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Nat Commun：基于<font color="red">长</font><font color="red">读</font><font color="red">长</font><font color="red">测序</font>进行癌症和免疫<font color="red">单细胞</font>的综合基因分型

Nat Commun：基于长读长测序进行癌症和免疫单细胞的综合基因分型

研究团队设计了一个灵活的长读长测序工作流程和分析管线，称为nanoranger，该方法从中间单细胞cDNA文库开始，检测细胞谱系定义特征，包括单核苷酸变体、融合基因、异构体、嵌合抗原和TCR序列。

测序中国 - 长读长测序，nanoranger - 2024-02-18

Nat Commun发表人类<font color="red">单细胞</font><font color="red">长</font><font color="red">读</font><font color="red">长</font>全基因组分析新方法，可为<font color="red">单细胞</font>遗传变异提供新见解

Nat Commun发表人类单细胞长读长全基因组分析新方法，可为单细胞遗传变异提供新见解

长读长测序可提高单细胞遗传变异检测的性能，特别是检测单倍型、复杂结构变异和串联重复序列（TR）；并证明从头重建部分人类T细胞基因组是可行的。

测序中国 - 长读长全基因组，单细胞遗传变异 - 2023-09-13

Cell Res：北京大学汤富酬团队开发用于单个<font color="red">细胞</font>内多组学分析的<font color="red">长</font><font color="red">读</font><font color="red">单细胞</font><font color="red">测序</font>方法

Cell Res：北京大学汤富酬团队开发用于单个细胞内多组学分析的长读单细胞测序方法

该研究报道了一种用于单个细胞内多组学分析的长读单细胞测序方法，scNanoCOOL-seq。

iNature - 长读单细胞测序，scNanoCOOL-seq - 2023-09-15

<font color="red">单细胞</font><font color="red">测序</font>的工具

单细胞测序的工具

《梅斯直播课：单细胞测序文献中常用的高级分析》回答问题3

MedSci原创 - 单细胞测序 - 2021-07-12

Genome Res：<font color="red">长</font><font color="red">读</font><font color="red">长</font><font color="red">测序</font>—揭示乳腺癌中的大规模基因组破坏

Genome Res：长读长测序—揭示乳腺癌中的大规模基因组破坏

研究人员认为长读序列是捕获结构变异复杂性的宝贵工具，这对进一步研究和临床应用有着重要意义。

生物探索 - 基因组破坏，癌细胞进化，变异 - 2018-07-22

Genome Biol：ONT、PacBio<font color="red">长</font><font color="red">读</font><font color="red">长</font><font color="red">测序</font>CpG甲基化检测工具的系统比较

Genome Biol：ONT、PacBio长读长测序CpG甲基化检测工具的系统比较

首次对长读长测序的CpG甲基化检测工具进行了系统比较，包括最新的ONT R10.4流动槽化学测序、氧化亚硫酸盐测序（oxBS）以及SMRT测序。

测序中国 - 甲基化，CpG，长读长测序 - 2024-04-17

单个<font color="red">细胞</font>分选方法----<font color="red">单细胞</font><font color="red">测序</font>

单个细胞分选方法----单细胞测序

生物体有成千上万种细胞类型，有多种方法可以从生物体组织中分离出单个的细胞。（主要分为随机和靶向分离两种）

简书 - 单细胞测序 - 2021-02-06

Genome Biology：基于<font color="red">长</font><font color="red">读</font><font color="red">长</font>RNA<font color="red">测序</font>鉴定RNA编辑位点的新算法L-GIREMI

Genome Biology：基于长读长RNA测序鉴定RNA编辑位点的新算法L-GIREMI

研究团队提出了一种无需基因组信息即可在长读长RNA-seq中检测和分析RNA编辑位点的新方法——L-GIREMI。

测序中国 - RNA测序，L-GIREMI - 2023-08-24

Cancer Res：基于<font color="red">长</font><font color="red">读</font><font color="red">长</font><font color="red">测序</font>准确全面检测癌症基因融合事件的新方法：FusionSeeker

Cancer Res：基于长读长测序准确全面检测癌症基因融合事件的新方法：FusionSeeker

基于模拟和三个癌细胞系的数据，该研究证明了FusionSeeker在检测基因融合事件方面优于现有方法。

测序中国 - 癌症，基因测序 - 2022-11-25

Genome Med综述 | <font color="red">长</font><font color="red">读</font><font color="red">长</font><font color="red">测序</font>技术在孟德尔遗传学中的应用及展望

Genome Med综述 | 长读长测序技术在孟德尔遗传学中的应用及展望

该文章总结了当前的LRS技术，概述了其在临床研究和人类健康方面的实用性和优势，并讨论了LRS未来的临床应用。

测序中国 - 长读长测序，孟德尔遗传学 - 2023-07-05

<font color="red">单细胞</font><font color="red">测序</font>应用及技术实例

单细胞测序应用及技术实例

作为“在单个细胞水平上对基因组进行测序”的单细胞测序技术能够解决上述难题。与传统的全基因组测序相比，单细胞测序不仅测量基因表达水平更加精确，而且还能检测到微量的基因表达子或罕见非编码RNA，其优势是全方位和多层次的。与此同时，测序巨头相继推出新一代测序仪，为单细胞测序提供利器，越来越多与单细胞测序有关的研究也发表在顶级期刊上，这些都表明，单细胞测序已逐渐成为科研热点。单细胞测序应用及技术实例单

MedSci原创 - 单细胞测序 - 2017-03-07

Nature：基于<font color="red">长</font><font color="red">读</font><font color="red">长</font><font color="red">测序</font>的等位基因特异性分析揭示人类组织转录组变异

Nature：基于长读长测序的等位基因特异性分析揭示人类组织转录组变异

研究团队开发了一个新的计算软件包LORALS，通过长读长测序等位基因特异性分析来研究罕见和常见变异对转录组的遗传影响，同时描述了等位基因特异性表达和转录本结构事件。

测序中国 - 等位基因，转录组变异 - 2022-08-31

Science：<font color="red">单细胞</font><font color="red">测序</font>细分肿瘤亚型

Science：单细胞测序细分肿瘤亚型

美国麻省总院和Broad研究所合作发表在3月31日Science杂志上对两种脑肿瘤亚型的详细分析显示，它们起源于神经祖细胞的相同类型，由基因突变模式和其微环境的组成分而区分开。

生物探索 - 肿瘤，单细胞测序 - 2017-04-04

单细胞测序的方法和应用

单细胞测序的应用过去二十几年里，随着基因测序技术水平的提高以及千人基因组计划、癌症基因组计划、Meta-Hit计划等重大国际合作项目的相继开展，基因组研究日渐被 推向高潮。然而，迄今为止使用的测序材料无一例外都是数百万甚至更多细胞的混合DNA样本。这种方法能够得到全基因组序列信息，但是对其进行研究得到的结 果只是一群细胞中信号的平均值，或者只代表其中占优势数量的细胞信息，单个细胞独有的特性

MedSci原创 - 单细胞测序 - 2014-04-06

单细胞RNA测序--TargetAmp法、SMART法

TargetAmp法测单细胞全RNA Illumina旗下的EpiCentre公司开发的TargetAmp方法，可以把少量RNA（最少到1个细胞，约10pg）扩增到ng级，以达到可以进行高通量测序所需的核酸量

陈巍学基因 - 单细胞测序，SMART - 2014-04-06

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