Curr Eye Res:HSV-1感染原代人角膜上皮细胞的长非编码RNA转录特征及整合分析
广州医科大学基础医学院附属第二医院心血管病研究所的Cui YH等近日在Curr Eye Res发表了一篇重要的研究论文,他们研究了HSV-1感染的原发性角膜上皮细胞中lncRNAs和mRNAs表达的全基因组图谱
MedSci原创 - HSV-1,人角膜上皮细胞,长非编码RNA,转录特征,整合分析 - 2018-07-25
Cell:人类病理性Tau蛋白的翻译后修饰图谱可区分阿尔兹海默症的临床阶段
这项研究为人类疾病中病理性Tau亚型的分子特征提供了前所未有的定量和定性视图,这对于合理设计抗体和小分子治疗剂以及早期的临床诊断而言至关重要。
brainnews白色世界 - 阿尔兹海默症,临床阶段,病理性Tau蛋白 - 2022-08-30
Circulation:血浆蛋白质组学联合单细胞转录组学“排序”心梗后心衰标志物
心力衰竭(HF)是急性心肌梗死(MI)的最常见的远期并发症。了解与MI后HF相关的血浆蛋白及其基因表达可能会为发现生物标志物和药物靶标确定新的候选对象。
MedSci原创 - 心肌梗死,心力衰竭,蛋白质组学,生物标志物,单细胞转录组学 - 2020-10-15
Nat Med:张泽民研究组与合作者发表单细胞水平的肺癌 T 淋巴细胞免疫图谱
考虑到肿瘤微环境的复杂性,近年来单细胞转录组测序技术逐渐被广泛应用于肿瘤浸润免疫细胞的研究当中。
生物360 - 非小细胞肺癌,基因诊断l,图谱 - 2018-06-27
Cell Death Dis:MYC调控假基因HMGA1P6转录促进卵巢癌发生发展
人类基因组中多达18,000个假基因,其中三分之二能够被转录。越来越多的证据表明,假基因具有功能作用,能够潜在地调节蛋白质编码基因的转录水平及转录后水平。
MedSci原创 - 卵巢癌,假基因,HMGA1P6,MYC - 2020-03-19
Sci Transl Med:新机器学习方法ARTEMIS绘制人类癌症重复元件图谱,助力癌症早期检测和组织溯源
以上分析揭示了人类癌症重复元件图谱的广泛变化,并提供了一种无创检测和表征癌症的方法,这可能有利于癌症患者的早期检测和疾病监测。
测序中国 - 癌症,重复元件图谱 - 2024-04-24
NAR:伯晓晨课题组基于可解释机器学习模型,探索转录因子调控的发育和演化规律
随着未来更多物种胚胎Hi-C数据的积累,TFCRs在跨物种早期胚胎中的转录调控机制及其在基因组三维构象的作用有待进行更详细的研究。
测序中国 - 转录因子,胚胎发育 - 2024-06-10
Nat Commun:席瑞斌/苗素生团队开发长读长转录组数据的分析工具包TAGET
研究团队提出了一个名为TAGET的综合性计算工具包,用来分析Iso-seq全长转录组数据,包括转录本的映射和注释、基因融合的检测、差异表达分析以及差异同源异构体使用(DIU)分析。
测序中国 - 长读长转录组数据,TAGET - 2023-11-05
SCI REP:舌癌和肺癌中,由c-Myc转录调节的TCRP1赋予了癌症药物抗性
耐药性仍然是癌症治疗的主要问题。 然而,治疗抗性的机制是复杂的,并且在许多癌症中,我们对此的研究还不够深入。 因此,阐明化学耐药性的准确分子机制对于改善临床上的现行治疗具有重要意义。在之前的研究中,我们克隆了一种称为“舌癌抗性相关蛋白1”(TCRP1)的新基因,其调节肿瘤发生,增强癌症中的顺铂(cDDP)抗性,并且可能是逆转耐药性的潜在靶标。
MedSci原创 - 舌癌,肺癌,药物抗性 - 2017-06-19
Cell Death Dis:PCDHGA9通过降低β-catenin转录活性抑制胃癌上皮-间质转化及转移潜能
PCDHGA9通过介导Wnt/β-catenin信号通路和TGF-β通路抑制上皮-间质转化(EMT)过程, 还能够抑制癌细胞的侵袭及转移.
MedSci原创 - 胃癌,上皮-间质转化,PCDHGA9 - 2020-04-14
PNAS:AML衰老和综合分子图谱成功构建,揭示老年患者的基因融合减少而基因突变增加
研究团队通过对一个大型AML队列进行分析,发现基因融合(GF)事件是年轻患者的主要驱动因素,而基因突变构成了老年患者的主要基因组异常。
测序中国 - 衰老,基因融合,AML - 2024-04-08
Diabetologia:1型糖尿病遗传易感性儿童的血液转录组学中肠道病毒相关的变化
近日,国际杂志 《Diabetologia》上在线发表一项关于1型糖尿病遗传易感性儿童的血液转录组学中肠道病毒相关的变化的研究。研究人员的目标是使用全基因转录组学数据来描述患有1型糖尿病遗传易感性的儿童的全血样品中肠道病毒相关的变化的特征。 研究人员从28对患1型糖尿病的风险增加
MedSci原创 - 1型糖尿病 - 2018-04-24
Nat Genet:原发性前列腺癌中,TMPRSS2–ERG调控转录因子和可激活NOTCH信号通路
TMPRSS2-ERG(T2E)结构重排代表了大约50%的前列腺肿瘤,并且可以导致ERG转录因子的过度表达。研究发现,该差异由HOXB13和FOXA1的ERG征用调控,从而完成一种T2E特异性的转录表达。另外,研究人员还报道了关于结构重排ERG
MedSci原创 - 前列腺癌,转录因子,信号通路 - 2017-08-12
Journal of Translational Medicine:专家绘制出基于中国人群肝内胆管癌“基因图谱” 致力精准施治
获悉,复旦大学附属肿瘤医院肝脏外科团队成功绘制出基于中国人群的肝内胆管癌的“基因图谱”,揭示其基因变异特征。
中国新闻网 - 肝内胆管癌 - 2020-08-05
J Allergy Clin Immunol:鼻腔和血液转录组通路分析揭示草花粉免疫治疗的临床反应基础
研究人员利用 GRASS 研究的年度生物样本分析了免疫治疗反应的分子机制。所揭示的响应过程同时受到 SCIT 和 SLIT 的影响,为指导AIT 治疗新策略提供了潜在靶点。
MedSci原创 - 过敏性鼻炎,临床反应,分子基础 - 2023-07-20
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