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Nat Commun:王建新/罗峰/肖传乐建立基于第<font color="red">三代</font><font color="red">测序数据</font>的二倍体组装算法

Nat Commun:王建新/罗峰/肖传乐建立基于第三代测序数据的二倍体组装算法

基于第三代测序数据,提出了二倍体的单倍型组装新算法,并开发了相应的软件PECAT。

测序中国 - 测序,二倍体组装算法 - 2024-04-10

关于<font color="red">三代</font>基因<font color="red">测序</font>,你所需要知道的都在这儿!

关于三代基因测序,你所需要知道的都在这儿!

一、导读:在大部分投资者对“二测序”(NGS)还没有搞清技术细节的情况下,“三代测序”(3GS)又火了。6月17日,医药板块中基因测序相关标的在“三代测序技术获得重大突破”的新闻影响上出现明显涨幅,我们也接到较多投资者对相关新闻的背景及观点的询问。为此,我们结合各方面资料归纳总结了三代基因测序的发展历史、原理、优劣势,以及国内外布局的公司等(也就是说,这是篇三代测序“科普文”)。此外,我们对

生物谷 - 基因测序,转化医学 - 2016-06-21

NEC OncoImmunity发布用于发现新HLA等位基因和肿瘤特异性HLA变体的独特HLA分型技术

NEC OncoImmunity发布用于发现新HLA等位基因和肿瘤特异性HLA变体的独特HLA分型技术

该文献描述了一种进行新HLA等位基因分型和肿瘤HLA表征的新方法,用于指导个性化癌症免疫治疗。 

网络 - HLA,肿瘤特异性HLA变体 - 2022-02-18

Nat Commun:王建新/罗峰/肖传乐建立甲基化检测新算法,可利用HiFi<font color="red">测序</font>准确检测基因组单倍型5mC

Nat Commun:王建新/罗峰/肖传乐建立甲基化检测新算法,可利用HiFi测序准确检测基因组单倍型5mC

基于PacBio HiFi测序技术,提出了可准确检测全基因组单倍型5mC的方法和流程,并开发了相应的软件ccsmeth和ccsmethphase。

测序中国 - 甲基化检测,HiFi测序,基因组单倍型5mC - 2023-07-19

<font color="red">三代</font><font color="red">测序</font>和它的时代丨奇点猛科技

三代测序和它的时代丨奇点猛科技

现在依托于第二高通量测序平台,我们已经开始尝试从基因的层面管理我们的生老病死。

奇点原创文章(公众号:geekhe - 三代测序 - 2017-03-29

【BioWeek资讯回顾】柳叶刀公布35国公民预期寿命,10大重磅药物面临专利过期,肥胖可能是种传染病……

【BioWeek资讯回顾】柳叶刀公布35国公民预期寿命,10大重磅药物面临专利过期,肥胖可能是种传染病……

为了帮助读者更好、更深入地了解前沿生物技术研究和生物行业内的成功商业模式。生物探索推出BioWeek栏目。通过综述生物圈内的产业动态和研究前沿,来帮助您更好地认识生物业内的“生态圈”。

生物探索 - 柳叶刀,药物,寿命 - 2017-02-27

人类细胞图谱计划在线发布50余万人类免疫细胞遗传图谱

人类细胞图谱计划在线发布50余万人类免疫细胞遗传图谱

上个月,国际人类细胞图谱会议上刚刚发布HCA项目最新进展。

生信者言 - 细胞图谱,免疫细胞,免疫系统 - 2018-04-14

ATAC-seq技术再升级:单分子<font color="red">测序</font>平台联手单细胞染色质可及性<font color="red">测序</font>技术

ATAC-seq技术再升级:单分子测序平台联手单细胞染色质可及性测序技术

基于二测序平台(NGS)的scATAC-seq技术利用Tn5酶的DNA随机打断功能,可以富集染色质局部开放区域上的基因组DNA短片段(通常80-300 bp),这些短片段被当作开放染色质的信号。

iNature - ATAC-seq技术再升级,单分子测序,单细胞染色质可及性测序技术 - 2022-11-13

Nat Commun:席瑞斌/苗素生团队开发长读长转录组<font color="red">数据</font>的分析工具包TAGET

Nat Commun:席瑞斌/苗素生团队开发长读长转录组数据的分析工具包TAGET

研究团队提出了一个名为TAGET的综合性计算工具包,用来分析Iso-seq全长转录组数据,包括转录本的映射和注释、基因融合的检测、差异表达分析以及差异同源异构体使用(DIU)分析。

测序中国 - 长读长转录组数据,TAGET - 2023-11-05

激光荧光推动<font color="red">测序</font>技术发展

激光荧光推动测序技术发展

DNA测序,无论从何种角度而言,都着实代表了生物检测最具活力的领域。尽管已历经25年发展,测序技术却没有合并为某种单一基本方法,而是发展出日益丰富的多样化技术(请参阅第 26页"表达谱和综合测序")。然而,激光激发的荧光技术依然是最为流行的检测方法。事实上,激光荧光技术在基因测序的发展中担任着关键的角色,测序环境的飞速变化也正在推动重要的产品趋势。 从Sanger法说起 首个成功测定一段

生物谷 - DNA测序,激光荧光 - 2015-06-23

Nat Commun:上海交大发布中国人胃癌泛基因组学分析

Nat Commun:上海交大发布中国人胃癌泛基因组学分析

该研究首次将全新的泛基因组研究方法用于人类肿瘤基因组研究。通过构建胃癌人群泛基因组,再以泛基因组作为参照将每一例全基因组测序数据予以比对。

“生物世界”公众号 - 胃癌,泛基因组学 - 2022-09-27

振奋人心!深圳团队利用ctDNA检测肺癌,总检出率达91%,癌症变为不死慢性病终将实现!

振奋人心!深圳团队利用ctDNA检测肺癌,总检出率达91%,癌症变为不死慢性病终将实现!

近日,《美国经济学人》杂志报道,癌种早期筛查非常重要,尤其是男性高发前列腺癌和女性乳腺癌,如果采用早期筛查手段,患者生存率是100%,癌症将完全变成可控的慢性病,谈癌色变的情况也将不复存在。

贝壳社 - ctNDA,肺癌,检出率 - 2017-09-27

Nature:36个中国人口的泛基因组参考

Nature:36个中国人口的泛基因组参考

中国大基因组联盟的数据表明,当个人来自代表性不足的少数民族群体时,发现新颖和缺失序列的显著增加。

MedSci原创 - 全基因组相关性研究,中国人 - 2023-07-18

Nature Methods:中国学者发表论文,介绍三代测序数据计算方法的突破

9月18日,中山大学中山眼科中心谢志、肖传乐、谢尚潜,中山大学数据科学与计算机学院陈颖,湖南农业大学罗峰等学者合作在Nature Methods杂志上发表了三代基因组测序数据计算方法(https://www.nature.com/nmeth/journal/vaop/ncurrent/full/nmeth.4432.html),此方法解决了该领域的关键技术难题。

Nature自然科研 - 中国学者,Nature,Methods,三代测序数据计算方法,突破 - 2017-09-20

Nat Methods十周年特刊:十大革命性生物学技术盘点

测序、CRISPR、单分子技术、细胞重编程、光遗传学、超高分辨率显微镜等纷纷上榜。 二测序测序或大规模并行测序的出现,几乎影响了生物学领域的每一个角落。这一技术允许科学家们测序基因组、评估遗传学变异、定量基因表达、研究表观遗传学调控、探索微观生命,将各种分析和筛选轻

MedSci原创 - 技术 - 2014-10-04

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