Ann Transl Med：分析与肿瘤免疫微环境相关的 m6A 相关特征并预测急性髓性白血病的存活率
2022-09-18 将军的九分裤 MedSci原创
背景：
以前的大多数研究都集中在肿瘤的内在致癌途径上。然而，关于 N6-甲基腺苷 (m6A) 甲基化在肿瘤免疫微环境 (TIME) 中的潜在作用知之甚少。为了更好地诊断和治疗急性髓性白血病 (AML)，一研究团队试图检查 AML 病例中 m6A 调节因子与免疫浸润之间的相关性。同时，构建了一个预后模型来预测AML的存活率。
研究团队从癌症基因组图谱 (TCGA) 数据库中提取数据，包括核糖核酸测序 (RNA-seq) 转录组数据和 AML 患者相应临床特征的数据。确定了两种具有不同临床结果的 m6A 修饰模式，并发现它们之间存在显着关系。同时发现与肿瘤免疫微环境相关的不同 m6A 簇 [免疫细胞类型和使用表达数据 (ESTIMATE) 算法估计恶性肿瘤组织中的 STromal 和免疫细胞] 密切相关。接下来，他们进行了 Lasso（最小绝对收缩和选择算子）Cox 回归，以在 2-m6A 调节器 TCGA 数据集中构建预测模型，以进一步探索 AML 中的 m6A 预后特征，并进行相关性验证。
图1：AML患者与正常个体之间差异表达基因的5个M6A相关标志物。(A) 单因素 Cox 回归分析。(B) AML 中相关差异表达基因的表达。(C) AML 中相关基因的热图。AML，急性髓性白血病。
研究团队通过 AML 中重要 m6A 调节因子的一致聚类确定了 2 个分子亚型（聚类 1 和 2）。Cluster 2与较高的免疫评分和明显的免疫细胞浸润相关，因此Cluster 2患者的预后比Cluster 1患者差（P<0.05）。此外，筛选代表 AML 中独立预后因素的 2 个 m6A 相关特征，以构建预后风险评分模型。团队发现低风险评分患者的免疫评分高于高风险评分患者（P<0.05）。
总的来说，这项研究阐明了 m6A 甲基化在 AML 时间中的重要作用。且研究团队使用与 TIME 相关的 m6A 相关特征构建了一个预后模型，以预测 AML 患者的存活率。与 TIME 相关的 m6A 相关特征的变化不仅反映了疾病进展，而且可能是提高 AML 免疫治疗疗效的有希望的治疗靶点。
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