NAR:哈工大/腾讯AI实验室合作构建迄今最大规模的单细胞蛋白质组数据库SPDB
哈尔滨工业大学研究团队联合腾讯人工智能实验室团队构建了一个全面的单细胞蛋白质组学数据库SPDB。
测序中国 - 癌症研究,单细胞蛋白质组数据库,SPDB - 2023-12-01
Nat Neurosci: fMOST助力构建全球单细胞投射组学数据库
单细胞投射组学结果表明这些投射神经元具有64个亚型(IT具有44个亚型,PT具有12个亚型,CT具有8个亚型)。
“神经周K”公众号 - fMOST,单细胞投射 - 2022-09-14
NAR:世界上首个基于荧光图像数据的单细胞多组学数据库——iSMOD
研究提供了一种统一多组学数据和技术的先进研究方法,开发了世界上首个基于图像的单细胞多组学数据库的综合浏览器——iSMOD。
测序中国 - 单细胞多组学数据库,iSMOD - 2023-07-16
Circulation:血浆蛋白质组学联合单细胞转录组学“排序”心梗后心衰标志物
了解与MI后HF相关的血浆蛋白及其基因表达可能会为发现生物标志物和药物靶标确定新的候选对象。
MedSci原创 - 心肌梗死,心力衰竭,蛋白质组学,生物标志物,单细胞转录组学 - 2020-10-15
Genome Medicine:基于人血浆蛋白质组与基因组数据,鉴定新型CRC蛋白质标志物及药物靶点
研究团队对4,853种血浆蛋白与CRC风险之间的因果关联进行了全面研究;采用单细胞类型表达分析来检测结肠肿瘤组织中富集的细胞类型,并进行成药性评估,以探索其作为CRC治疗靶点的潜力。
测序中国 - 结直肠癌,CRC蛋白质标志物 - 2023-10-30
A&R:尿液蛋白质组学和肾脏单细胞转录组学提示白细胞介素16在狼疮肾炎中的作用
与没有系统性红斑狼疮的对照组相比,该研究确定了237个与狼疮性肾炎相关的尿液生物标志物。白细胞介素16 (IL-16)、CD163和转化生长因子β反映了肾内肾炎的活性。
MedSci原创 - 肾脏,蛋白质组学,狼疮肾炎,尿液,资讯,单细胞组学,白细胞介素16 - 2022-05-19
ARD: 干燥综合征患者血液和组织中自身反应性 B 细胞库的蛋白质组学分析
干燥综合征患者的ANA和RF库显示组织受限性的、抗原依赖性和不同的亲和力成熟。RF克隆的亲和力成熟在RF克隆衍生的淋巴瘤形成过程中和在被利妥昔单抗暂时破坏后自身反应库的再生过程中进一步偏离。
MedSci原创 - 蛋白质组学,干燥综合征,类风湿因子,抗Ro52抗体,抗La/SSB抗体,抗Ro60抗体,自身反应性B细胞 - 2022-03-19
Nat Commun:单细胞空间代谢组学分析框架scSpaMet,可对同一组织进行空间分辨蛋白质和代谢物分析
文章提出了单细胞空间分辨代谢框架“scSpaMet”,通过将非靶向空间代谢组学和靶向多重蛋白质成像整合到单一管道中,在单细胞水平上分析人体组织中的免疫细胞和癌症细胞。
测序中国 - 单细胞,空间代谢组学,scSpaMet - 2024-02-03
Blood:定量蛋白质组学揭示AML干细胞的独特代谢特征
高分辨率蛋白质组学可明确与健康的HSPC相比经过功能验证的LSC中活跃的特征性通路和可靶向通路;代谢途径的改变主要表现在蛋白质上,在转录本水平上并不明显,这突出了蛋白质组学分析的优势。
MedSci原创 - 急性髓性白血病,蛋白质组学,白血病干细胞 - 2020-06-22
Stem Cell Res Ther:使用蛋白质组学和基因表达分析定位马间充质基质细胞表面蛋白质组以鉴定特异性标记物
干细胞具有很大的组织再生潜力,但在干细胞群可用于临床之前,干细胞必须具有一组特异性标记物,这一点至关重要。虽然已经尝试鉴定一组免疫表型标志物以表征马间充质基质细胞(MSCs),但由于在不同实验室中高质量和一致性能的合适抗体的有限性,马MSCs的免疫表型分析仍然具有挑战性。本研究旨在评估通过使用生物素富集和质谱(MS)分析绘制马MSCs表面蛋白质组的策略,并挖掘蛋白质组以寻找属于分化蛋白组簇的潜在马
MedSci原创 - 2018-11-12
PLoS One:角膜内皮细胞-基底膜组织的蛋白质组学分析
美国爱荷华大学卡弗医学院眼科和视觉科学的Skeie JM近日在PLoS One发表一项重要工作,他们研究了患各种II型糖尿病患者和健康对照组中角膜内皮细胞层及其基底膜(Descemet膜)的蛋白质组,并通过比较,鉴定了一系列随糖尿病疾病严重程度不同而差异表达的蛋白质,而这些蛋白可能会影响角膜内皮细胞的健康。
MedSci原创 - 角膜内皮细胞,蛋白质组,糖尿病 - 2018-03-14
Cancer Cell | 基于949种人类癌细胞系绘制泛癌蛋白质组图谱,揭示数千种癌症易感性蛋白质生物标志物
该图谱量化了949种人类癌细胞系中的8498种蛋白质,代表28种组织和40多种组织学上不同的癌症类型和广泛的基因型,显著扩展了癌症模型的分子特征。
测序中国 - 标志物,癌细胞系,蛋白质组图谱 - 2022-08-09
Mission Bio推出Tapestri平台对单细胞DNA和蛋白质同时测序,以识别准确的癌症靶标
Mission Bio推出了"第一个也是唯一一个"平台,能够在单个细胞中对DNA和蛋白质进行测序,从而为精密医学识别更准确的癌症靶标。
MedSci原创 - MISSION,Bio,Tapestri平台,单细胞测序,识别癌症靶标 - 2019-11-07
Nat Commun:基于12种癌症类型的多组学数据分析,揭示体细胞结构变异对癌症蛋白质组的影响
研究团队将基于MS的蛋白质组学数据与跨不同癌症类型的WGS、多组学数据相结合,以确定体细胞SV断点模式对附近基因蛋白表达的影响。
测序中国 - 癌症蛋白质组,多组学数据分析 - 2023-10-06
NATURE:SARS-CoV-2宿主细胞的蛋白质组学研究揭示治疗靶点
最近,研究人员确定了被SARS-CoV-2感染所调节的宿主细胞途径,并表明抑制这些途径可以防止病毒在人体细胞中的复制。
MedSci原创 - 新型冠状病毒,药物开发 - 2020-05-15
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