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Nature Methods:中国科学院彭广敦开发新的空间多组学技术,解密小鼠脑发育的时空谱系

Nature Methods:中国科学院彭广敦开发新的空间多组学技术,解密小鼠脑发育的时空谱系

该研究报道了基于微流控索引的转座酶可及染色质和RNA测序的空间分析(MISAR-seq),这是一种染色质可及性和基因表达的空间分辨联合分析方法

iNature - 空间多组学技术,时空谱系,MISAR-seq - 2023-05-28

孕妇血浆cfDNA遗传去卷积分析实现胎儿染色体异常和单基因病的同步筛查 | Cell Discovery

孕妇血浆cfDNA遗传去卷积分析实现胎儿染色体异常和单基因病的同步筛查 | Cell Discovery

但NIPT在检测疾病范围、目标疾病的检测性能等方面还有较大的提升空间,亟需对NIPT这一重要临床检测技术进行实验方法学和

网络 - 2022-10-18

单细胞转录组测序技术在非小细胞肺癌免疫微环境分析中应用的研究进展

单细胞转录组测序技术在非小细胞肺癌免疫微环境分析中应用的研究进展

根据2020年的数据[1],肺癌是世界上第二常见的癌症,同时也是癌症死亡的最重要原因。与小细胞肺癌相比,非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)更为常见[2]。

中国胸心血管外科临床杂志 - 单细胞转录组,非小细胞肺癌,免疫微环境 - 2024-03-17

Front Immunol:强直性脊柱炎患者外周血单个核细胞的整合单细胞RNA-<font color="red">SEQ</font>和ATAC-<font color="red">SEQ</font>分析

Front Immunol:强直性脊柱炎患者外周血单个核细胞的整合单细胞RNA-SEQ和ATAC-SEQ分析

强直性脊柱炎(AS)是一种免疫介导的脊柱关节病。该研究集中在T细胞如何参与AS的发病机制,这将丰富AS单细胞研究的数据,为理解AS的发病机制提供新的视角。

MedSci原创 - 强直性脊柱炎,整合单细胞RNA-SEQ,ATAC-SEQ - 2022-02-19

群雄逐鹿下PD-1/PD-L1专利布局策略

群雄逐鹿下PD-1/PD-L1专利布局策略

国外大企业在PD-1靶点研发与专利布局保护的策略,值得国内企业参考学习。

药渡 - PD-1,PD-L1 - 2019-02-17

GENOME BIOLOGY:scIBD用于增强单细胞染色质可及性测序中异型双联体的检测

GENOME BIOLOGY:scIBD用于增强单细胞染色质可及性测序中异型双联体的检测

scIBD 引入了一种自适应策略来模拟高置信度异型双联体,并以迭代优化的方式自我监督双联体检测。对各种模拟和真实数据集的全面基准测试证明了 scIBD 的卓越性能和稳健性。

