同源重组修复相关（HRR）基因突变谱分析及其在中国食管和胃癌患者中与TMB的关联
2023-06-21 daikun MedSci原创 发表于上海
该研究旨在对中国食管癌和胃癌患者的同源重组修复相关（HRR）基因突变谱进行分析。
同源重组修复缺陷（HRD）与肿瘤发生有关，可以用以预测PARP抑制剂（PARPi）治疗和免疫治疗的反应。同源重组修复相关 （HRR） 基因的功能丧失或有害突变有助于 HRD 表型。
方法：对1237例中国食管癌和胃癌患者的肿瘤组织样本进行551个癌症相关基因测序。基于临床证据，共选择了15个HRR基因（ATM，BRCA1，BRCA2，BARD1，BRIP1，CDK12，CHEK1，CHEK2，FANCL，PALB2，RAD51B，RAD51C，RAD51D，RAD54L，PPP2R2A）。纳入了623名来自TCGA数据集的WES数据的患者进行分析。
结果：在中国队列中，25.1%（62/247）食管癌（EC）患者和20.71%（205/990）胃癌（GC）患者表现出体细胞HRR（sHRR）基因突变。最常见的突变基因是EC中的CHEK2（7%）和GC中的ATM（8%）。48.16%（118/245）EC患者和50.66%（498/983）GC患者中出现胚系HRR（gHRR）基因突变。BRCA2是最常见的突变基因（EC为22%，GC为9%）。4.84%EC患者和4.14%GC患者同时携带胚系和体细胞HRR基因突变。与sHRR-WT患者相比，sHRR-Mut患者的中位TMB更高（EC，8.09 vs 4.41，p < 0.001;GC，8.09 vs 4.26，p < 0.001）。
然而，gHRR-Mut和gHRR-WT患者的中位TMB相似（EC，5.67 vs 5.67，p = 0.903;GC，4.96 vs 4.41，p = 0.356）。在TCGA队列中，15.68%（29/185）EC患者和23.97%（105/438）GC患者表现出sHRR基因突变。最常见的突变基因是ATM（EC为5%，GC为10%）。与sHRR-WT患者相比，sHRR-Mut患者的中位TMB更高（EC，4.78 vs 2.75，p < 0.001;GC，21.23 vs 2.65，p < 0.001）。对于TCGA胃癌队列，与sHRR-WT患者相比，sHRR-Mut患者的中位总生存期明显更好（46.9个月对26.5个月，p = 0.043）。
结论：该研究报道了中国食管癌和胃癌患者HRR基因的遗传景观。体细胞HRR基因突变患者的TMB水平显著升高。在胃癌中，携带体细胞HRR基因突变的患者OS显着延长。
参考文献
DOI: 10.1200/jco.2023.41.16_suppl.e16000
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