Nat Commun：王建新/罗峰/肖传乐建立甲基化检测新算法，可利用HiFi测序准确检测基因组单倍型5mC
基于PacBio HiFi测序技术，提出了可准确检测全基因组单倍型5mC的方法和流程，并开发了相应的软件ccsmeth和ccsmethphase。
测序中国 - 甲基化检测，HiFi测序，基因组单倍型5mC - 2023-07-19
NAR：北京大学汤富酬团队利用单精子长读段基因组测序进行高精度单倍型分型
该研究开发了一种基于长读长的单精子基因组测序方法和相应的数据分析管道，可以准确地识别单个精子中的交叉事件和染色体水平的非整倍体，并有效地检测单个精子细胞中的SVs。
iNature - 基因组测序 - 2023-07-18
Nat Commun：结合HiFi、Hi-C技术优势的新算法pstools，可高效、准确重建癌症染色体单倍型基因组
该研究将高分辨率测序技术应用于COLO829癌症系，并开发了一种快速、准确的计算方法pstools。
测序中国 - 癌症染色体单倍型基因组，pstools - 2023-05-06
2020 ESPGHAN意见书：单基因型炎症性肠病的临床基因组学诊断
2020年12月，欧洲儿科胃肠病学、肝病学和营养协会(ESPGHAN)儿童IBD波尔图小组发布了关于单基因型炎症性肠病的临床基因组学诊断意见书。单基因型炎症性肠病的鉴别很重要，因其治疗不同于传统类型I
J Pediatr Gastroenterol Nutr . 2020 Dec 16; - 炎症性肠病 - 2020-12-30
Blood：MBD4可抵抗甲基化损伤，缺失可促进克隆性造血、增加AML的患病风险
中心点：DNA糖基化酶MBD4具有抵抗5-甲基胞嘧啶（5mC）去氨基化损伤的作用。生殖细胞MBD4缺陷可刺激克隆性造血，并通过DNMT3A反复突变促进白血病的发生。摘要：5-甲基胞嘧啶（5mC）自发脱氨基作用在人类基因组修饰中发挥重要作用，这类甲基化损伤仍是随着年龄增长而积累的体细胞突变的主要来源。在不同的组织中，5mC脱甲基作用对癌症风险有什么样的影响，目前尚未明确。Mathijs A. San
MedSci原创 - MBD4，克隆性造血，AML，去甲基化 - 2018-08-01
Nature子刊 | 全酶、无损的甲基化测序新方法“DM-Seq”，可以单碱基分辨率直接测序5mC
研究团队开发了一种仅使用酶的DNA甲基化测序新方法——“直接甲基化测序（DM-Seq）”。
测序中国 - DM-Seq，单碱基分辨率 - 2023-07-17
PNAS：北京大学谢晓亮团队开发新型单细胞甲基化与羟甲基化测序技术
该研究提出了一种无亚硫酸氢盐的单细胞全基因组5mC和5hmC分析技术，命名为Cabernet，它可以在高基因组覆盖率下以单碱基分辨率表征5mC和5hmC。
iNature - 测序，单细胞甲基化，羟甲基化 - 2023-12-28
Nature子刊：液体活检用于早筛新方法
在这篇文章描述了如何实现完整的DM-Seq方法来直接对5mC进行单独测序。与TAPS的比较发现了5mC检测的偏差，可能是由于DHU碱基的聚合酶扩增不良。
小桔灯网 - 液体活检 - 2023-08-04
Sci Adv：DNA修饰检测新方法DARESOME，可同时分析单细胞和cfDNA中的多种DNA修饰
研究团队提出了一种基于限制性内切酶、可同时检测多种表观基因组状态的DNA分析方法“DARESOME”。
测序中国 - DNA修饰检测，DARESOME - 2023-10-15
IVD新技术丨 DNA和RNA超快速检测方法
使用优化配方，短时间高温处理即可提供了比传统BS条件低得多的背景，特别是在具有高GC含量或高度结构化的基因组区域，如mtDNA。
小桔灯网 - 检测，DNA，RNA，BS-seq - 2024-01-28
Nat Commun:Nature子刊 压力会让大脑基因的表观遗传发生改变
近日，Nature Communications杂志上的一项研究发表了一种此前在动物机体中功能尚未明确的DNA修饰：A（腺嘌呤）甲基化。研究人员认为，在压力条件下大脑似乎更容易出现这种腺嘌呤甲基化，并且可能在神经精神疾病中扮演者重要角色。
生物探索 - 压力，大脑基因，表观遗传，改变 - 2017-10-27
NATURE：我国研究人员发现藻类TET同系物催化DNA修饰
将胞嘧啶甲基化为5-甲基胞嘧啶（5mC）是在许多生物中普遍存在的DNA修饰。已有的研究显示，10-11易位（TET）双加氧酶对5mC的连续氧化导致一系列额外的表观遗传标记，并促进哺乳动物中DNA的去甲基化。
MedSci原创 - DNA甲基化 - 2019-05-04
发表新型单碱基分辨率测序方法，可同时获取DNA的遗传和表观遗传信息
DNA中存储着多个维度的信息，包括遗传和表观遗传基础中的分子信息，这两者都对我们理解生物学至关重要。
测序中国 - 新型单碱基分辨率，DNA的遗传 - 2023-03-11
Cell Stem Cell：受精卵DNA去甲基化重要机制
国际知名学术期刊《细胞—干细胞》Cell Stem Cell在线发表了中科院上海生科院生化与细胞所徐国良研究组、李劲松研究组和北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬研究组的最新研究成果“Active
MedSci原创 - 受精卵，DNA，去甲基化 - 2014-09-16
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