MedSci原创 - 单细胞染色质,单细胞染色质可及性测序技术,scIBD,异型双联体 - 2023-10-11

PNAS:北京大学谢晓亮团队开发新型单细胞甲基化与羟甲基化测序技术

PNAS:北京大学谢晓亮团队开发新型单细胞甲基化与羟甲基化测序技术

该研究提出了一种无亚硫酸氢盐的单细胞全基因组5mC和5hmC分析技术,命名为Cabernet,它可以在高基因组覆盖率下以单碱基分辨率表征5mC和5hmC。

iNature - 测序,单细胞甲基化,羟甲基化 - 2023-12-28

Nature子刊 | 范骁辉/陈华钧/高月团队开发空间解卷积算法Bulk2Space,将Bulk转录组重构至单细胞空间分辨率

Nature子刊 | 范骁辉/陈华钧/高月团队开发空间解卷积算法Bulk2Space,将Bulk转录组重构至单细胞空间分辨率

Bulk2Space具有很好的生物学和临床应用前景,包括揭示细胞的空间特异性变异,发现新基因的空间表达模式,实现更精细的细胞聚类,预测分子疾病进展的潜在机制等。

测序中国 - Bulk2Space,Bulk转录组,单细胞空间分辨率 - 2022-11-26

孕妇血浆cfDNA遗传去卷积分析实现胎儿染色体异常和单基因病的同步筛查

孕妇血浆cfDNA遗传去卷积分析实现胎儿染色体异常和单基因病的同步筛查

NIPT是筛查常见胎儿染色体非整倍体和染色体微缺失微重复综合征最有效的技术手段。

测序中国 - 胎儿染色体,孕妇血浆cfDNA - 2022-11-09

Science :连续取得进展!张锋等团队开发新技术,为系统性遗传学研究奠定基础

Science :连续取得进展!张锋等团队开发新技术,为系统性遗传学研究奠定基础

人类遗传学研究发现了成千上万个基因座的遗传变异与复杂的人类疾病之间的关联。特别是,对基于三重基因的全外显子测序(WES)的分析表明,存在大量的从头丧失功能的变异,这些变异导致了神经发育病理的风险。

生物探索 - 自闭症,系统性遗传学,经发育延迟 - 2020-11-29

IVD新技术丨 DNA和RNA超快速检测<font color="red">方法</font>

IVD新技术丨 DNA和RNA超快速检测方法

本文报道了一种用于DNA和RNA的超快速BS-seq方法。使用优化配方,短时间高温处理即可提供了比传统BS条件低得多的背景,特别是在具有高GC含量或高度结构化的基因组区域,如mtDNA。

小桔灯网 - 检测,DNA,RNA,BS-seq - 2024-01-28

Nat Genet:阿尔茨海默症和帕金森病的单核苷酸多态性研究, 揭示两种疾病的遗传风险位点的变异

Nat Genet:阿尔茨海默症和帕金森病的单核苷酸多态性研究, 揭示两种疾病的遗传风险位点的变异

阿尔茨海默症(AD)和帕金森病(PD)是两种最常见的神经退行性疾病。尽管全基因组关联研究(GWAS)已确定了多个潜在的基因风险位点。然而大多数风险位点都位于非编码区。

Bio生物世界 - 帕金森病,阿尔茨海默症,遗传风险 - 2020-11-25

Science:开发出TT-<font color="red">Seq</font>技术绘制人类瞬时转录组图谱

Science:开发出TT-Seq技术绘制人类瞬时转录组图谱

如今,在一项新的研究中,德国慕尼黑理工大学计算生物学教授Julien Gagneur团队和德国马克斯普朗克生物物理化学研究所教授Patrick Cramer团队如今开发出一种方法

生物谷 - TT-Seq技术,人类瞬时转录 - 2016-06-04

GPB:国家儿童医学中心/北京儿童医院发表基于单细胞转录组数据准确识别病毒感染信息的新算法DVsc

GPB:国家儿童医学中心/北京儿童医院发表基于单细胞转录组数据准确识别病毒感染信息的新算法DVsc

该研究开发了一套新流程DVsc,利用单细胞RNA测序探索病毒复制过程中的病毒多样性和细胞变异,能够同时检测感染的细胞,揭示细胞内多种病毒的组成。

测序中国 - 单细胞RNA测序,DVsc - 2023-12-29

染色质免疫沉淀-测序(ChIP-seq):全基因组范围研究蛋白质-DNA相互作用的新技术

 染色质免疫沉淀-测序(ChIP-seq)是近年来新兴的将染色质免疫沉淀(ChIP)与深度测序技术相结 合,在全基因组范围内分析DNA结合蛋白结合位点、组蛋白修饰、核小体定位和DNA甲基化的高通量技术.在新一代测序(NGS)技术的大力推动 下,ChIP-seq提供了一种相对于ChIP-chip高分辨率、低噪音、高覆盖率的研究方法.随着测序成本的降低,ChIP-seq逐步成为研究基因

生物化学与生物物理学进展 - ChIP,seq,染色质免疫沉淀,基因组 - 2014-01-03

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