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【佳作推荐】浙江工业大学张贵军教授小组JCIM论文:基于深度学习的端到端蛋白质<font color="red">结构域</font>组装方法

【佳作推荐】浙江工业大学张贵军教授小组JCIM论文:基于深度学习的端到端蛋白质结构域组装方法

该方法利用深度学习网络,通过注意力机制融合多种特征来预测间相互作用,再将其转换为间刚性运动变换,实现端到端的蛋白结构域组装和多蛋白质预测。

ComputArt计算有乐趣 - 深度学习,端到端蛋白质,多域蛋白质全链 - 2023-11-19

Leuk Res:用溴<font color="red">结构域</font>抑制剂 PLX51107 和阿扎胞苷治疗皮肤白血病患者的主要临床反应

Leuk Res:用溴结构域抑制剂 PLX51107 和阿扎胞苷治疗皮肤白血病患者的主要临床反应

PLX51107 是一种高效口服溴结构域抑制剂,对 BET 家族蛋白的第一个 N 端溴结构域 BD1 具有适度的选择性。一项 1b/2a 期研究评估了单药 PLX51107 在复发/难治性实体瘤和晚期

网络 - 阿扎胞苷,皮肤白血病,溴结构域抑制剂 PLX51107 - 2022-09-14

BioRxiv:单氨基酸分辨率的长链蛋白质单分子纳米孔测序方法可检测完整折叠蛋白<font color="red">结构域</font>

BioRxiv:单氨基酸分辨率的长链蛋白质单分子纳米孔测序方法可检测完整折叠蛋白结构域

研究团队开发了一种新方法,有望利用Oxford Nanopore公司的商用平台实现完整蛋白质链的长距离(long-range)、单分子测序。

测序中国 - 单分子测序,蛋白质链 - 2024-01-09

Diabetes:含有半胱天冬酶招募<font color="red">结构域</font>的细胞凋亡抑制子能够改善类淀粉蛋白诱导的β细胞凋亡和JNK通路的激活

Diabetes:含有半胱天冬酶招募结构域的细胞凋亡抑制子能够改善类淀粉蛋白诱导的β细胞凋亡和JNK通路的激活

含有半胱天冬酶招募结构域的细胞凋亡抑制子(ARC)能够结合到内源和外源细胞凋亡通路的某些组分上从而使该通路失活。最近发现ARC在胰岛β细胞中表达。

MedSci原创 - 细胞凋亡,β细胞,JNK通路 - 2017-07-24

Arthritis Rheumatol:直接结合NLRP3热蛋白<font color="red">结构域</font>是预防NLRP3驱动炎症和痛风性关节炎的新方法

Arthritis Rheumatol:直接结合NLRP3热蛋白结构域是预防NLRP3驱动炎症和痛风性关节炎的新方法

NLR家族含热蛋白结构域蛋白3(NLRP3)炎症小体与多种炎性疾病的病理生理存在密切联系。这项研究旨在识别与NLRP3直接结合的小分子,以建立针对NLRP3相关性疾病的药理学治疗措施。

MedSci原创 - 痛风 关节炎 NLRP3 - 2020-03-16

Nature子刊:上海交通大学吴强团队发现拓扑相关<font color="red">结构域</font>内染色质相互作用和基因调控的新机制

Nature子刊:上海交通大学吴强团队发现拓扑相关结构域内染色质相互作用和基因调控的新机制

该研究数据突出了CTCF TAD边界内外向型CBS元件在发育基因调控中的关键作用,并对TAD边界内聚集CTCF位点的组织原则具有意义。

iNature - 基因调控,拓扑相关结构域,CBS元件 - 2023-12-15

Acta Haematol:血清铁蛋白的阈值可区分低氧诱导因子脯氨酰羟化酶<font color="red">结构域</font>抑制剂治疗期间血小板增加风险较高的患者

Acta Haematol:血清铁蛋白的阈值可区分低氧诱导因子脯氨酰羟化酶结构域抑制剂治疗期间血小板增加风险较高的患者

PLT 的变化与 s-ft 和造血量相关。当从 DA 转换为 Rox 时 s-ft 为 77.2 ng/mL 或更高时,由于铁水平而导致 PLT 增加的可能性较小

MedSci原创 - 血清铁蛋白,低氧诱导因子,脯氨酰羟化酶,血小板增加 - 2022-02-16

J Periodontol:信号调节蛋白激酶/蛋白激酶B-p53-BH3–<font color="red">结构域</font>凋亡诱导蛋白通路调节成骨细胞牙龈素诱导的细胞凋亡

