Nat Commun | 仅4个CpG甲基化位点即可识别肝癌患者,特异性100%,灵敏度98%
研究论证了高通量DNA甲基化测序方法的可行性,这种方法可以用少量血液对少量的CpG位点进行检测,以便对HCC患者进行分类。
测序中国 - 肝癌,CpG甲基化位点 - 2023-07-07
Genome Biol:大规模食管癌甲基化综合分析揭示细胞类型和癌症特异性表观遗传调控
研究团队证明食管癌中的大部分细胞类型特异性PMDs和差异甲基化区域(DMRs),实际上是源自相关细胞类型的其他癌症中共同发生的标记物。
测序中国 - 食管癌,甲基化 - 2023-09-12
CLIN CANCER RES:阻止特异性DNA甲基化特征用于诊断甲状腺结节
由于恶性结节和良性结节之间细胞学特征的重叠,甲状腺癌常常难以诊断。从而导致许多没有癌症的患者不必要地切除了甲状腺。分子学方法虽然可以在细胞病理学诊断基础上得到一些改进,常常无法为甲状腺结节提供正确的诊断。这些方法的基础是癌症和周围正常甲状腺组织之间存在差异,并假设邻近组织与良性结节相同。
MedSci原创 - 甲状腺结节,DNA甲基化,组织特异性 - 2019-01-27
Genome Biology | 纳米孔测序可用于检测cfDNA的细胞起源和癌症特异性甲基化特征
该研究结果表明,基于cfNano和Illumina的WGS和WGBS方法在检测DNA甲基化、片段化和CNA的癌症特异性特征方面性能基本一致。
测序中国 - 细胞起源,纳米孔测序,检测cfDNA - 2022-08-09
PNAS:基于甲基化图谱及深度学习模型,实现cfDNA组织特异性定性及定量研究
研究团队开发了第一个cfDNA监督组织反卷积方法,一个基于深度神经网络(DNN) 的模型cfSort,其可用于敏感和稳健地定量cfDNA中的组织成分。
测序中国 - cfDNA,深度神经网络,甲基化图谱 - 2023-07-25
女性致死率最高癌症可用DNA甲基化标志物特异性诊断!
Early Identification of Disseminated Breast Cancer.》的文章,文章指出,UCL团队发现了一个新的DNA标记区域,名为EFC#93,这是一个血清DNA甲基化标记物
转化医学网 - 乳腺癌,EFC#93,DNA甲基化 - 2017-12-27
Blood:赖氨酸特异性去甲基化酶1A (LSD1)限制人HSC的体外扩增,是UM171的靶点
在体外,抑制赖氨酸特异性脱甲基酶1A(LSD1)可促进人HSCs增殖。包含CoREST复合物的LSD1是HSC扩增激动剂UM171的主要靶点。
MedSci原创 - HSCs,LSD1抑制剂,UM171 - 2020-07-01
Nucleic Acids Research:李磊团队构建单细胞遗传调控平台解析疾病位点的细胞特异性机制
该研究整合了包括eQTLGen联盟,DICE项目和OneK1K在内的304个sc-eQTL数据集,涵盖了57种细胞类型和95种细胞状态,除了涉及外周血外,还囊括了脑和肺组织。
测序中国 - 全基因组关联分析,单细胞遗传调控平台,细胞特异性机制 - 2023-10-09
Nat Commun:基于特异性DNA甲基化特征的机器学习模型实现脑膜瘤的准确诊断和复发预测
该研究结果为采用抽血等非侵入性方法实施脑膜瘤术前检测和评估其复发风险预测奠定了基础,将对脑膜瘤患者的治疗和预后产生深远影响。
测序中国 - 脑膜瘤,DNA甲基化 - 2023-10-08
Nat Commun:山东大学王传新/杜鲁涛/李娟团队开发多重甲基化特异性定量PCR检测方法,可无创检测早期乳腺癌
研究团队开发了一种高效、便捷的多重甲基化特异性定量PCR检测方法(BC-mqmsPCR)用于检测乳腺癌,并在多中心队列中验证了其诊断性能。
测序中国 - 乳腺癌,多重甲基化 - 2023-09-06
Nature 子刊:白细胞介素2的位点特异性聚乙二醇化通过持续激活调节性T细胞增强免疫抑制
设计位点特异性的细胞因子聚乙二醇化能改善其治疗性能,用于治疗自身免疫性疾病。
MedSci原创 - 2021-10-03
Acta Neuropathologica: 神经元AD-tau病理的成熟包括在构象改变和原纤维形成之前细胞质和突触tau的位点特异性磷酸化
阿尔兹海默病(AD)的两个主要病理特征是以神经原纤维缠结(NFTs)形式存在的细胞内tau蛋白聚集体和斑块中淀粉样β蛋白(Aβ)的细胞外沉积。
MedSci原创 - tau蛋白,阿尔兹海默病,位点特异性磷酸化 - 2021-02-15
Nature发表最新人类细胞类型DNA甲基化图谱,发现不同个体相同细胞类型的甲基化模式极其相似
该研究报道了一个全面的初级人类细胞类型甲基化图谱,以及一套广泛的细胞类型特异性标记和计算工具,可用于混合细胞类型样本的片段级分析。
测序中国 - DNA甲基化,甲基化模式,细胞类型特异性高甲基化位点 - 2023-02-02
GUT:蛋白质生物标志物和替代无细胞DNA甲基化组序列测定的早期胰腺癌
与早期PDAC的CA19-9相比,包括蛋白质和甲基化cfDNA在内的循环标记的组合小组增加了鉴别性。
MedSci原创 - 早期胰腺癌,蛋白质生物标志物,无细胞DNA检测 - 2023-12-18
全基因组甲基化研究技术原理介绍
DNA甲基化是基因组DNA的一种主要表观遗传修饰形式。近年来,大量研究表明DNA甲基化修饰对于维持正常细胞功能、传递基因组遗传印记、胚胎发 育以及人类肿瘤发生,起着至关重要的作用。甲基化研究成为表观遗传学的热点,相应的技术也是层出不穷,根据实验目的的不同,这些技术大体能够分成两类:全 基因组(高通量)甲基化研究技术以及特异性甲基化位点(低通量)研究技术。
MedSci原创 - 甲基化,基因组 - 2014-02-05
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