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Nature:钟声课题组创新开发单细胞多组学技术MUSIC,同步分析多重<font color="red">染色质</font>相互作用、基因表达和RNA-<font color="red">染色质</font>关联

Nature:钟声课题组创新开发单细胞多组学技术MUSIC,同步分析多重染色质相互作用、基因表达和RNA-染色质关联

加州大学圣地亚哥分校钟声课题组开发了一种创新的单细胞多组学核酸分析技术MUSIC,可用于同时分析单个细胞核内的多重染色质相互作用、基因表达和RNA-染色质关联。

测序中国 - MUSIC,RNA-染色质 - 2024-04-25

Nature:组<font color="red">蛋白</font>H1缺失破坏<font color="red">染色质</font>3D结构,驱动淋巴瘤发展 

Nature:组蛋白H1缺失破坏染色质3D结构,驱动淋巴瘤发展 

研究人员还确立了H1作为一种真正的肿瘤抑制因子,并表明H1的突变主要通过三维基因组重组驱动恶性转化,从而导致表观遗传学重编程和发育沉默基因的去抑制。

MedSci原创 - 淋巴瘤,基因组 - 2020-12-10

NATURE: 异<font color="red">染色质</font>动态变化影响Rett综合征患者神经发育

NATURE: 异染色质动态变化影响Rett综合征患者神经发育

MeCP2的突变会导致Rett综合征(RTT),这是一种产后进行性神经发育障碍,与严重的精神残疾和自闭症样症状相关,在患病女孩的幼儿期就有表现。

MedSci原创 - 儿童神经发育疾病,Rett综合征,异染色质 - 2020-07-23

Nat Commun:开放<font color="red">染色质</font>分析可帮助找到白血病细胞起源

Nat Commun:开放染色质分析可帮助找到白血病细胞起源

他们使用的这种新方法叫做开放染色质的全基因组分析。相关研究结果发表在国际学术期刊Nature Communication上。

生物谷 - 染色质,白血病细胞 - 2016-07-13

Nature子刊:郑科/倪挺/崔益强利用单细胞测序分析揭示RNA<font color="red">结合</font><font color="red">蛋白</font>DDX43调控精子变形中<font color="red">染色质</font>重塑的动态过程

Nature子刊:郑科/倪挺/崔益强利用单细胞测序分析揭示RNA结合蛋白DDX43调控精子变形中染色质重塑的动态过程

该研究发现了一个在精子变形染色质重塑中发挥重要作用的新基因,也为在单细胞水平上研究RNA结合蛋白如何协同调控细胞动态发育和转录组动态变化提供了新的研究范式。

iNature - 染色质重塑,DDX43 - 2023-05-04

Nat Genet:前列腺癌中LSD1介导的甲基化能够促进FOXA1的<font color="red">染色质</font><font color="red">结合</font>

Nat Genet:前列腺癌中LSD1介导的甲基化能够促进FOXA1的染色质结合

FOXA1作为一个先锋转录因子,能够促进类固醇激素受体与染色质结合,比如雄激素受体和雌激素受体,但是调控这些受体结合染色质的机制仍旧不清楚。

MedSci原创 - 前列腺癌,甲基化,激素受体 - 2020-09-13

Cell子刊:张勇/朱大海/李程研究组合作揭示<font color="red">染色质</font>架构<font color="red">蛋白</font>CTCF参与调控细胞命运的分子机制

Cell子刊:张勇/朱大海/李程研究组合作揭示染色质架构蛋白CTCF参与调控细胞命运的分子机制

研究表明,CTCF与细胞类型特异的先锋转录因子(pioneer transcription factor)协同形成染色质互作枢纽,共同调控谱系特异下游基因的表达,从而决定细胞分化的命运。

测序中国 - CTCF,染色质架构蛋白 - 2023-11-04

Blood:PU.1编码基因所在<font color="red">染色质</font>区域的动态三维结构

Blood:PU.1编码基因所在染色质区域的动态三维结构

中心点:PU.1编码基因的空间染色质结构,在髓系分化过程中动态重构,在AML中被破坏。PU.1自动调节启动空间重构,并招募LDB1来稳定PU.1基因调控DNA元件之间所形成的染色质环。摘要:基因表达的表观遗传调控发生在被称为拓扑关联域(TADs)的离散空间染色体单元内,但大多数基因的精确的空间要求尚未明确;该点对与癌症相关的基因特别有意义。Daniel Schuetzmann等人采用高分辨率的染色

