Mol Biosyst：重建ceRNA网络揭示类风湿性关节炎中LncRNA的功能
2017-09-24 MedSci MedSci原创
类风湿性关节炎（RA）是一种病原学不明的自身免疫性疾病，约占普通人群的1.0％。越来越多的研究表明，长链非编码RNA（lncRNA）可能在各种生物过程中起重要作用，并与不同种疾病（包括RA）的发病机制相关。虽然研究已经发现了大量的lncRNA，但我们对其功能和生理/病理学意义的了解仍处于起步阶段。为了揭示功能性lncRNA并鉴定RA中关键的lncRNA，研究人员使用来自美国国家生物技术信息中心高通
类风湿性关节炎（RA）是一种病原学不明的自身免疫性疾病，约占普通人群的1.0％。越来越多的研究表明，长链非编码RNA（lncRNA）可能在各种生物过程中起重要作用，并与不同种疾病（包括RA）的发病机制相关。虽然研究已经发现了大量的lncRNA，但我们对其功能和生理/病理学意义的了解仍处于起步阶段。
为了揭示功能性lncRNA并鉴定RA中关键的lncRNA，研究人员使用来自美国国家生物技术信息中心高通量基因表达数据库获取的数据和本研究既往的成果，在竞争性内源性RNA（ceRNA）理论的基础上重建了ceRNA网络。同时，使用Cytoscape插件BinGO和AVID分别进行基因本体（GO）和途径分析。
结果发现lncRNA-miRNA-mRNA网络包括了7个lncRNA节点，90个mRNA节点，24个miRNA节点和301个边缘。功能分析显示，147个GO术语和23个途径富集。另外，三种lncRNA（S5645.1，XR_006437.1，J01878）与RA高度相关，因此被选为关键的lncRNA。
总之，这项研究表明特定的lncRNA与RA的发展有关，三种lncRNA（S5645.1，XR_006437.1，J01878）可用作RA潜在的诊断生物标志物和治疗靶点。
原始出处：
Hui Jiang, Rong Ma, et al., Reconstruction and analysis of the lncRNA–miRNA–mRNA network based on competitive endogenous RNA reveal functional lncRNAs in rheumatoid arthritis . Molecular BioSystems, 2017-04-25 , DOI: 10.1039/C7MB00094D
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