Nat Commun：全基因组分析揭示鼻咽癌中的病毒-宿主作用
2021-07-09 xiaozeng MedSci原创
鼻咽癌（NPC）是一种病因复杂的肿瘤，具有流行病学、组织学和病毒特征的独特组合。
鼻咽癌（NPC）是一种病因复杂的肿瘤，具有流行病学、组织学和病毒特征的独特组合。每年约有129,000名新诊断NPC患者，其中东南亚、北非和北美北部地区的因纽特人的发病率最高。
NPC的特征表现为低分化状态的恶性上皮细胞位于复杂的微环境中，在该微环境中存在淋巴细胞的大量浸润，这也导致出现具有明显炎症表型的淋巴上皮瘤。
爱泼斯坦 - 巴尔病毒（EBV）是一种广泛存在于人群中的疱疹病毒，既往研究显示，恶性细胞中均呈现EBV阳性。B淋巴细胞中EBV的持续潜伏感染与几种B细胞恶性肿瘤具有因果关系，包括伯基特淋巴瘤、霍奇金病、艾滋病相关淋巴瘤、弥漫性大B细胞淋巴瘤，以及相关上皮肿瘤（如NPC和胃癌等）。
然而，在NPC的发生发展过程中，EBV的感染和获得性遗传改变之间的相互作用尚不明确。
在该研究中，研究人员对70个NPC样本进行全基因组分析，通过将肿瘤细胞的全基因组测序（WGS）数据与EBV的癌基因表达情况相结合，以揭示肿瘤发生过程中细胞-病毒之间相互作用的相关机制。
NPC的全基因组景观
结果显示，在90%的NPC中，基因组突变伴随着EBV编码的LMP1的表达能够诱导组成型NF-κB的激活。研究人员发现，类似的体细胞突变和病毒基因表达能够破坏79%的先天免疫和47%的适应性免疫，尽管其具有促炎表型，但NPC可逃避免疫监视。
此外，损害TGFBR2的基因组突变能够促进肿瘤的发生发展并稳定肿瘤细胞中的EBV感染状态。CDKN2A/CDKN2B缺失断点的精细定位显示，32-34%的NPC中存在纯合的MTAP缺失，这对MAT2A抑制作用具有显著的敏感性。
鼻咽癌的全基因组水平常改变的相关癌症通路
总而言之，该研究结果表明，NPC是一种均质的NF-κB驱动和受免疫保护的癌症，同时也揭示了NPC的潜在的药物治疗靶标。
原始出处：
Bruce, J.P., To, KF., Lui, V.W.Y. et al. Whole-genome profiling of nasopharyngeal carcinoma reveals viral-host co-operation in inflammatory NF-κB activation and immune escape. Nat Commun 12, 4193 (07 July 2021).
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