炎症，p53，NF-κB - 2017-10-11
脑网络组图谱：人类认识脑和脑疾病的利器
蒋田仔 中国科学院自动化研究所脑网络组研究中心主任 脑是人体最为复杂的器官。长期以来，人类对脑的结构和功能进行了大量的研究。如果想知道大脑是如何工作的，就必须有一个脑图谱，为复杂的脑部研究进行“导航”。因此，脑图谱一直以来都是研究脑结构和功能及脑疾病的重要手段。
《中国科学报》 - 脑网络，脑疾病 - 2015-07-10
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