《自然》子刊：cfDNA噬菌体组可用于鉴定感染新方法！
在这篇文章中，作者描述了一种在cfDNA中鉴定和分析DNA噬菌体序列的方法。将此工作流程应用于从两个独立队列中收集的血浆样本，结果发现噬菌体组通过病原体特异性的过度代表来反映感染。
小桔灯网 - cfDNA噬菌体 - 2023-07-15
肺癌脑转移患者放疗期间cfDNA基因突变检出率如何？脑脊液vs血浆
本研究探索了NSCLC-BM患者RT期间CSF cfDNA的动态变化和外周血T细胞亚群的频率。
苏州绘真医学 - 肺癌，血浆，cfDNA，脑脊液 - 2024-01-15
PNAS：卢煜明/江培勇团队基于末端基序反卷积分析绘制cfDNA片段化图谱
通过对cfDNA的短末端核苷酸序列进行数学分析，发现了六种不同类型的cfDNA片段模式，其中几种模式与核酸酶相关，如DFFB、DNASE1和DNASE1L3。
测序中国 - 细胞游离DNA - 2023-05-18
NEJM：临床研究证实：cfDNA血液检测有助于平均风险人群的结直肠癌筛查
cfDNA血液检测对结直肠癌的敏感性为83%，对晚期肿瘤的特异性为90%，对晚期癌前病变的敏感性为13%。因此，cfDNA血液检测有助于早期发现结直肠癌，并降低结直肠癌相关死亡率。
测序中国 - 结直肠癌，cfDNA血液检测 - 2024-04-02
【盘点】全民测序时代 基因测序到底有什么用？
近两年精准医学的概念逐渐深入人心，这是一种将个人基因、环境与生活习惯差异考虑在内的疾病预防与处置的新兴方法。2015年1月20日，美国总统奥巴马在国情咨文中提出“精准医学计划”，希望精准医学可以引领一个医学新时代。随后习近平总书记批示科技部和国家卫生计生委，要求国家成立中国精准医疗战略专家组，科技部召开国家首次精准医学战略专家会议，并决定在2030年前政府将在
生物谷 - 基因测序，精准医学 - 2016-04-28
Sci Rep：cfDNA与长时间体外循环心脏手术后的内皮损伤相关
这项研究证明在CPB持续时间长的心脏手术患者中，血浆cfDNA升高有助于评估CPB介导的不利影响。
MedSci原创 - 心脏手术，体外循环，内皮损伤，cfDNA - 2017-12-29
大样本结果显示结直肠癌cfDNA与组织样本一致性近乎100％
该研究报道了1397例结直肠癌患者cfDNA的NGS研究结果，总体而言，在cfDNA中检测到的基因
生信者言 - cfDNA，结直肠癌 - 2017-12-03
Science Advances：研究证实cfDNA中含有肿瘤特异性TF结合信息，可利用血浆绘制肿瘤调控图谱
来自美国科罗拉多大学的研究团队绘制了血浆cfDNA中单个结合位点的TF结合图谱，定义了反映不同ER+疾病状态的cfDNA特征。
测序中国 - 肿瘤，转录因子，cfDNA - 2022-09-10
Nat Commun：FinaleMe模型：基于血浆cfDNA片段化模式预测DNA甲基化水平和起源组织状态
研究团队开发了一种名为FinaleMe的计算方法，可预测每个cfDNA片段中每个CpG的DNA甲基化状态，并获得CpG位点的连续DNA甲基化水平；进一步从推断的甲基化模式中预测相关的起源组织状态。
测序中国 - cfDNA，DNA甲基化 - 2024-04-29
PNAS：基于甲基化图谱及深度学习模型，实现cfDNA组织特异性定性及定量研究
研究团队开发了第一个cfDNA监督组织反卷积方法，一个基于深度神经网络(DNN) 的模型cfSort，其可用于敏感和稳健地定量cfDNA中的组织成分。
测序中国 - cfDNA，深度神经网络，甲基化图谱 - 2023-07-25
Cell Reports Medicine：多模态cfDNA基因组和片段组学模式可增强癌症生存率和复发分析
基于全基因组测序，研究团队开发了片段末端综合分析（FrEIA）评分，可使用低覆盖率全基因组测序（WGS）定量评估液体活检样本。
测序中国 - 癌症，cfDNA，液体活检 - 2024-02-06
纳米孔测序仪MinION的首批测序数据公布
美国佛罗里达州的马可岛是基因组测序行业的“麦加”，一年一度的基因组生物学技术进展大会（AGBT 2014）一直在这召开，已超过10年历史。本次峰会的主题是“新仪器带来的潜力技术革新”。Oxford Nanopore自去年11月启动MinION测序仪的早期试用计划以来，人们一直就在翘首盼望着MinION的测序数据，日前有关MinION的首个数据终于在本次峰会上出炉。MinION 测序结果
生物探索 - 纳米孔测序仪MinION，测序数据 - 2014-02-18
Nature：纳米孔测序技术的发明人再发明单分子互作测序
随着技术的发现，大规模并行DNA测序得到了广泛的应用，为许多研究领域带来了一场革命。然而，高通量的蛋白质分析仍然困难重重，现在亟需高质量低成本的蛋白分析技术。为此，遗传学界的大牛George M.Church领导哈佛医学院的团队，开发了一种单分子互作测序（SMI-seq）技术。该技术能够实现单分子水平上的并行分析，获得大量蛋白质的互作图谱。
MedSci原创 - 纳米孔，单分子 - 2014-10-04
2013年测序市场大事盘点
2013年已经过去，在这一年里，药企因为专利悬崖而愁云笼罩，测序市场却因为生意红火而热闹纷呈，多家巨头都有好戏上演：罗氏无奈放手Illumina，关闭454业务，牵手PacBio打造NGS诊断产品;Illumina底气十足收购多家公司，与OxfordNanopore分手，快速进军DNA测序临床应用领域;赛默飞136亿美元重磅收购LifeTech，震动了整个业界;被NatureMethods杂志
生物谷 - 测序，市场，2013 - 2014-01-07
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