Nature子刊:液体活检用于早筛新方法
在这篇文章描述了如何实现完整的DM-Seq方法来直接对5mC进行单独测序。与TAPS的比较发现了5mC检测的偏差,可能是由于DHU碱基的聚合酶扩增不良。
小桔灯网 - 液体活检 - 2023-08-04
Nat Commun:深圳大学苟德明团队开发血浆cfRNA检测技术,实现灵敏的癌症早期检测和分类
该研究为深入研究血浆cfRNA的组成及其在疾病中的生物学意义奠定了基础,SLiPiR-seq技术所检测的cfRNA生物标志物可以应用于疾病诊断、疗效预测、预后评估等多种情景的临床队列研究。
测序中国 - 癌症,生物标志物,cfRNA检测技术 - 2024-01-08
中美ctDNA肿瘤早期筛查技术进展研讨会顺利召开
2017年9月26日,由因合生物、瀚海基因、中南大学湘雅医院、北京大学深圳医院以及深圳市第二人民医院联合举办的“中美ctDNA肿瘤早期筛查技术进展研讨会”在厦门温德姆酒店举行。在该会议上,来自深圳市第二人民医院肿瘤科的田耕教授代表其研究团队向来自全国的临床专家及业界同行展示了利用基于Sec-Seq技术辅助肺癌诊断的让人激动人心的数据。
转化医学网 - ctDNA,肿瘤早期筛查,技术进展 - 2017-09-26
Cell子刊|曾湘祥团队发布单细胞测序数据工具箱——autoCell
该研究提出了一种用于scRNA-seq数据特征提取和缺失插补的深度模型autoCell。autoCell的关键创新是使用GMM来估计数据的潜在特征分布。
测序中国 - 创新,scRNA-seq数据特征,autoCell - 2023-01-11
浙江大学王永成团队Angew:高通量宿主-微生物单细胞RNA测序技术
scRandom-seq提供了一种高通量的跨物种双向单细胞RNA分析工具,将有助于未来发现并解开感染体系和肿瘤微环境等体系内的宿主-微生物相互作用的复杂关系。
BioMed科技 - RNA测序,scRandom-seq - 2024-03-05
Nat Biotechnol:解析单细胞组蛋白修饰动态关系的新方法:scChIX-seq
在不同细胞群中表征不同组蛋白修饰的大规模研究工作通常使用染色质免疫沉淀测序法(ChIP-seq)来完成,但每个单细胞只能检测一个组蛋白修饰。
测序中国 - 单细胞组蛋白,蛋白修饰抗体 - 2023-02-06
浙江大学在《Cell Discovery》发文揭示肾透明细胞癌中的关键调控程序
深入刻画ccRCC微环境中的细胞组成和基因组调控特征对于我们理解肿瘤致病机理和开发新的治疗策略具有重要意义。
网络 - 肾透明细胞癌,调控程序,ccRCC微环境 - 2022-07-30
Nat Genet:阿尔茨海默症和帕金森病的单核苷酸多态性研究, 揭示两种疾病的遗传风险位点的变异
阿尔茨海默症(AD)和帕金森病(PD)是两种最常见的神经退行性疾病。尽管全基因组关联研究(GWAS)已确定了多个潜在的基因风险位点。然而大多数风险位点都位于非编码区。
Bio生物世界 - 帕金森病,阿尔茨海默症,遗传风险 - 2020-11-25
这种新方法筛查宫颈癌 更快更准 还能避免不必要阴道镜检查!
早年常用巴氏涂片检查,为提高准确性,现在通常采用液基细胞学检测(LBC)和HPV病毒检测技术。虽然这些方法能够在癌症发生前发现和治疗癌前病变,但筛查的重点要么是检测
汉鼎好医友 - 宫颈癌 - 2019-08-18
Nucleic Acids Res:Tn-Seq数据统计方法新进展
近期,Nucleic Acids Res中一篇文章指出,Tn-Seq数据统计方法有了新进展。Tn-Seq是一种通过对复杂的随机转座子插入库的构造,来探索基因功能的实验方法;通过使用新一代的测序技术,对每一个突变的度进行量化。识别基因的相互作用是Tn-Seq的一项新兴应用,这包含了在不同遗传背景下进行Tn突变库的比较(例如野生型菌株与敲除型的比较)。为了识别基因间的相互作用,提出几种Tn-Seq数据
MedSci原创 - Tn-Seq,量化,基因 - 2017-03-25
PNAS:北京大学谢晓亮团队开发新型单细胞甲基化与羟甲基化测序技术
该研究提出了一种无亚硫酸氢盐的单细胞全基因组5mC和5hmC分析技术,命名为Cabernet,它可以在高基因组覆盖率下以单碱基分辨率表征5mC和5hmC。
iNature - 测序,单细胞甲基化,羟甲基化 - 2023-12-28
诺奖得主PNAS文章公布最新测序技术:重新定义DNA修复
近期来自北卡罗来纳州大学教堂山分校的研究人员利用先进的测序技术,分析澄清了这些修复系统中的关键分子细节,发现了核苷酸切除修复的奥秘。
生物通 - 测序技术,PNAS - 2017-02-13
Nat Commun:基于单细胞、空间和原位技术对肿瘤微环境进行高分辨率分析
基于商业化的全转录组单细胞、全转录组空间和靶向原位基因表达分析技术,研究人员探索了大型FFPE人类癌症切片中的组织异质性。
测序中国 - 生物标志物,肿瘤微环境,高分辨率分析 - 2024-01-27
振奋人心!深圳团队利用ctDNA检测肺癌,总检出率达91%,癌症变为不死慢性病终将实现!
近日,《美国经济学人》杂志报道,癌种早期筛查非常重要,尤其是男性高发前列腺癌和女性乳腺癌,如果采用早期筛查手段,患者生存率是100%,癌症将完全变成可控的慢性病,谈癌色变的情况也将不复存在。
贝壳社 - ctNDA,肺癌,检出率 - 2017-09-27
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