J Periodontol:信号调节蛋白激酶/蛋白激酶B-p53-BH3–结构域凋亡诱导蛋白通路调节成骨细胞牙龈素诱导的细胞凋亡

牙龈素是由牙龈卟啉单胞菌(慢性牙周炎中的主要病原体)产生的半胱氨酸蛋白酶。本研究旨在检测牙龈素在促进成骨细胞凋亡中的作用。

MedSci原创 - 细胞凋亡,慢性牙周炎,成骨细胞,牙龈素,BH3-结构域凋亡诱导蛋白 - 2017-11-12

Sci Rep:肝细胞生长因子激活抑制剂-2的Kunitz<font color="red">结构域</font>I能够抑制蛋白裂解酶活性和人类前列腺癌细胞的侵入能力

Sci Rep:肝细胞生长因子激活抑制剂-2的Kunitz结构域I能够抑制蛋白裂解酶活性和人类前列腺癌细胞的侵入能力

最近,有研究人员进一步鉴定了是否HAI-2是一个蛋白裂解酶的同源抑制剂,并且鉴定了HAI-2的哪一个结构域对抑制蛋白裂解酶和人类前列腺癌细胞运动是需要的。研究发现,HAI-2的超表达能够抑

MedSci原创 - 前列腺癌,运动能力,蛋白裂解酶,抑制 - 2017-11-23

第二代基因测序技术用于成年费城染色体阳性急性淋巴细胞白血病患者BCR‑ABL1激酶<font color="red">结构域</font>突变检测

第二代基因测序技术用于成年费城染色体阳性急性淋巴细胞白血病患者BCR‑ABL1激酶结构域突变检测

在费城染色体阳性的急性淋巴细胞白血病(Ph+ALL)患者中,BCR‑ABL1激酶结构域(KD)点突变是最常见的酪氨酸激酶抑制剂(TKIs)耐药机制。本文主要针对第二代基因测序技术(NGS)在一线TKI

Cancer Med.2020 May;9(9):2960-2970. - 急性淋巴细胞白血病 - 2021-05-05

Blood:在CLL细胞中,FBXW7突变导致NOTCH1降解障碍而异常积累

Blood:在CLL细胞中,FBXW7突变导致NOTCH1降解障碍而异常积累

大约10%的慢性淋巴细胞白血病(CLL)患者携带NOTCH1突变,NOTCH1突变与预后不良相关。但是,NOTCH1激活可见于大概一半的CLL病例,即使没有NOTCH1突变,因此,可能存在其他因素干扰NOTCH1降解。E3泛素化激酶FBXW7负性调控NOTCH1,在2-6%的CLL患者中发生突变。目前这些突变导致的功能性后果尚不明确。Viola Close等人在36/905(4%)位未进行过治疗的

MedSci原创 - CLL,Notch1,WD40结构域,FBXW7 - 2018-12-07

清华大学施一公教授新年第一篇《PNAS》文章

清华大学施一公教授新年第一篇《PNAS》文章

今年1月,这一研究组再次于PNAS发文,通过分析与caspase-9结合的Apaf-1凋亡体结构,以及在Apaf-1凋亡体存在情况下的caspase-9生化活性,进一步解析了Apaf-1的作用机制。

生物通 - 施一公,《PNAS》 - 2017-02-09

【盘点】2019年2月21日Blood研究精选

【盘点】2019年2月21日Blood研究精选

2019年2月21日Blood研究精选

MedSci原创 - Blood - 2019-02-26

CTM:复旦大学黄国英/马端团队发现先天性心脏病新易感基因

CTM:复旦大学黄国英/马端团队发现先天性心脏病新易感基因

通过全外显子组关联分析结合多重 PCR 靶向测序,在大样本散发 CHD 病例中发现 WDR62 具有较高的变异频率;体内外实验证实 WDR62 缺陷通过影响细胞周期和纺锤体组装抑制心肌细胞增殖。

“生物世界”公众号 - 易感基因,先天性心脏病 - 2022-07-10

Nature Metabolism:再取进展!赵家军/薄涛/高聆发现WDR6的上调驱动胰岛素抵抗小鼠肝脏新生脂肪生成

Nature Metabolism:再取进展!赵家军/薄涛/高聆发现WDR6的上调驱动胰岛素抵抗小鼠肝脏新生脂肪生成

该研究发现WD40重复包含蛋白6 (WDR6)在IR期间促进肝脏DNL。

医药加学习班 - 胰岛素抵抗,新生脂肪生成 - 2023-10-03

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