Aging:黑色素瘤的新型免疫相关基因预后生物标志物:与肿瘤微环境相关

2020-05-26 网络 网络

黑色素瘤是一种皮肤癌,有可能扩散到其他器官,是导致大部分皮肤癌患者死亡的原因。因此,确定免疫生物标志物对于黑色素瘤的早期诊断和治疗势在必行。

黑色素瘤是一种皮肤癌,有可能扩散到其他器官,是导致大部分皮肤癌患者死亡的原因。因此,确定免疫生物标志物对于黑色素瘤的早期诊断和治疗势在必行。

 

黑色素瘤的基因样本从TCGA和GEO数据库中检索,而免疫相关基因(IRG)则从ImmPort数据库中检索。采用WGCNA、Cox回归分析和LASSO分析对黑色素瘤预后进行分类。ESTIMATE和CIBERSORT算法用于探讨风险评分与肿瘤免疫微环境之间的关系。通过GSEA分析探索生物信号传导途径。

 

在检索到的1039个独特的IRG中,63个免疫相关基因与黑色素瘤的总生存率相关。利用8个IRG构建的多IRG分类器显示出强大的预测能力。与目前的临床数据相比,该分类器具有更好的预测能力。GSEA分析显示,高危组和低危组之间存在多重信号转导差异。此外,生物标志物与肿瘤微环境中的多种免疫细胞和免疫浸润相关。

 

免疫相关基因预后生物标志物在黑色素瘤的免疫治疗和监测中是一个有效的潜在预后分类器。

 

原始出处:

 

Rongzhi Huang, Min Mao, et al., A Novel Immune-Related Genes Prognosis Biomarker for Melanoma: Associated With Tumor Microenvironment. Aging (Albany NY). 2020 Apr 20;12(8):6966-6980. doi: 10.18632/aging.103054. Epub 2020 Apr 20.

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