MedSci原创 - PU.1,三维结构,拓扑关联域,LDB1 - 2018-10-14

Nat Methods:利用ATAC-see技术可视化观察易接近的<font color="red">染色质</font>

Nat Methods:利用ATAC-see技术可视化观察易接近的染色质

在有限的细胞核空间中,基因组的大部分是紧密折叠的,仅留下需要转录的部分是易接近的。美国斯坦福大学的Howard Chang说,人们有“巨大的兴趣”来确定一个给定的细胞类型中哪些基因组区域是有活性的。这正是Chang开发一种被称作ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin with highthroughput sequencing, 利

生物谷 - ATAC-see技术 - 2017-01-09

PNAS:通过胞外菌网形成所释放的<font color="red">染色质</font>导致癌症患者血栓

PNAS:通过胞外菌网形成所释放的染色质导致癌症患者血栓

最近一项研究表明染色质通过中性粒细胞形成的胞外菌网释放到血液中是导致凝血和血栓的主要原因。研究人员使用慢性粒细胞性白血病小鼠模型发现,恶性和非恶性嗜中性粒细胞更容易形成胞外菌网。

生物谷 - 癌症,血栓,胞外菌网,染色质 - 2012-07-27

Cell:重磅发现,<font color="red">染色质</font>是一种凝胶,有助于解释癌症的扩散

Cell:重磅发现,染色质是一种凝胶,有助于解释癌症的扩散

文章指出,凝聚的染色质以固体状态存在,其性质可以抵抗外力,并形成弹性凝胶,为染色质结合蛋白的液-液相分离提供支架。由此看来,把染色质看作一种凝胶,可以让我们更准确地理解基因组是如何编码和解码的。

Bio生物世界 - 癌症,染色质,癌症扩散 - 2020-12-31

Sci Rep:从<font color="red">染色质</font>谱分析骨关节炎中异常的增强剂调节

Sci Rep:从染色质谱分析骨关节炎中异常的增强剂调节

由于技术上的困难,在OA中没有报道染色质谱,提供对基因调控的见解。 在这里,我们采用高转录测序(ATAC-seq)检测转座酶可及的染色质,以绘制OA患者关节膝关节软骨中可接近的染色质图谱。我们确定了软骨的109,215个可及的染色质

MedSci原创 - 2018-11-01

cell stem cell:<font color="red">染色质</font>重塑调控着胶质母细胞瘤的耐药性

cell stem cell:染色质重塑调控着胶质母细胞瘤的耐药性

胶质母细胞瘤(GBM)是最为常见的侵袭性脑肿瘤之一,也是星形细胞肿瘤中恶性程度最高的。目前,使用常规方法治疗GBM很难得到令人满意的效果。许多研究显示,胶质瘤干细胞(GSC)及其所处的免疫微环境的抑制状态是胶质母细胞瘤难以治疗的根源。因此,了解调控GSC增殖及耐药的分子机制将有助于为临床治疗找到新的途径。 近期,《cell stem cell》杂志上的相关研究表明当受到靶向激酶抑制剂作用时,

Medical Research - 胶质瘤,可逆性表观遗传转变 - 2017-01-05

Cell | 染色质激活或抑制状态决定了核小体分离的差异性

染色质结构通过促进或抑制该结构的转录可以控制基因组的功能和细胞身份认定。这些染色质结构中存在特定的组蛋白翻译后修饰(posttranslational modifications,PTMs),它们与特定转录状态相关,并可促进抑制性染色体结构的形成,影响基因的表达。为了在细胞分裂时依然保持基因表达程序的完整性,决定染色质结构的分子特征也需要在子代细胞中建立。建立不同类型染色质状态的重要决定因素是

BioArt - 染色质,激活,抑制状态,核小体分离,差异性 - 2019-11-04

染色质免疫沉淀-测序(ChIP-seq):全基因组范围研究蛋白质-DNA相互作用的新技术

 染色质免疫沉淀-测序(ChIP-seq)是近年来新兴的将染色质免疫沉淀(ChIP)与深度测序技术相结 合,在全基因组范围内分析DNA结合蛋白结合位点、组蛋白修饰、核小体定位和DNA甲基化的高通量技术

生物化学与生物物理学进展 - ChIP,seq,染色质免疫沉淀,基因组 - 2014-01-03

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